CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環(huán)狀DNA，這種方法很好地避...

基因編輯定量脫靶檢測(cè):基因編輯定量脫靶檢測(cè),使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯，可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯?dòng)物基因組的特定位點(diǎn)。然而，可能會(huì)出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾，這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定，并破壞正?；虻墓δ?..

先導(dǎo)編輯器：CBE和ABE組合使用可以有效地進(jìn)行4種堿基轉(zhuǎn)換（C→T, G→A, A→G, T→C），而無需產(chǎn)生DSB，然而除了這4種堿基轉(zhuǎn)換，對(duì)另外8種堿基轉(zhuǎn)換（C→A, C→G, G→C, G→T, A→C, A→T, T→A, T→G）以及堿基的插入和缺...

2022年2月下旬，在醫(yī)麥客舉辦的年度盛會(huì)——“蓄力前行，助航新生——2021 CSGCT基因與細(xì)胞zhiliao醫(yī)學(xué)峰會(huì)”期間，唯可生物創(chuàng)始人兼CEO-吳寧博士分享了唯可生物在基因zhiliao賽道針對(duì)安全性展開的技術(shù)服務(wù)，讓在場(chǎng)行業(yè)大咖和觀眾真正領(lǐng)會(huì)到IS...

細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會(huì)改變其生物學(xué)特性，同時(shí)也會(huì)帶來新的安全性風(fēng)險(xiǎn)，如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí)，除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》（試行）中的對(duì)細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品...

對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞，應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來評(píng)估。首先，應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同...

上述建議是基于現(xiàn)有科學(xué)認(rèn)識(shí)，隨著臨床研究和應(yīng)用數(shù)據(jù)的積累，以及對(duì)免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品了解的深入，可能會(huì)對(duì)隨訪時(shí)間的建議進(jìn)行調(diào)整。根據(jù)臨床試驗(yàn)的研究計(jì)劃和持續(xù)時(shí)間，長期隨訪可能作為臨床試驗(yàn)的一部分，或者設(shè)計(jì)為一項(xiàng)單獨(dú)研究，如果對(duì)長期監(jiān)測(cè)有一個(gè)單獨(dú)的研究方案...

通常不需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗(yàn)，但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等，評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，如研究基因組修飾的發(fā)生情況，并檢測(cè)隨后可能發(fā)生...

長期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn)，都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等）有基因組整合潛力，需要通過長期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)；...

CIRCLE-seq原理。細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)方法由于提純的基因組已經(jīng)消化去除了組蛋白，結(jié)構(gòu)較細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)更為松散，理論上容易找到更多的脫靶位點(diǎn)。為捕獲CRISPR在細(xì)胞內(nèi)工作時(shí)真實(shí)發(fā)生的脫靶切割，研究者們也設(shè)計(jì)了一些細(xì)胞內(nèi)的脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法。1) Guide-seq...

CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段，確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序，成本相對(duì)較低，能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)...

使用核酸載體進(jìn)行基因轉(zhuǎn)導(dǎo)或修飾時(shí)，應(yīng)持續(xù)關(guān)注細(xì)胞產(chǎn)品中載體系統(tǒng)的殘留情況，分析外源在基因組中的插入位置、拷貝數(shù)等，監(jiān)控基因編輯用酶的細(xì)胞內(nèi)持續(xù)表達(dá)時(shí)間等，并在受試者給藥后進(jìn)行長期安全性監(jiān)測(cè)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時(shí)，需要進(jìn)一步研究確...

由于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的長期存活及持久性作用，申請(qǐng)人應(yīng)對(duì)臨床試驗(yàn)期間接受zhiliao的所有受試者進(jìn)行適當(dāng)?shù)拈L期隨訪，關(guān)注受試者生存、新發(fā)或繼發(fā)aizheng、ganran、免疫功能變化及遲發(fā)性不良反應(yīng)等安全性風(fēng)險(xiǎn)，以及非臨床或臨床數(shù)據(jù)提示需要關(guān)注的潛...

隨著該領(lǐng)域的成熟和對(duì)風(fēng)險(xiǎn)的更好理解，監(jiān)管機(jī)構(gòu)持續(xù)精簡重復(fù)和繁瑣的監(jiān)督工作。需要建立監(jiān)管框架以減少這些障礙并確保患者安全，同時(shí)促進(jìn)這些復(fù)雜和創(chuàng)新產(chǎn)品的快速開發(fā)。細(xì)胞和基因療法被 FDA 視為創(chuàng)新療法。出于監(jiān)管目的，它們可能更像是一種藥物或血液制品。需要建立一個(gè)能...

一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中，但近年來已發(fā)現(xiàn)載體基因整合到特定基因座中導(dǎo)致的可能性。建議設(shè)計(jì)時(shí)充分考慮重組載體的安全性，關(guān)注目的基因的啟動(dòng)子選擇、給藥劑量、整合區(qū)域等多種相關(guān)因素。建議對(duì)病毒載體進(jìn)行全基因組測(cè)序。另外，也可將病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)目標(biāo)細(xì)胞后，...

在基因工程中，質(zhì)粒的拷貝數(shù)應(yīng)該怎么理解?為什么構(gòu)建載體時(shí)要選擇高拷貝數(shù)的質(zhì)粒載體?把細(xì)胞當(dāng)做工廠，質(zhì)粒就是廠房里的流水線，拷貝數(shù)就流水線的數(shù)量在理想狀態(tài)下，選擇盡量多的流水線，這樣能得到的產(chǎn)品多，這是很自然的選擇實(shí)際上，高拷貝也有它的問題，當(dāng)流水線多到一定程度...

細(xì)胞和基因療法通常儲(chǔ)存在低溫至chaodi溫的溫度下。這些溫度使產(chǎn)品有更長的保質(zhì)期，同時(shí)保持比較大效力。管理這些敏感材料（包括存儲(chǔ)、運(yùn)輸和跟蹤）需要強(qiáng)大且適應(yīng)性強(qiáng)的系統(tǒng)，以確保機(jī)構(gòu)審查所需的安全性、完整性和法規(guī)遵從性。在存儲(chǔ)和處理臨床階段樣品和材料時(shí)，它們的脆...

近幾年，細(xì)胞和基因zhiliao（cell & gene therapy，CGT）領(lǐng)域發(fā)展迅猛，在多個(gè)方向取得了重大突破，以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤，多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhi...

質(zhì)粒載體的分類：按復(fù)制形式：分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少，可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型：嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制，拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...

基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會(huì)引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括：基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會(huì)采用修飾宿主基因組的技術(shù)，并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會(huì)指向基因組的特定位點(diǎn)，可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入突...

當(dāng)載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險(xiǎn)特征增加時(shí)，例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)粒或改變給yaofang式以提高整合能力等，需要提高對(duì)長期隨訪觀察的要求；反之，也可以對(duì)目前認(rèn)為存在遲發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的基因zhiliao載體進(jìn)行修飾，以降低這些風(fēng)險(xiǎn)。長期表達(dá)，與其...

免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量描述，很多免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的細(xì)胞組成并非均一，往往包含多種類型的細(xì)胞，起主要zhiliao作用的可能是其中一種細(xì)胞類型，但不良反應(yīng)可能受同一產(chǎn)品中其它類型細(xì)胞的影響。在描述免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量時(shí)，需要考慮產(chǎn)...

在國家藥典委員會(huì)公布的《人用基因制品總論》（草案）的3.1條款中，特別指出：“應(yīng)檢測(cè)重組載體基因組或質(zhì)粒的完整性和均一性，載體和zhiliao序列的遺傳穩(wěn)定性”；“對(duì)于病毒載體，適當(dāng)情況下應(yīng)測(cè)定插入位點(diǎn)，并充分評(píng)估插入突變的可能性和相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)”。對(duì)此，可分別采用...

物流：夠低溫嗎？CGT 供應(yīng)鏈本質(zhì)上是以患者為中心的，因?yàn)榛颊呒瓤梢允侵圃斓纳嫌我部梢允窍掠巍Ｍㄟ^自體療法，從體內(nèi)提取細(xì)胞，進(jìn)行操作，然后將其注射回同一位患者體內(nèi)，從而創(chuàng)建了一個(gè)被稱為“靜脈到靜脈”的供應(yīng)鏈。一個(gè)完美的 CGT 供應(yīng)鏈需要從頭到尾進(jìn)行嚴(yán)格的流程...

拷貝數(shù)，對(duì)于質(zhì)粒載體，拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實(shí)際上，每個(gè)細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì)，可以把質(zhì)粒分為兩類：嚴(yán)緊型質(zhì)粒：當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時(shí)，質(zhì)粒也復(fù)制一次，每個(gè)細(xì)菌內(nèi)只含1～2個(gè)質(zhì)粒；松弛型質(zhì)粒：當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后...

通常不需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗(yàn)，但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等，評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，如研究基因組修飾的發(fā)生情況，并檢測(cè)隨后可能發(fā)生...

免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量描述，很多免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的細(xì)胞組成并非均一，往往包含多種類型的細(xì)胞，起主要zhiliao作用的可能是其中一種細(xì)胞類型，但不良反應(yīng)可能受同一產(chǎn)品中其它類型細(xì)胞的影響。在描述免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量時(shí)，需要考慮產(chǎn)...

R-loop seq雖然不是一種真正意義上的脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法，但能為堿基編輯脫氨酶的脫靶提供一種度量方法，以便于之后的脫氨酶點(diǎn)突變優(yōu)化，來降低脫靶的發(fā)生幾率。2) Detect-seqCRISPR衍生技術(shù)由于其復(fù)雜性，檢測(cè)其脫靶位點(diǎn)的hexin思路是捕獲實(shí)驗(yàn)過...

從基礎(chǔ)設(shè)施的角度來看，必須盡一切努力增加存儲(chǔ)單元內(nèi)溫度的安全性和穩(wěn)定性。例如，液氮（LN2）罐，無論是自動(dòng)的還是手動(dòng)的，都應(yīng)通過真空絕緣管道進(jìn)料，以確保在需要時(shí)立即輸送 LN2。風(fēng)險(xiǎn)應(yīng)對(duì)計(jì)劃也同樣需要，包括備用 LN2 供應(yīng)、待命的工作人員和資格認(rèn)證服務(wù)。監(jiān)管...

拷貝數(shù)，是指某基因（可以是質(zhì)粒）在某一生物的基因組中的個(gè)數(shù)。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個(gè)，多拷貝則指有多個(gè)。在細(xì)菌細(xì)胞中，根據(jù)復(fù)制特性，質(zhì)粒分嚴(yán)緊型和松弛型兩類，前者在細(xì)胞中只含1?2個(gè)，而后者含10?15個(gè)以上。恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、宿...