在細(xì)菌細(xì)胞中,某種特定基因的數(shù)目。一般檢測(cè)方法有若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...
f如果RCT設(shè)計(jì)不可行,申請(qǐng)人可能在確證性臨床試驗(yàn)中采用單臂試驗(yàn)(singlearmtrial,SAT)。在這種情況下,申請(qǐng)人應(yīng)解釋無(wú)法開展RCT試驗(yàn)的理由并提供相應(yīng)研究證據(jù),并有必要利用回顧性數(shù)據(jù)、前瞻性真實(shí)世界研究、薈萃分析或流行病學(xué)調(diào)查等數(shù)據(jù)及探索性研究...
Cas9蛋白是一種切割外來(lái)DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個(gè)RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個(gè)稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個(gè)RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進(jìn)行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個(gè)核苷酸互補(bǔ)的。...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測(cè)20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患...
載體拷貝數(shù)一般檢測(cè)方法有:若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相D...
CIRCLE-Seq,將gDNA打斷并環(huán)化,環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育,NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段,確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序,成本相對(duì)較低,能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估,安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)...
致瘤性的風(fēng)險(xiǎn):考慮產(chǎn)品特征,所使用整合性載體(如逆與產(chǎn)品的儲(chǔ)存、運(yùn)輸和分配有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如保存、冷凍和解凍過(guò)程)、冷鏈或其他類型受控溫度條件被突破的風(fēng)險(xiǎn)、與產(chǎn)品穩(wěn)定性有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn),這可能會(huì)影響CAR-T細(xì)胞的生物學(xué)活性進(jìn)而導(dǎo)致治療失敗。與產(chǎn)品活性相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)與產(chǎn)品活...
不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮1.關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長(zhǎng)期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao...
CAR-T慢病毒載體整合的潛在安全性隱患包括CAR-Tzhiliao在內(nèi)的基因編輯性細(xì)胞zhiliao方法,采用慢病毒整合性載體將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中,某些插入位置可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。因載體整合導(dǎo)致致...
利用ddPCR檢測(cè)溶液中空載體的濃度和整合到T細(xì)胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測(cè)到的平均每個(gè)細(xì)胞的載體拷貝數(shù)與流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)到的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明,ddPCR明顯更精確,測(cè)量...
當(dāng)載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險(xiǎn)特征增加時(shí),例如經(jīng)過(guò)修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)粒或改變給yaofang式以提高整合能力等,需要提高對(duì)長(zhǎng)期隨訪觀察的要求;反之,也可以對(duì)目前認(rèn)為存在遲發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的基因zhiliao載體進(jìn)行修飾,以降低這些風(fēng)險(xiǎn)。長(zhǎng)期表達(dá),與其...
關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長(zhǎng)期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險(xiǎn),建議申辦方分析基因...
?如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽(yáng)性細(xì)胞的克隆性生長(zhǎng),或檢測(cè)發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近,應(yīng)縮短檢測(cè)間隔至不超過(guò)3個(gè)月并密切監(jiān)測(cè)惡性liu征兆,直至檢測(cè)不到基因zhiliao載體。?對(duì)基于慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的基因zhiliao產(chǎn)品,如出現(xiàn)與可復(fù)制xingb...
長(zhǎng)期表達(dá)。與其他產(chǎn)品相比,部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細(xì)胞或基因修飾細(xì)胞中持續(xù)存在并編碼表達(dá)作用因子(功能性蛋白或基因表達(dá)調(diào)節(jié)元件),并通過(guò)長(zhǎng)久或長(zhǎng)期改變靶細(xì)胞或組織的功能來(lái)達(dá)到zhiliao效果。同時(shí),由于基因zhiliao編碼的作用因...
在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中,1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過(guò)CAR-T細(xì)胞zhiliao。CAR-T細(xì)胞zhiliao后,16例患者發(fā)生CRS,其中3例為高級(jí)別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級(jí)高。CAR-T細(xì)胞拷貝的峰值水平...
免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)水平與多種因素有關(guān),如細(xì)胞來(lái)源和類型、體內(nèi)活性和存活時(shí)間、是否有外源基因表達(dá)、基因表達(dá)使用的載體類型以及是否存在基因組整合等。針對(duì)不同風(fēng)險(xiǎn)水平的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,隨訪持續(xù)時(shí)間的建議如下:?對(duì)于沒有外源基因表達(dá)、且體外操...
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會(huì)引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括:基因組整合活性?;騴hiliao產(chǎn)品可能會(huì)采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會(huì)指向基因組的特定位點(diǎn),可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入...
長(zhǎng)期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn),都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基因組整合潛力,需要通過(guò)長(zhǎng)期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn);...
病人在6個(gè)月后達(dá)到MRD陰性,CAR-T細(xì)胞在4.2年后仍然可以在外周血檢測(cè)到,并且骨髓中檢測(cè)不到B細(xì)胞liu克隆。二代測(cè)序整合位點(diǎn)分析顯示這是因?yàn)槟承〤AR-T細(xì)胞的融合位置位于TET2基因9號(hào)到10號(hào)外顯子之間可變剪切區(qū)域,導(dǎo)致TET2基因跳讀和功能障礙,...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測(cè)20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患...
CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn),不論哪種CRISPR系統(tǒng),都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象,CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過(guò)10年,期間迅速取代TALEN和ZFN,...
基因編輯產(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。以上長(zhǎng)期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型,具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期...
病人在6個(gè)月后達(dá)到MRD陰性,CAR-T細(xì)胞在4.2年后仍然可以在外周血檢測(cè)到,并且骨髓中檢測(cè)不到B細(xì)胞liu克隆。二代測(cè)序整合位點(diǎn)分析顯示這是因?yàn)槟承〤AR-T細(xì)胞的融合位置位于TET2基因9號(hào)到10號(hào)外顯子之間可變剪切區(qū)域,導(dǎo)致TET2基因跳讀和功能障礙,...
長(zhǎng)期隨訪的觀察時(shí)間長(zhǎng)期隨訪的持續(xù)時(shí)間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況(生物分布和給藥途徑)等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。一般而言,針對(duì)不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下:?具有基因組整合活性的載體(例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病...
當(dāng)產(chǎn)品預(yù)期的活性成分可以明確時(shí),申請(qǐng)人往往選擇較能代預(yù)期活性的特定細(xì)胞亞群來(lái)描述產(chǎn)品劑量,例如,很多導(dǎo)入外源基因的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品中的載體陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)。在這種情況下,申請(qǐng)人還應(yīng)描述載體陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)與其它細(xì)胞成分的比例,并分析轉(zhuǎn)導(dǎo)效率對(duì)患者安全性及有效性的...
采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對(duì)于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品,應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評(píng)估,以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對(duì)靶基因序列的特異性。在評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)時(shí),應(yīng)說(shuō)明所選擇的評(píng)價(jià)策略的合理性和敏感性。雖然采用計(jì)算機(jī)分析預(yù)測(cè)基因編輯的潛在脫靶...
CAR-T,全稱是ChimericAntigenReceptorT-CellImmunotherapy,指的是嵌合抗原受體T細(xì)胞免疫療法。通過(guò)基因轉(zhuǎn)導(dǎo)方法轉(zhuǎn)染T淋巴細(xì)胞,賦予T細(xì)胞liu靶向性、更強(qiáng)的殺傷活性和持久的殺傷力。從而使其能特異性地識(shí)別和高效殺傷**...
ddPCR與qPCR在監(jiān)測(cè)CART細(xì)胞拷貝數(shù)靈敏度比較,CAR-T細(xì)胞免疫zhiliao發(fā)展迅速,CAR-T細(xì)胞zhiliao后的動(dòng)力學(xué)監(jiān)測(cè)對(duì)患者隨訪至關(guān)重要,對(duì)指導(dǎo)接受CAR - T細(xì)胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前,CAR - T細(xì)胞產(chǎn)品...
不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來(lái)了非常高的回報(bào),也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn),這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測(cè),一個(gè)項(xiàng)目中只使用一...