深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-04-11

GUIDE-Seq脫靶評估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作,為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢:實(shí)用性強(qiáng):能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況,以進(jìn)行安全性和有效性評價(jià);檢測通量高:一次能檢測多個(gè)樣本的在靶與脫靶情況,并通過優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì),降低實(shí)際的測序reads數(shù)量;準(zhǔn)確性高:絕大部分檢測結(jié)果可被驗(yàn)證;靈敏度高:能夠高效檢測出低頻脫靶位點(diǎn),檢測低至0.1%的脫靶突變;實(shí)驗(yàn)難度低:操作過程簡單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。如何檢測是否發(fā)生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)

深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn),脫靶檢測

細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性,同時(shí)也會帶來新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí),除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外,還應(yīng)具體問題具體分析,基于產(chǎn)品特點(diǎn)和目前已有的科學(xué)認(rèn)知,結(jié)合擬定適應(yīng)癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮,科學(xué)合理的設(shè)計(jì)和實(shí)施非臨床研究,充分表征產(chǎn)品的藥理學(xué)、毒理學(xué)和藥代動力學(xué)特征。在進(jìn)行獲益風(fēng)險(xiǎn)評估時(shí),還應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注由非臨床向臨床過渡時(shí)非臨床研究的局限性和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測的不確定性。連云港基因療法脫靶檢測安評預(yù)算允許的情況下,通過全基因組測序的方法進(jìn)行全基因組序列的分析和比對更精細(xì),如基于NGS的iGUIDE方法。

深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn),脫靶檢測

自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對整個(gè)行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來,基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。”

CRISPR/Cas系統(tǒng)是細(xì)菌和古細(xì)菌在不斷進(jìn)化的過程中產(chǎn)生的適應(yīng)性免疫防御機(jī)制,它應(yīng)用CRISPR RNA(crRNA)以堿基互補(bǔ)的形式引導(dǎo)相應(yīng)的Cas蛋白識別入侵的外源基因組,并對其DNA進(jìn)行剪切,用以保護(hù)自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經(jīng)過人為改造后,可在真核細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)高度靈活且特異的基因組編輯,通過設(shè)計(jì)特異性向?qū)NA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進(jìn)行堿基配對,從而引導(dǎo)Cas蛋白結(jié)合到靶序列處,行使DNA切割功能,然后利用細(xì)胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homologous recombination,HR)修復(fù)機(jī)制對斷裂的DNA進(jìn)行插入缺失(Indel)、修復(fù)(Repair)或替換(Replacement)。由于其相對于鋅指核酸酶(ZFNs)和轉(zhuǎn)錄jihuo因子樣效應(yīng)物核酸酶(TALENs)技術(shù)更易于操作,而且更高效,因而被廣運(yùn)用于對基因組特定位點(diǎn)進(jìn)行靶向編輯。針對已經(jīng)獲得的有切割能力的sgRNA,需要進(jìn)一步明確其體內(nèi)脫靶效應(yīng)。

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由于設(shè)計(jì)的sgRNA會與非靶點(diǎn)DNA序列錯配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點(diǎn)再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。脫靶檢測在揭示CRISPR/Cas9系統(tǒng)的脫靶機(jī)制以及進(jìn)一步提高系統(tǒng)靶向性的研究中具有重要作用。臺州off-target脫靶檢測政策

脫靶檢測政策,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)

以上長期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型,具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時(shí)間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累,研究者和研究申辦方可能會根據(jù)產(chǎn)品的存在情況、轉(zhuǎn)基因表達(dá)和臨床表現(xiàn)的持續(xù)評估情況,延長或縮短長期隨訪的持續(xù)時(shí)間。如果研究申辦方認(rèn)為其基因zhiliao產(chǎn)品安全性風(fēng)險(xiǎn)較低、無需開展長期隨訪臨床研究,或者希望變更隨訪時(shí)間,應(yīng)合理說明依據(jù)或變更理由并與藥品監(jiān)督管理部門進(jìn)行溝通。深圳脫靶檢測評估標(biāo)準(zhǔn)

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