浙江基因療法脫靶檢測(cè)guide-sequence

CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn)，不論哪種CRISPR系統(tǒng)，都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象，CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過(guò)10年，期間迅速取代TALEN和ZFN，成為學(xué)術(shù)界通用的基因編輯技術(shù)，也徹底改變了我們的生物學(xué)研究方法。為提高CRISPR技術(shù)的安全性，特別是往臨床應(yīng)用發(fā)展時(shí)的安全性問(wèn)題，研究者們一直以提高靶位點(diǎn)的編輯效率和準(zhǔn)確性，同時(shí)降低脫靶位點(diǎn)編輯發(fā)生概率為目標(biāo)，來(lái)優(yōu)化CRISPR技術(shù)。另一方面，研究者們也開(kāi)發(fā)了大量檢測(cè)方法，用于檢測(cè)CRISPR的靶向風(fēng)險(xiǎn)和脫靶風(fēng)險(xiǎn)，用于早期sgRNA序列的篩選，以期望獲得一個(gè)較為安全的sgRNA。定量脫靶檢測(cè)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。浙江基因療法脫靶檢測(cè)guide-sequence

由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配，引入非預(yù)期的基因突變，即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性，這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此，研究者希望能開(kāi)發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中，有一種方法為GUIDE-seq，其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸（dsODN）標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂，然后對(duì)標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序，通過(guò)生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)CRISPR脫靶效應(yīng)，從而改變了以往先預(yù)測(cè)假定脫靶位點(diǎn)再檢測(cè)的思路；與其他的評(píng)估方法相比，GUIDE-seq更精確、更靈敏。連云港crispr脫靶檢測(cè)評(píng)估如何檢測(cè)是否發(fā)生脫靶？

細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會(huì)改變其生物學(xué)特性，同時(shí)也會(huì)帶來(lái)新的安全性風(fēng)險(xiǎn)，如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時(shí)，除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則》（試行）中的對(duì)細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外，還應(yīng)具體問(wèn)題具體分析，基于產(chǎn)品特點(diǎn)和目前已有的科學(xué)認(rèn)知，結(jié)合擬定適應(yīng)癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮，科學(xué)合理的設(shè)計(jì)和實(shí)施非臨床研究，充分表征產(chǎn)品的藥理學(xué)、毒理學(xué)和藥代動(dòng)力學(xué)特征。在進(jìn)行獲益風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估時(shí)，還應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注由非臨床向臨床過(guò)渡時(shí)非臨床研究的局限性和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)的不確定性。

GUIDE-Seq脫靶評(píng)估技術(shù)的優(yōu)勢(shì)分析鼓潤(rùn)致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測(cè)工作，為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標(biāo)準(zhǔn)化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢(shì)：實(shí)用性強(qiáng)：能反映CRISPR在真核細(xì)胞中進(jìn)行基因編輯的在靶與脫靶情況，以進(jìn)行安全性和有效性評(píng)價(jià)；檢測(cè)通量高：一次能檢測(cè)多個(gè)樣本的在靶與脫靶情況，并通過(guò)優(yōu)化的標(biāo)簽設(shè)計(jì)，降低實(shí)際的測(cè)序reads數(shù)量；準(zhǔn)確性高：絕大部分檢測(cè)結(jié)果可被驗(yàn)證；靈敏度高：能夠高效檢測(cè)出低頻脫靶位點(diǎn)，檢測(cè)低至0.1%的脫靶突變；實(shí)驗(yàn)難度低：操作過(guò)程簡(jiǎn)單易行細(xì)胞適應(yīng)性強(qiáng)。脫靶檢測(cè)安評(píng)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。

Cas9蛋白是一種切割外來(lái)DNA的酶，像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個(gè)RNA分子結(jié)合：crRNA和另一個(gè)稱為tracrRNA（或“反式j(luò)ihuocrRNA”）。這兩個(gè)RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進(jìn)行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個(gè)核苷酸互補(bǔ)的。CRISPR技術(shù)是從細(xì)菌和古細(xì)菌的自然防御機(jī)制中改編而來(lái)的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白，包括Cas9，來(lái)阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過(guò)切碎和破壞外來(lái)入侵者的DNA來(lái)做到這一點(diǎn)。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時(shí)，它允許對(duì)基因進(jìn)行操縱，或“編輯”。脫靶檢測(cè)安全性評(píng)價(jià)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。深圳off-target脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)

脫靶(off-target)效應(yīng)是指MicroRNA Agomir/Antagomir可以與特異性互補(bǔ)的核苷酸序列結(jié)合。浙江基因療法脫靶檢測(cè)guide-sequence

BLESS：利用生物素標(biāo)簽對(duì)DSBs進(jìn)行原位標(biāo)記，后經(jīng)PCR擴(kuò)增實(shí)現(xiàn)對(duì)于生物素標(biāo)記片段的富集，并通過(guò)二代測(cè)序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點(diǎn)檢測(cè)。直接檢測(cè)細(xì)胞中的切割位點(diǎn)，靈敏度與細(xì)胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過(guò)LAM-PCR引入接頭，然后進(jìn)行全基因組易位測(cè)序。高通量的全基因組范圍檢測(cè)，可準(zhǔn)確檢測(cè)DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN    s標(biāo)簽整合到DSBs位點(diǎn)，通過(guò)二代測(cè)序檢測(cè)這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)方法。能檢測(cè)低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進(jìn)行全基因組測(cè)序檢測(cè)脫靶。全基因組測(cè)序，直接檢測(cè)切割位點(diǎn)，能檢測(cè)低頻脫靶突變。浙江基因療法脫靶檢測(cè)guide-sequence

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