LC-MS/MS非靶向脂質組學

來源: 發(fā)布時間:2022-04-15

代謝組學有哪些應用?近年來,代謝組學技術得到了迅速發(fā)展,主要可應用于:功能基因組學、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學、微生物代謝組學、營養(yǎng)學、環(huán)境科學等生命科學的各個領域。為什么要選擇代謝組學?首先需要明確的是代謝組學的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖、有機酸、脂質、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關注的是小分子物質,那么采用代謝組學的方法,可以對樣品內檢測到的小分子物質進行定性、定量分析。同于基因組學和蛋白組學,代謝組學的研究反映某一時刻下正在發(fā)生的生命活動情況,研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關系,能夠幫助尋找新的生物標記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑,應用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。LC-MS/MS非靶向脂質組學

代謝組學樣本收集植物組織:果實、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個果實進行提取的(整粒葡萄等),需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。LC-MS/MS非靶向脂質組學代謝組學在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。

LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢有什么?1、定性分析結果可靠,可以同時給出每一個組分的分子量和豐富的結構信息;2、檢測限低,MS具備高靈敏度,通過選擇離子檢測(SIM)方式,其檢測能力還可以提高一個數(shù)量級以上;3、分析時間快,HPLC-MS使用的液相色譜柱為窄徑柱,縮短了分析時間,提高了分離效果;4、自動化程度高,HPLC-MS具有高度的自動化。關于質譜,根據(jù)質譜的工作原理,質譜又分成了雙聚焦質譜儀,四極桿質譜儀,飛行時間質譜儀,離子阱質譜儀,傅立葉變換質譜儀等不同種類。而在實驗時,我們可以根據(jù)不同需要適當調整儀器組和以及儀器附件。

代謝組學樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學技術可應用于功能基因組學。

代謝組學在系統(tǒng)生物學中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質。代謝組學本質上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎,高通量檢測為手段,通過研究生物體內代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學的分支學科之一。其研究內容主要包括對代謝物進行定性或定量分析,不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究,不同生長環(huán)境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產(chǎn)物的應答,進行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡解析與轉基因評價。代謝組學效仿了基因組學和蛋白質組學的研究思想。LC-MS/MS非靶向脂質組學

代謝組學在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。LC-MS/MS非靶向脂質組學

代謝組學是什么?代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發(fā)展起來的一門學科,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從和蛋白質層面探尋生命的活動,而實際上細胞內許多生命活動是與代謝物相關的,如細胞信號(cell signaling),能量傳遞等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝組(metabolome)——在某一時刻細胞內所有代謝物的組合——的一門學科?;蚺c蛋白質的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環(huán)境,這又與細胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為,基因組學和蛋白質組學能夠說明可能發(fā)生的事件,而代謝組學則反映確實已經(jīng)發(fā)生了的事情。LC-MS/MS非靶向脂質組學