江西蛋白組學

蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學研究案例：2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。研究機構,提供蛋白組學聯(lián)合分析,技術咨詢服務。江西蛋白組學

采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析，共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析，結果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中，198個（32%）和198個（26%）蛋白質豐度增加，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個蛋白質的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。江西蛋白組學服務蛋白組學檢測一個樣多少錢。

蛋白質是生命活動的主要執(zhí)行者，而蛋白質磷酸化修飾是生物體內**重要的共價修飾方式之一，真核生物體內有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質組學只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化，而[黃金搭檔]——蛋白質組與磷酸化蛋白質組聯(lián)合分析，則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。

通過蛋白質組學分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達的功能基因，包括與炎癥、細胞增殖、免疫調節(jié)和血管生成相關的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標記基因的上調與炎癥因子IL3RA有關，增殖相關蛋白CD40和免疫調節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進人腦微血管內皮細胞的血管生成能力，因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關基因的表達。蛋白質印跡結果顯示血管生成相關基因FlK1和ANGPT1的表達明顯增強(圖2I)。綜上所述，結果證實了M-Exos誘導了人腦微血管內皮細胞的功能改變。靶向蛋白質組學，信號通路蛋白靶點高通量分析。

本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關鍵候選基因和蛋白質的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題：基于iTRAQ蛋白質組學和轉錄組學聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質相關的關鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學園藝園林學院運用生物技術：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持走近蛋白組學之蛋白組學常見問題答疑解惑。遼寧蛋白組學 價格 大概多少錢

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采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個下調，1548個上調），560個基因（430個下調，130個上調）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個（約占總鑒定蛋白質的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質發(fā)生***變化（109個上調，121個下調），AL處理有211個蛋白質發(fā)生***變化（116個上調，95個下調）。江西蛋白組學

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