臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),需要開(kāi)展長(zhǎng)期隨訪觀察時(shí),所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書(shū)后均應(yīng)入組長(zhǎng)期隨訪臨床研究。在設(shè)計(jì)長(zhǎng)期隨訪臨床研究的方案時(shí),應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對(duì)遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來(lái)說(shuō),當(dāng)臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時(shí),會(huì)影響長(zhǎng)期隨訪觀察在評(píng)估和減輕受試者風(fēng)險(xiǎn)方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過(guò)長(zhǎng)期隨訪觀察收集到的評(píng)估數(shù)據(jù)可能更容易分析。隨著脫靶影響因素、降低策略及脫靶檢測(cè)技術(shù)研究的不斷深入,未來(lái)CRISPR/Cas9系統(tǒng)將在更多領(lǐng)域造福人類。寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)報(bào)告
近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個(gè)方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見(jiàn)病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進(jìn)展迅速,較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市(CRISPR Therapeutics CTX001),體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯(cuò)的臨床數(shù)據(jù)(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細(xì)胞療法發(fā)展的一大趨勢(shì)(Caribou Biosciences CB-010)。南京定量脫靶檢測(cè)報(bào)告種子基因脫靶檢測(cè)機(jī)構(gòu)推薦唯可。
CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問(wèn)題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段,然后首尾相連成環(huán)狀DNA,這種方法很好地避免了DNA隨機(jī)斷裂造成的背景噪聲。實(shí)驗(yàn)的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA,再連上接頭并進(jìn)行雙端測(cè)序,這樣就可以在一次測(cè)序中同時(shí)獲取切割位點(diǎn)的兩側(cè)序列,彌補(bǔ)了SITE-seq的另一個(gè)缺點(diǎn)。CIRCLE-seq從總體上來(lái)說(shuō)要優(yōu)于SITE-seq,但是將基因組DNA隨機(jī)打斷后成環(huán)的效率并不高,所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq,用Tn5一步法打斷基因組并加接頭,提高了成環(huán)效率,降低了起始基因組DNA的用量。
CRISPR/Cas9的問(wèn)題:和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣,CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時(shí)也存在一定概率的脫靶問(wèn)題——Cas9核酸酶在非目標(biāo)位點(diǎn)發(fā)生切割,引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會(huì)直接破壞細(xì)胞的基本功能,帶來(lái)不可預(yù)控的嚴(yán)重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)?gRNA的GC含量:gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對(duì)CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性,因?yàn)檩^高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA:RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對(duì)編輯有影響,位于四個(gè)核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥(niǎo)嘌呤優(yōu)先選擇在gRNA的20位,胞嘧啶優(yōu)先選擇在16位以增加靶向編輯。脫靶檢測(cè)技術(shù),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對(duì)于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品,應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評(píng)估,以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對(duì)靶基因序列的特異性。在評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)時(shí),應(yīng)說(shuō)明所選擇的評(píng)價(jià)策略的合理性和敏感性。雖然采用計(jì)算機(jī)分析預(yù)測(cè)基因編輯的潛在脫靶位點(diǎn),并對(duì)潛在脫靶位點(diǎn)進(jìn)行深度測(cè)序分析,可用于評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn);但選擇的評(píng)價(jià)策略仍應(yīng)包含體外全基因組測(cè)序比對(duì),以證明潛在脫靶位點(diǎn)未出現(xiàn)脫靶。此外,在評(píng)估脫靶活性時(shí),還應(yīng)評(píng)估種屬特異性的差異、細(xì)胞病理生理狀態(tài)的差異或細(xì)胞類型的差異對(duì)非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)性的影響。必要時(shí),還應(yīng)分析基因編輯對(duì)細(xì)胞表型和生理功能的潛在影響。脫靶檢測(cè)簡(jiǎn)單有效的方法之一是全基因組測(cè)序法。深圳crispr/cas9脫靶檢測(cè)guide-sequence
如何檢測(cè)是否發(fā)生脫靶?寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)報(bào)告
持續(xù)ganran,有復(fù)制能力的病毒或細(xì)菌載體基因zhiliao產(chǎn)品,有可能在免疫能力低下的患者中發(fā)展為持續(xù)ganran,進(jìn)一步增加發(fā)生遲發(fā)但嚴(yán)重ganran的風(fēng)險(xiǎn)?;蚓庉嫽钚?,基因編輯等新型基因zhiliao產(chǎn)品有獨(dú)特的基因組修飾功能,可誘導(dǎo)人類基因組中的位點(diǎn)特異性改變或修飾,同時(shí)也可能在基因組中發(fā)生脫靶效應(yīng),導(dǎo)致非預(yù)期的基因表達(dá)變化,進(jìn)而增加未知且不可預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)。非預(yù)期的生物分布,某些基因zhiliao產(chǎn)品需要在特定的細(xì)胞或組織中表達(dá)以實(shí)現(xiàn)zhiliao目的,如果基因zhiliao產(chǎn)品在非預(yù)期的細(xì)胞、組織或qiguan中表達(dá)或修飾,可能引起非靶細(xì)胞功能、生長(zhǎng)或/分化改變,甚至引發(fā)liu。寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)報(bào)告
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