off-target脫靶檢測(cè)報(bào)告

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-04-16

通常不需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗(yàn),但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等,評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發(fā)生情況,并檢測(cè)隨后可能發(fā)生的異常細(xì)胞行為;評(píng)估插入突變(插入位點(diǎn)、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時(shí),需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點(diǎn)。脫靶檢測(cè)安全性評(píng)價(jià),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。off-target脫靶檢測(cè)報(bào)告

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持續(xù)ganran,有復(fù)制能力的病毒或細(xì)菌載體基因zhiliao產(chǎn)品,有可能在免疫能力低下的患者中發(fā)展為持續(xù)ganran,進(jìn)一步增加發(fā)生遲發(fā)但嚴(yán)重ganran的風(fēng)險(xiǎn)?;蚓庉嫽钚裕蚓庉嫷刃滦突騴hiliao產(chǎn)品有獨(dú)特的基因組修飾功能,可誘導(dǎo)人類基因組中的位點(diǎn)特異性改變或修飾,同時(shí)也可能在基因組中發(fā)生脫靶效應(yīng),導(dǎo)致非預(yù)期的基因表達(dá)變化,進(jìn)而增加未知且不可預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)。非預(yù)期的生物分布,某些基因zhiliao產(chǎn)品需要在特定的細(xì)胞或組織中表達(dá)以實(shí)現(xiàn)zhiliao目的,如果基因zhiliao產(chǎn)品在非預(yù)期的細(xì)胞、組織或qiguan中表達(dá)或修飾,可能引起非靶細(xì)胞功能、生長(zhǎng)或/分化改變,甚至引發(fā)liu。嘉興育種脫靶檢測(cè)企業(yè)基因編輯脫靶將無(wú)處隱藏。

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對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過(guò)評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來(lái)評(píng)估。首先,應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復(fù)合物的親和力,并說(shuō)明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外,還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能,應(yīng)確定靶抗原肽的較小識(shí)別基序(motif),并采用計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)分析評(píng)估交叉反應(yīng)性。如果計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)可識(shí)別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽,應(yīng)在體外測(cè)定TCR修飾免疫細(xì)胞對(duì)表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原肽的的細(xì)胞的識(shí)別能力。如果不能排除交叉反應(yīng)性,應(yīng)基于含有潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的蛋白的表達(dá)模式以及TCR與潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的親和力來(lái)進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應(yīng)性的信息,應(yīng)進(jìn)行充分的HLA交叉反應(yīng)性篩選。

長(zhǎng)期隨訪的觀察時(shí)間長(zhǎng)期隨訪的持續(xù)時(shí)間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況(生物分布和給藥途徑)等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。一般而言,針對(duì)不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下:?具有基因組整合活性的載體(例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體)和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風(fēng)險(xiǎn)的細(xì)菌或病毒載體(如單純皰疹病毒)建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)(ganran或再jihuo)。基因編輯產(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。種子基因脫靶檢測(cè)多少錢?

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由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對(duì)標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測(cè)假定脫靶位點(diǎn)再檢測(cè)的思路;與其他的評(píng)估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。脫靶檢測(cè)分析,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。江蘇基因療法脫靶檢測(cè)方法

選擇潛在的脫靶位點(diǎn),例如選擇gRNA預(yù)測(cè)網(wǎng)站上Top 5潛在脫靶位點(diǎn),進(jìn)行Sanger測(cè)序單克??;off-target脫靶檢測(cè)報(bào)告

檢測(cè)方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過(guò)驗(yàn)證,并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年?yáng)性和陰性對(duì)照;當(dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽(yáng)性的比例超出預(yù)期范圍時(shí),應(yīng)開展克隆性生長(zhǎng)的評(píng)估。如果存在優(yōu)勢(shì)克隆或單克隆生長(zhǎng),應(yīng)在不超過(guò)3個(gè)月的時(shí)間內(nèi)再次檢測(cè)確認(rèn),并盡快開展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整合位點(diǎn)確定后,應(yīng)與人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)及基因組的其他數(shù)據(jù)庫(kù)等進(jìn)行比較,確定整合位點(diǎn)的基因功能,評(píng)估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽(yáng)性細(xì)胞的克隆性生長(zhǎng),或檢測(cè)發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近,應(yīng)縮短檢測(cè)間隔至不超過(guò)3個(gè)月并密切監(jiān)測(cè)惡性liu征兆,直至檢測(cè)不到基因zhiliao載體。off-target脫靶檢測(cè)報(bào)告

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