南京病毒載體拷貝數(shù)報(bào)告

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-04-13

利用ddPCR檢測溶液中空載體的濃度和整合到T細(xì)胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測到的平均每個(gè)細(xì)胞的載體拷貝數(shù)與流式細(xì)胞術(shù)檢測到的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明,ddPCR明顯更精確,測量的差異減少了7倍,文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測量結(jié)果,突出了該測定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對(duì)新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細(xì)胞進(jìn)行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準(zhǔn)確定量CAR和TCR工程T細(xì)胞中平均載體拷貝數(shù)的強(qiáng)大工具。該試驗(yàn)也適用于其他類型的基因工程細(xì)胞,包括自然殺傷細(xì)胞和造血干細(xì)胞。質(zhì)??截悢?shù)分為嚴(yán)謹(jǐn)型與松馳型。南京病毒載體拷貝數(shù)報(bào)告

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致瘤性的風(fēng)險(xiǎn):考慮產(chǎn)品特征,所使用整合性載體(如逆與產(chǎn)品的儲(chǔ)存、運(yùn)輸和分配有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如保存、冷凍和解凍過程)、冷鏈或其他類型受控溫度條件被突破的風(fēng)險(xiǎn)、與產(chǎn)品穩(wěn)定性有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn),這可能會(huì)影響CAR-T細(xì)胞的生物學(xué)活性進(jìn)而導(dǎo)致治療失敗。與產(chǎn)品活性相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)與產(chǎn)品活性有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)如T細(xì)胞jihuo引起的CRS、ICANS等。與患者基礎(chǔ)疾?。ɑ驖撛诩膊。┗蚺c合并使用其他藥物的相互作用相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)。發(fā)生有害的免疫原性反應(yīng)及其后果(包括過敏反應(yīng)、產(chǎn)生中和抗體等)。與患者自身情況相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如移植物抗宿主病、惡性liu)。對(duì)患者或供者細(xì)胞進(jìn)行預(yù)期和非預(yù)期基因修飾有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如細(xì)胞凋亡、功能改變、惡性liu)。蘇州AAV載體拷貝數(shù)企業(yè)如何計(jì)算質(zhì)粒的拷貝數(shù)?

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拷貝數(shù)對(duì)于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實(shí)際上,每個(gè)細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì),可以把質(zhì)粒分為兩類:嚴(yán)緊型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時(shí),質(zhì)粒也復(fù)制一次,每個(gè)細(xì)菌內(nèi)只含1~2個(gè)質(zhì)粒;松弛型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后仍然能繼續(xù)復(fù)制,每一個(gè)細(xì)菌內(nèi)一般含20個(gè)左右質(zhì)??截悺_@些質(zhì)粒的復(fù)制是在寄主的松弛控制之下的,每個(gè)細(xì)菌中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質(zhì)的合成還可使質(zhì)??截悢?shù)增至幾千份。當(dāng)然,恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、質(zhì)粒的大小及培養(yǎng)條件有關(guān)。那么到這里你可能會(huì)問,高拷貝質(zhì)粒我們可以多提一點(diǎn)質(zhì)粒,低拷貝數(shù)的質(zhì)粒有什么作用呢?確實(shí),低拷貝數(shù)的質(zhì)粒用途不是十分廣闊,主要用于以下兩點(diǎn):高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往不穩(wěn)定,進(jìn)行大片段克隆或者帶有毒性DNA克隆時(shí)會(huì)用低拷貝;質(zhì)粒的擴(kuò)增會(huì)占用大量資源,當(dāng)載體用于表達(dá)或者其他用途時(shí),也會(huì)使用上低拷貝質(zhì)粒。

載體拷貝數(shù)一般檢測方法有:若是測序結(jié)果,可選用censor軟件檢測相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。Southern法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。另外,由于Southern法檢測不經(jīng)過靶片段的擴(kuò)增(PCR),一般每個(gè)電泳通道需要10-30μg的DNA,在實(shí)際操作中就需要較大量的植物材料來提取DNA,而轉(zhuǎn)基因植物的愈傷組織在無菌條件下經(jīng)過篩選、重新分化后一般都比較細(xì)弱,不宜大量取樣。如果外源基因在插入時(shí)發(fā)生基因重組,造成限制性酶切位點(diǎn)丟失,Southern法也無法檢測到。這些因素都制約了Southern法在T0代轉(zhuǎn)基因植物中檢測外源基因拷貝數(shù)的應(yīng)用。載體拷貝數(shù)分析,可咨詢上海唯可生物。

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如何提高低拷貝質(zhì)粒的效率?南京病毒載體拷貝數(shù)報(bào)告

為促進(jìn)及早發(fā)現(xiàn)此類風(fēng)險(xiǎn)并提供有效地風(fēng)險(xiǎn)控制措施,本指導(dǎo)原則在借鑒ICHE2E藥物警戒計(jì)劃、《藥物警戒質(zhì)量管理規(guī)范》和國內(nèi)外風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃相關(guān)指導(dǎo)原則的基礎(chǔ)上,列舉了CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品可能存在的安全性風(fēng)險(xiǎn),以及常規(guī)和本類產(chǎn)品特異的額外藥物警戒活動(dòng)和風(fēng)險(xiǎn)較小化措施。CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)識(shí)別應(yīng)盡早開始,并在整個(gè)研發(fā)過程中持續(xù)進(jìn)行,以在可能的情況下預(yù)防、較小化風(fēng)險(xiǎn)。隨著對(duì)風(fēng)險(xiǎn)認(rèn)知的變化,應(yīng)及時(shí)更新風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃。本指導(dǎo)原則包括CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申報(bào)上市臨床風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容,重點(diǎn)就撰寫CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃時(shí)的特殊考慮進(jìn)行描述,CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申報(bào)上市臨床風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃還應(yīng)參考ICHE2E、《藥物警戒質(zhì)量管理規(guī)范》以及我國藥品監(jiān)管機(jī)構(gòu)發(fā)布的有關(guān)技術(shù)指導(dǎo)原則。隨著技術(shù)的發(fā)展和相關(guān)研究數(shù)據(jù)的積累,本指導(dǎo)原則也將適時(shí)進(jìn)行更新。南京病毒載體拷貝數(shù)報(bào)告

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