AFADESI-MSI空間代謝組學：生物組織**能代謝物的空間分布可以更深層次的理解組織特異性分子組織學和病理學。問題的**在于開發(fā)一種非靶向、高靈敏度、高覆蓋和高特異性的成像方法，能夠可視化大量代謝產(chǎn)物在其自然狀態(tài)下的空間分布。將功能代謝物的空間和時間變化與...

酵母單雜交篩選：（4）在篩選到的轉(zhuǎn)錄因子中，***GL1促進HIV-2轉(zhuǎn)錄。***GL1在免疫細胞中***表達，并與HIV的其他轉(zhuǎn)錄***因子，即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用，本研究中顯示HEK293T細胞中，***GL1過表達后，...

通過傳統(tǒng)的酵母雙雜交系統(tǒng)，以PtDAL1為誘餌，篩選樣本來源于不同年齡段的油松cDNA文庫。將獲得的陽性克隆，10個一組，挑選到1個96孔板的PCR板孔中，獲得10*96個陽性克隆的96孔板。以其中陽性克隆mix為模板，進行PCR擴增，并將所有的PCR產(chǎn)物進行...

單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞 RNA 含量很少，擴增和捕獲效率的微小變化，就可能在細胞間產(chǎn)生與生物學無關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本，可能會因為純粹的技術(shù)原因而不盡相同，矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處...

研究者利用特異性的PD-L1抑制劑——阿特珠單抗（atezolizumab），對產(chǎn)生耐藥性的患者進行***，取得了很好的效果，臨床表現(xiàn)顯示**逐漸縮小。該研究為利用單細胞測序技術(shù)開展精細的臨床***提供了新的思路和方案，顯示出單細胞測序可以作為**的檢測手段，...

子宮腺肌癥（AM）是常見的良性慢性婦科疾病，目前對于這種疾病的確切發(fā)病機制尚不清楚。單細胞 RNA 測序（scRNA-seq）技術(shù)可以揭示罕見的亞群，探索遺傳和功能的異質(zhì)性，并揭示每個細胞的獨特性。因此，本文作者利用單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在單細胞水平上識別異位病...

本研究為通過單細胞測序技術(shù)進行精細***提供了一個經(jīng)典范例，顯示出單細胞測序技術(shù)未來在臨床檢測、確定***方案等方面的巨大應(yīng)用前景。細胞是生命活動的基本功能單位。不同類型細胞之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成了生命的基礎(chǔ)。研究對象的這一“基本屬性”決定了單細胞測序技術(shù)是我...

雙平臺代謝組學研究，2022年02月，中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發(fā)表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed developm...

GC-MS非靶向代謝組研究，隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關(guān)注，本篇為2020年2月，南京大學趙麗娟課題組在Environmental Science & Technol...

GC-MS非靶向代謝組學研究，中文標題：代謝組學分析和氧化應(yīng)激反應(yīng)揭示了有機磷類阻燃劑磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基對大腸桿菌的毒性研究對象：大腸桿菌發(fā)表期刊：Chemosphere影響因子：7.086作者單位：廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院涉及的歐易/...

GC-MS非靶向代謝組學研究，2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Pro...

本研究利用水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選，繪制了水稻轉(zhuǎn)錄因子和菌根共生相關(guān)基因之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)受到保守的磷感應(yīng)途徑統(tǒng)一控制，以磷酸鹽饑餓響應(yīng)因子（PHR）為中心。PHRs 是菌根共生所必需的，通過 P1BS 順式作用元件調(diào)控菌根共生相關(guān)基因表達。高磷條件下，SPX...

GC-MS非靶向代謝組學研究，2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Pro...

本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學和轉(zhuǎn)錄...

代謝組學研究：濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來，在中國白酒釀造行業(yè)中，人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質(zhì)量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學機制，以及這種變化與生產(chǎn)高質(zhì)量濃香白酒之間的聯(lián)系，本文對該釀造微生態(tài)...

label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma，LUAD)是肺*的一種，屬于非小細胞*，早期一般沒有明顯的臨床癥狀，且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學的理解，加速了靶向***...

酵母文庫實驗：本研究發(fā)現(xiàn)了一個硝酸鹽響應(yīng)的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2，它參與調(diào)節(jié)硝酸鹽介導(dǎo)的蘋果植株生長。利用酵母雙雜交、蛋白質(zhì) pull-down、BiFC 實驗證實，MdBT2 可以與一個 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作，這種互作是 MdR...

非靶代謝組學研究：2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phospha...

代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學，中文標題：基于代謝組學分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對斑馬魚胚胎和仔魚的健康風險研究對象：斑馬魚胚胎和仔魚發(fā)表期刊：JournalofHazardousMaterials影響因子：10.588運用生物技術(shù)：代謝組學環(huán)境毒理...

代謝組學研究：濃香型白酒（SFB）在窖泥窖內(nèi)發(fā)酵過程中，獲得了其特有的風味。窖泥中的微生物是產(chǎn)生風味酯的關(guān)鍵前提物。本篇為歐易/鹿明生物合作客戶四川省農(nóng)業(yè)科學院水稻高粱研究所（一作：劉茂柯）于2020年3月在微生物學?？秏Systems》（IF=6.469）...

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽（TMT）標記的蛋白質(zhì)組學和平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）技術(shù)，對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明，碳水化合物代謝（包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織）、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事...

GC-MS非靶向代謝組學和轉(zhuǎn)錄組學研究方法，2021年11月，上海交通大學醫(yī)學院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with met...

2022年2月，亞特蘭大埃默里大學醫(yī)學院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease ...

GC-MS代謝組學和 LC-MS代謝組學研究：鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進行了研究，利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果...

TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofh...

作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學過程，細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能，肌動蛋白細胞骨架是**豐富的...

文章使用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學的方法，分析鑒定了差異表達的蛋白質(zhì)，對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體論(GO)分析，顯示下調(diào)參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內(nèi)銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM...

LC-MS和GC-MS兩大平臺是現(xiàn)今代謝組學研究**常用的兩大技術(shù)平臺，各自有其特點和優(yōu)勢，在物質(zhì)檢測的范圍和種類上，都有一定的偏向性。往往一種方法、一個技術(shù)平臺很難獲取樣品當中***的代謝物信息，為了解決這個問題，LC-MS+GC-MS這種組合式雙平臺解決方...

TMTpro-16plex等標記試劑已經(jīng)發(fā)布一年，廣受科研工作者喜愛。但是，對于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實驗設(shè)計，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學近年來備受青睞，穩(wěn)定同位素標記策略...

非靶代謝組學研究：2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phospha...