上海植物蛋白組學研究

來源: 發(fā)布時間:2022-07-20

本文為了探究其潛在的分子機制,作者運用RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學,對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關鍵候選基因和蛋白質的時間特異性表達,而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題:基于iTRAQ蛋白質組學和轉錄組學聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質相關的關鍵代謝產物的積累研究對象:油茶種子發(fā)表期刊:HorticultureResearch影響因子:6.793發(fā)表時間:2021.07.01發(fā)表單位:海南大學園藝園林學院運用生物技術:RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持單細胞蛋白組學之質譜流式細胞技術。上海植物蛋白組學研究

為了驗證iTRAQ標記蛋白組學分析測定的蛋白積累變化,選擇兩種蛋白進行westernblot分析。如圖4A所示,iTRAQ分析中兩種蛋白(RPD3和VMA3)的積累每次均與westernblot數(shù)據(jù)一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相對表達量與蛋白水平相似,在BF的菌絲中也表達上調(圖4B-D)。VAC8在2-1、3-1、4-1組的基因水平上高度上調。這些結果表明,這些上調的表達蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用標記定量(iTRAQ)蛋白質組學、基于氣相色譜-質譜的代謝組學GC-MS非靶向代謝組學和透射電鏡分析細胞結構,研究了香菇菌絲后熟轉色形成的機制,并且***證明氧化應激和自噬過程是至關重要,為后續(xù)進一步的研究提供了新的見解。上海植物蛋白組學研究蛋白組學方案為組學研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。

通過磷酸化蛋白質組定量鑒定了1244個磷酸化蛋白質,其中474個(38%)在**組織中***增加,183個(15%)***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學的比較結果揭示了亞型特異性的活性激酶。進一步對差異改變的磷酸化位點的研究顯示,在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉運的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質組技術,是對蛋白組學+磷酸化組學的雙重升級,可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性,**臨床蛋白質組學在定性數(shù)量更多、定量更準確、位點鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測周期更短等性能上***提升,從蛋白質表達和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調控機制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標志物等多重作用。

轉錄組學和蛋白質組學分析作者通過轉錄組學和蛋白質組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因(DEG)。轉錄組學鑒定了2387個DEG,其中72%被下調。蛋白質組學鑒定出402個DEG,其中74%被下調。GO和KEGG通路富集分析表明,轉錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調節(jié)”等生物學過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質消化吸收”。蛋白質組學分析中,富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質轉運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”、“細胞外基質”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質消化和吸收”。前兩條通路與上調的DEG相關,而后兩條通路與下調的DEG相關,這與轉錄組學結果一致。蛋白質組學的特點蛋白質組和蛋白質組學的概念。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法:2021年7月,海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法,發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質相關關鍵代謝產物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉錄組和蛋白質組譜機理,描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。蛋白質組學技術簡介及應用場景。安徽蛋白組學在疾病診斷中的應用

蛋白質組與代謝組聯(lián)合分析。上海植物蛋白組學研究

通過蛋白質組學質譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標記定量蛋白組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?;诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻?;种瓶?*發(fā)生的NDP,并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機制。為靶向N-豆蔻?;蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標題:NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?;⑼ㄟ^差異調節(jié)靶標的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象:細胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊:FrontiersinOncology影響因子:6.244發(fā)表時間:2021年5月合作單位:上海交通大學醫(yī)學院附屬上海兒童醫(yī)學中心運用生物技術:iTRAQ標記定量蛋白組學、PRM靶向驗證、質譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持上海植物蛋白組學研究

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢,是一家檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向導,為客戶提供***的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。歐易生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術為先導,以產品為平臺,以應用為重點,以服務為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務。歐易生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。