什么是蛋白質的翻譯后修飾？蛋白質的翻譯后修飾（）是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說，這是蛋白質生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。通過向修飾基團添加一個或多個氨基酸殘基或通過蛋白質水解切割該基團來改變蛋白質的性質，是蛋白質生物學功能表達的重要步驟。生物蛋白質的翻譯后修飾極大地增加了蛋白質結構的類型和功能。這個過程調節(jié)細胞周期和蛋白質轉錄，并影響表觀遺傳學。乙?；揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類型。南京琥珀?；揎椀鞍踪|組學技術服務
蛋白質學組翻譯后修飾的類型：翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學修飾和肽鍵的裂解，其中磷酸化是比較常見的。蛋白質的化學修飾反應是在維持蛋白質的完整性和功能性的基礎上，通過基于其氨基酸殘基的化學反應獲得新的生物結合物。翻譯后修飾在哪里發(fā)生？翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側鏈或蛋白質的C端或N端?，F(xiàn)有的官能團或新官能團的引入可被用于修飾蛋白質，以擴展20個標準氨基酸的化學組成。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學反應中充當親核試劑的官能團，如絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基；賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式；同時，在蛋白質的N端和C端，天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側鏈位點的一些亞甲基上。上海蛋白質泛素化修飾組學質譜鑒定在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進入質譜進行分析。
蛋白質翻譯后修飾組學：血漿蛋白糖基化修飾分析：蛋白質糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質上的過程，是一種常見的蛋白質翻譯后修飾。分泌的細胞外蛋白常被糖基化，糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質包括維持機體正常生理狀態(tài)的蛋白質和機體分泌、滲漏、脫落的蛋白質，其中不乏存在一些糖基化蛋白質。而蛋白質糖基化修飾不只影響蛋白質的空間構象、生物活性、運輸和定位，而且在分子識別、細胞通信、信號轉導等特定生物過程中發(fā)揮著至關重要的作用。因此對血漿蛋白糖基化進行分析，有助于研究血漿蛋白的生理功能等。
蛋白質乙?；揎椊M學定量分析：1. SILAC細胞標記，組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質（基于SILAC的乙?；揎椊M學定量）。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記（基于iTRAQ的乙?；揎椊M學定量）。4. 使用高效特異性乙?；贵w對乙?；揎楇亩芜M行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行序列分析。6. 數(shù)據(jù)分析，比對不同樣本中蛋白乙?；揎椝讲町悾Ξa(chǎn)生變化的生物學意義進行解釋。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。
蛋白質學組翻譯后修飾分析：組蛋白是一類高度保守的蛋白質，是染色質的關鍵成分，是DNA包裝的結構單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化，賴氨酸或精氨酸的甲基化，賴氨酸的乙?；兔撘阴；?，賴氨酸的泛素化和磺酰化等對組蛋白進行的共價修飾。組蛋白這些修飾對于核完整性至關重要，因為它們可以調節(jié)染色質結構并募集參與基因調節(jié)、DNA修復和染色體濃縮的酶。組蛋白的翻譯后修飾大多位于N末端的尾巴上，因為N末端是蛋白質中比較暴露和比較靈活的區(qū)域。分析組蛋白翻譯后修飾有助于探索組蛋白修飾與染色體濃縮、DNA轉錄等生物功能之間的關系。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。貴州棕櫚?；揎椀鞍踪|組學
蛋白磷酸化修飾過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上。南京琥珀酰化修飾蛋白質組學技術服務
蛋白磷酸化檢測方法：一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢：1. WB方法簡便，多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏，能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白，可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集，再進行WB檢測被磷酸化的蛋白，檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質譜檢測方法：Western Blot的方法雖然簡便，但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質譜儀，如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠，或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白，將含有目標蛋白的條帶切下，胰酶消化，LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。南京琥珀?；揎椀鞍踪|組學技術服務
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