定量蛋白質(zhì)組學方法學介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應用比較普遍的技術,該技術的關鍵原理是多肽標記和定量,將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記),從而簡化了定量的復雜性,然后通過多肽定量值回歸到蛋白的定量值,從而測定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異。iTRAQ定量不依賴樣本,可檢測出較低豐度蛋白,胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量準確,可同時對8個樣本進行分析,并可同時得出鑒定和定量的結果,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。質(zhì)譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。貴陽PRM定量蛋白質(zhì)組學技術
蛋白組學研究怎么做?PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術,能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進行選擇性檢測,從而實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量,因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術的WesternBlot(LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB)。PRM技術基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺,首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標肽段的母離子,隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂,之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。濟南外泌體蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學包括蛋白質(zhì)的表達水平。
定量蛋白質(zhì)組學技術:定量蛋白質(zhì)組學技術主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內(nèi)標記和體外標記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常。定量蛋白質(zhì)組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定。非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術,Labelfree定量蛋白組學技術是通過液質(zhì)聯(lián)用技術對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質(zhì)進行相對定量。
蛋白組學技術:質(zhì)譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化,然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來分離并確定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫,質(zhì)譜技術可達到對蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強激光解吸離子化質(zhì)譜等。蛋白質(zhì)組的概念指由一個基因組,或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復合物結構。質(zhì)譜技術的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術支撐,使得許多有實際應用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能,包括翻譯后修飾的整體分析,蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究;在臨床醫(yī)學和轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中也越來越多地應用到蛋白質(zhì)組學技術。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術也有十分誘人的前景。濟南外泌體蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要。貴陽PRM定量蛋白質(zhì)組學技術
蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學、生物信息學等相關學科的發(fā)展,我認為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學相關的應用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細胞癥)、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計,應該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因,蛋白質(zhì)組學技術并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目,采用基于質(zhì)譜(或二維膠等手段)的蛋白質(zhì)組學有獨特的技術優(yōu)勢。另外,蛋白質(zhì)組學方法開發(fā)和驗證周期短,在中高級特殊應用(如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制)中也有其獨特優(yōu)勢。貴陽PRM定量蛋白質(zhì)組學技術
上海拜譜生物科技有限公司位于東川路555號丙樓1171室。公司業(yè)務分為多組學服務,質(zhì)譜檢測,蛋白質(zhì)組學,代謝組學等,目前不斷進行創(chuàng)新和服務改進,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務為理念,秉持誠信為本的理念,打造商務服務良好品牌。拜譜生物秉承“客戶為尊、服務為榮、創(chuàng)意為先、技術為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。