一種是用beta巰基乙醇打開蛋白質(zhì)分子二硫鍵的,另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的,但特點不一樣,前者更容易與氧氣反應,穩(wěn)定性比后者差,如果在常溫下暴露在空中,前者只能維持24小時的活性,后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少,跑幾次就可以用完的樣品,這時選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多,計劃跑上幾十次的,優(yōu)先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準備首先強調(diào)一下,一塊好的膠是跑好蛋白的前提,所以這個環(huán)節(jié)也不容忽視。玻璃板的選擇,一種是1毫米厚度的,另一種是,這個厚度選擇也是有講究的,如果上樣體積小于10微升,優(yōu)先選1毫米,否則選。原因是什么?答案在轉(zhuǎn)膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈,晾干。裝板,注意厚板和薄板的底部要對齊,否則會漏膠。加制膠的各成分前,要觀察液體是否有沉淀,有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說明依次加入各組分,加完SDS后先簡單手動搖勻幾下,然后迅速加入過硫酸銨和TEMED,搖勻,緊接著就灌膠。然后我習慣用95%的酒精壓膠,我也用過純水,感覺純水壓沒那么好,由于水的密度較大,會把分界處的膠壓得膨大。純干貨Western blot (WB)條帶灰度統(tǒng)計與GraphPad作圖.北京大鼠科研技術服務技術
轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關基因的表達和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過程中起關鍵作用。當減數(shù)分裂開始時YTHDC2表達上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細胞沒有經(jīng)過偶線期的發(fā)育導致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應中,METTL3可促進DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點,當缺失METTL3時,細胞無法迅速修復UV照射引起的突變,并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細胞性小鼠過繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達水平,從而抑制IL-7介導的STAT5活性和T細胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細胞中,低氧刺激能促進依賴低氧誘導因子HIF的ALKBH5的表達,而ALKBH5過表達降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達水平,終增加乳腺干細胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導乳腺細胞中依賴ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。廣西疾病科研技術服務構建動物疾病模型可以分為兩種類型:自然模型和人工模型。
外泌體的功能外泌體可能作為細胞之間物質(zhì)和信號通訊的途徑,不同的細胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現(xiàn)細胞間通訊,這些外泌體被受體細胞吸收,通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實現(xiàn)物質(zhì)和信號的交流。外泌體與受體細胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細胞表面的受體識別,從而靶細胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細胞膜融合,將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進去,此類膜融合可能改變靶細胞的一些膜特性,例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運輸?shù)街苓叞屑毎蚪?jīng)血液等體液運輸而被遠處組織細胞攝取,進而影響目的細胞的基本功能和基因表達。幾乎所有的細胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體,不同的細胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。
首先,預實驗必須要當做正式實驗來對待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預實驗的每一步都需要詳細規(guī)劃,多方籌謀。不論是實驗動物的選擇,還是檢測試劑的購買,都盡量和正式實驗統(tǒng)一標準。建議大家先把所有試劑和藥物購買完畢后,再去購買實驗動物。因為動物會長胖,長胖后給藥劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實驗效果。筆者曾經(jīng)提前將實驗動物買回,但因為特殊原因沒能購買到造模藥物,**終只能忍痛割愛將動物贈送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖,沒辦法用作造模)。動物及試劑購買首先需要考慮:實驗動物品種、體重、性別、周齡(通常根據(jù)既往文獻報道可以獲得答案)、數(shù)量(需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆,因此需要提前購買足夠的動物)。動物購買的途徑、安置的地點,飲食管理(一般實驗室會有動物房,也可以從其他地方購買),動物免疫證明、倫理證明需要提前準備好。實驗相關的試劑和藥物:比如造模藥物和器械,動物干預所需藥物,陽***物選擇及購買(有些藥物購買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準備好**物(***建議提前購買),手術器械。將Transwell小室放入配套培養(yǎng)板中,形成由細胞可穿透性膜分隔開的兩室系統(tǒng),將高營養(yǎng)液與低營養(yǎng)液分隔開。
RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]?!熬幋a器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個復合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結合蛋白識別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結合蛋白(讀碼器)有YTH結構域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內(nèi)亞細胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復合體的新亞基。細胞培養(yǎng)板的選購要注意哪些?浙江疾病模型科研技術服務實驗
動物疾病模型作為研究工具,在探索疾病發(fā)展和檢查的過程中發(fā)揮了巨大的作用。北京大鼠科研技術服務技術
原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達產(chǎn)物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過脂質(zhì)體進行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過程。因為質(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數(shù)期293T細胞,細胞計數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。北京大鼠科研技術服務技術