寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2025-08-21

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見(jiàn)的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過(guò)度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長(zhǎng)。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴(lài)于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過(guò)m6A-YTHDF2依賴(lài)機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過(guò)程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。細(xì)胞是生命的基本單位,所有生物體都是由一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

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膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過(guò)度造成的自身?yè)p傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類(lèi)膿毒癥機(jī)制的模型,被稱(chēng)為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。江蘇疾病科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)干貨 | 分子克隆實(shí)驗(yàn)——無(wú)縫克隆。

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實(shí)驗(yàn)樣本分類(lèi)實(shí)驗(yàn)一般采取樣本有:血液樣本、樣本和細(xì)胞樣本。通常,樣本采集后,應(yīng)立即用等滲溶液(PBS或生理鹽水)盡量把血液漂洗干凈(除非血液也是分析對(duì)象),用濾紙或紗布吸干,把樣本分切成幾分,每份的體積約2個(gè)黃豆大小,每份用一個(gè)管子裝。血液樣本的采集應(yīng)根據(jù)不同實(shí)驗(yàn)的要求,將會(huì)采取不同策略。血清樣本:全血中不加抗凝劑,血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黃色透明液體。(全血標(biāo)本室溫放置2小時(shí)3000rpm/min離心15min)血漿樣本:全血中加抗凝劑,血液凝固后取出的含凝血因子的淡黃色透明液體。(可用EDTA或肝素作為抗凝劑,標(biāo)本采集后30分鐘內(nèi)于2-8℃,3000rpm/min離心15min)如果是做生化\ELISA等檢測(cè)可以考慮血漿和血清,根據(jù)獲得的樣本量可考慮分裝成100-500μl/管,可避免反復(fù)凍融造成的檢測(cè)誤差。生化:建議優(yōu)先選擇血清,其次選擇肝素抗凝血漿;ELISA:建議優(yōu)先選擇血清,其次選擇肝素或EDTA抗凝血漿;凝血實(shí)驗(yàn):只能選擇枸櫞酸鈉抗凝血漿;血常規(guī):只能選擇EDTA抗凝全血;如果要收集其中的白細(xì)胞、血小板等建議用抗凝全血。如果要做流式建議用專(zhuān)門(mén)的流式用血液收集管,防止表面抗原的丟失,或者盡快安排就近檢測(cè)。樣本處理取樣完后。

且研究表明HNRNPC通過(guò)m6A與RNA結(jié)合調(diào)控目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學(xué)功能越來(lái)越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮重要的生物功能。例如,在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴(lài)METTL3的pri-miRNA甲基化,會(huì)促進(jìn)DGCR8識(shí)別和加工,從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外,m6A識(shí)別蛋白HNRNPA2B1促進(jìn)pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用,其調(diào)控機(jī)制的異??赡芘c人類(lèi)疾病或相關(guān)。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會(huì)影響精子發(fā)育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發(fā)育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng)(METTL3,F(xiàn)TO)、生成(YTHDF2)或轉(zhuǎn)移(METTL14)、干細(xì)胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節(jié)律、細(xì)胞發(fā)育分化、細(xì)胞分裂及其它的一些生命過(guò)程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點(diǎn)是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細(xì)胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細(xì)胞中,METTL3的敲除嚴(yán)重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生。動(dòng)物疾病模型可以分為兩種類(lèi)型:自然模型和人工模型。

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應(yīng)退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應(yīng)盡量保持無(wú)水,應(yīng)經(jīng)常更換,或用紗布包無(wú)水硫酸銅放入染色缸內(nèi)吸收水分。5.透蠟注意事項(xiàng)(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內(nèi)部達(dá)到飽和程度以便包埋。透蠟時(shí)間根據(jù)組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進(jìn)行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時(shí)間內(nèi)完成石蠟透入過(guò)程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過(guò)高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(xiàng)(1)染色原理:伊紅主要染細(xì)胞質(zhì),著色濃淡應(yīng)與蘇木精染細(xì)胞核的濃淡相配合,如果細(xì)胞核染色較濃,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)濃染,以獲得鮮明的對(duì)比。(2)染色時(shí)間應(yīng)根據(jù)染色劑的成熟程度及室溫高低,適當(dāng)縮短或延長(zhǎng)。室溫高時(shí)促進(jìn)染色,染色時(shí)間可短些,否則可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間,冬季室溫低時(shí)可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過(guò)大,以防切片脫落。(4)如果細(xì)胞核染色較淺,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)淡染??稍谝良t乙醇液中滴加數(shù)滴冰醋酸助染,促使細(xì)胞質(zhì)容易著色,并且經(jīng)乙醇脫水時(shí)不易褪色。細(xì)胞生物學(xué)是生物學(xué)的一個(gè)分支,研究細(xì)胞的結(jié)構(gòu)、功能、生理和遺傳學(xué)等方面。江蘇豚鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

細(xì)胞核是細(xì)胞的控制中心,它包含了遺傳物質(zhì)DNA,控制著細(xì)胞的生長(zhǎng)和分裂。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]?!熬幋a器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個(gè)復(fù)合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)