黑龍江瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

使用Genovis的OpeRATOR圖譜O-聚糖位點(diǎn)對(duì)依那西普進(jìn)行LC-MS分析：依那西普是一種 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。將依那西普與OpeRAT一起孵育，并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促紅xibao生成素 （EPO） 是一種具有單個(gè) O-糖基化位點(diǎn)的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO進(jìn)行去唾液酸化后，用OpeRAT消化天然蛋白，并通過(guò)反相LC-MS分析所得蛋白質(zhì)片段。O-糖基化的位點(diǎn)可以通過(guò)識(shí)別OeRATOR消化位點(diǎn)直接推斷出來(lái)。為了獲得良好性能，需要去除唾液酸助劑，因此購(gòu)買(mǎi)中包括2000個(gè)單位（如果SialEXO凍干）。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活產(chǎn)品形式；2. 可以結(jié)合酶以提高效率；3. 適用于自動(dòng)化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的，而該酶在N-聚糖上沒(méi)有活性。OpeRATOR和SialEXO處理后，O-糖基化蛋白被消化成攜帶O-聚糖的肽。消化發(fā)生在O-糖基化位點(diǎn)的N端。OpeRATOR用于質(zhì)譜法進(jìn)行O-糖分析、O-糖肽圖譜以及中級(jí)分析，消化發(fā)生在O-糖基化位點(diǎn)的N端。黑龍江瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

Genovis的ImpaRATOR? 可用于多種 O-聚糖：依那西普是一種融合蛋白，由TNF受體的胞外結(jié)構(gòu)域與人IgG1的Fc部分相連。該蛋白質(zhì)在Fc區(qū)域上方含有多達(dá)13個(gè)O-糖基化的Ser/Thr殘基簇，使其成為一種非常難以在結(jié)構(gòu)上表征的生物制藥。為了證明ImpaRATOR的聚糖特異性，制備了三種具有不同聚糖組成的依那西普樣品：（i）攜帶單唾液酸和二唾液酸化he心1結(jié)構(gòu)混合物的未經(jīng)處理的糖蛋白，（ii）用SialEXO處理的糖蛋白去除唾液酸并產(chǎn)生裸核1結(jié)構(gòu)，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO處理的糖蛋白產(chǎn)生單個(gè)GalNAc殘基， 也稱(chēng)為T(mén)n抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一鍋反應(yīng)中處理三個(gè)樣品（圖1）。作為比較，SialEXO處理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR處理。將所得肽還原、烷基化并用HILIC-MS進(jìn)行分析。FabRICATOR被包括在反應(yīng)中，以將Fc區(qū)與大多數(shù)C端糖肽分離，以促進(jìn)其表征。山西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。

OglyZOR 來(lái)源于口腔鏈球菌，在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 227 kDa。SialEXO來(lái)源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達(dá)。SialEXO酶含有His標(biāo)簽，組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶；2. 降低樣品異質(zhì)性，揭示潛在的關(guān)鍵蛋白質(zhì)修飾；3. 完全、穩(wěn)健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶，用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以?xún)龈煞鄣男问教峁?，裝在 2000 個(gè)單位的小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發(fā)揮作用，因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。

在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截?cái)郞-聚糖后，在質(zhì)譜圖中觀察到幾個(gè)與GalNAcs相關(guān)的峰。為了去除剩余的GalNAc殘基，應(yīng)用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO處理后觀察到的單個(gè)蛋白峰顯示完全去除剩余的GalNAcs。?GalNAcEXO在生理緩沖液和中性pH值中具有活性，使其與大多數(shù)樣品相容。此外，GalNAcEXO的活性不依賴(lài)于任何可能影響LC-MS分析的輔因子，如BSA。根據(jù)底物的性質(zhì)，糖蛋白的GalNAcEXO反應(yīng)在2小時(shí)內(nèi)完成，而更復(fù)雜的樣品可能需要孵育過(guò)夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在離心柱中，以便快速方便地處理樣品，在制備過(guò)程中不會(huì)殘留酶。PNGase F Automation 含有以自動(dòng)化友好的 96 孔板形式凍干的 PNGase F 酶。

為了研究 OglyZOR 對(duì)天然糖蛋白的活性，將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒(méi)有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。當(dāng)唾液酸被去除時(shí)，OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品，以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化：O-糖基化生物制藥（如依那西普）很難表征。為了能夠通過(guò)質(zhì)譜法測(cè)定完整質(zhì)量數(shù)，我們進(jìn)行了酶促總?cè)ヌ腔-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。復(fù)雜樣品的特異性?xún)艋桓倪M(jìn) MS 分析的樣品制備。甘肅凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶

在天然條件下使用OmniGLYZOR Microspin色譜柱，可在3小時(shí)內(nèi)有效去除C1 抑制劑O-聚糖。黑龍江瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

使用Genovis的GalNAcEXO 對(duì) O-糖基化生物制藥進(jìn)行 Tn 抗原表征：未成熟的截短O(píng)-聚糖導(dǎo)致了復(fù)雜生物制藥的異質(zhì)性，使其分析更具挑戰(zhàn)性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc殘基組成，通過(guò)糖苷鍵與絲氨酸或蘇氨酸連接，稱(chēng)為T(mén)n抗原。 現(xiàn)在，使用GalNAcEXO可以采用合適的酶策略來(lái)去除這些GalNAc并簡(jiǎn)化生物制藥的表征。在質(zhì)譜圖中可以觀察到重復(fù)峰的模式。其次，在與GalNAcEXO酶孵育后，剩余的GalNAc殘基被完全去除，留下一個(gè)峰。因此，該工作流程確認(rèn)了 O-糖基化生物制藥上存在 Tn 抗原，并允許定量he心 GalNAc 水平。這種工作流程的另一個(gè)好處是減少了剩余的異質(zhì)性，這有助于確認(rèn)蛋白質(zhì)的完整質(zhì)量，并揭示截短的片段。黑龍江瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis