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病毒是地球上數(shù)量多的生物實(shí)體,其中細(xì)菌病毒(即噬菌體)約有1031個(gè)類(lèi)群,從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類(lèi)生態(tài)系統(tǒng)的重要成員,人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體,包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,dsDNA),單鏈DNA(single-strandedDNA,ssDNA)和RNA病毒。隨著對(duì)病毒研究的普遍開(kāi)展,“病毒組”與“病毒組學(xué)”的概念也應(yīng)運(yùn)而生,這些術(shù)語(yǔ)分別涵蓋了棲息在生態(tài)系統(tǒng)中的所有病毒及其基因組和對(duì)它們的研究(LefkowitzEJ,etal,2017)。根據(jù)病毒不同的特征進(jìn)行分類(lèi),包括病毒的宿主范圍;病毒的形態(tài)學(xué);病毒的基因組大小;病毒的核酸組成成分以及病毒的致病性。雖然所有的性狀在病毒分類(lèi)學(xué)的確定中都很重要,但目前利用平均核苷酸同源性(ANI)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行序列比較被視為定義和區(qū)分病毒群類(lèi)的主要標(biāo)準(zhǔn)。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法依賴(lài)于表型鑒定。未知病毒檢測(cè)方法
微生物檢測(cè)崗位職責(zé):1.負(fù)責(zé)產(chǎn)品無(wú)菌檢查、微生物限度檢查、細(xì)菌內(nèi)檢查、支原體及外源病毒的分析方法開(kāi)發(fā)、驗(yàn)證;2.對(duì)產(chǎn)品及環(huán)境實(shí)施無(wú)菌檢查、微生物限度檢查、細(xì)菌內(nèi)檢查;3.對(duì)原輔料、內(nèi)包材、工藝用水等實(shí)施微生物限度、細(xì)菌內(nèi)檢查;4.對(duì)微生物實(shí)驗(yàn)室的試劑、耗材、儀器等實(shí)施日常管理;5.對(duì)實(shí)驗(yàn)室菌種管理、進(jìn)行培養(yǎng)基的促生長(zhǎng)試驗(yàn)、無(wú)菌試驗(yàn)的陽(yáng)性對(duì)照試驗(yàn);6.進(jìn)行潔凈區(qū)日常環(huán)境監(jiān)控及無(wú)菌區(qū)人員更衣確認(rèn);7.對(duì)關(guān)鍵檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行定期的趨勢(shì)分析;8.完成上級(jí)安排的其他事宜。杭州微生物檢測(cè)公司醫(yī)院一些都和微生物有著極為密切的關(guān)系。
生物的個(gè)體在一生的生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中,經(jīng)過(guò)不同的發(fā)育階段。這種過(guò)程對(duì)特定的生物來(lái)講是重復(fù)循環(huán)的,常稱(chēng)為該種生物的生活周期或生活史。各種生物都有自己的生活史。在分類(lèi)鑒定中,生活史有時(shí)也是一項(xiàng)指標(biāo),如黏細(xì)菌就是以它的生活史作為分類(lèi)鑒定的依據(jù)。很多細(xì)菌有十分相似的外表結(jié)構(gòu)(如鞭毛)或有作用相同的酶(如乳酸桿菌屬內(nèi)各種細(xì)菌都有乳酸脫氫酶)。雖然它們的蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)各異,但在普通技術(shù)下(如電子顯微鏡或生化反應(yīng)),仍無(wú)法分辨它們。然而利用抗原與抗體的高度敏感特異性反應(yīng),就可用來(lái)鑒定相似的菌種,或?qū)νN微生物分型。用已知菌種、型或菌株制成的抗血清,與待鑒定的對(duì)象是否發(fā)生特異性的血清學(xué)反應(yīng)來(lái)鑒定未知菌種、型或菌株。該法常用于腸道菌、噬菌體和病毒的分類(lèi)鑒定。利用此法,已將傷寒桿菌、肺炎鏈球菌等菌分成數(shù)十種菌型。
介紹宏病毒組分析的常用軟件之前,首先我們來(lái)看一下宏病毒組的基本分析流程。這里需要說(shuō)明的是基于病毒顆粒分離技術(shù)及NGS測(cè)序平臺(tái)的宏病毒組學(xué)研究還處于起步階段,分析功能模塊新的思路和技術(shù)層出不窮,但另一個(gè)層面,宏病毒組是宏基因組的一個(gè)分支,基本大的分析思路方面與宏基因組還是有著不小的相似之處。歸納一下,宏病毒組主要包括一下幾個(gè)方面的分析內(nèi)容:病毒群落結(jié)構(gòu)組成分析;病毒群落功能分析;病毒(特別是噬菌體)宿主預(yù)測(cè);病毒與群落中細(xì)菌、古菌等其他微生物之間的互作網(wǎng)絡(luò);基于非數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的新病毒序列的挖掘。室內(nèi)空氣是微生物污染的傳播途徑。
微生物檢測(cè)方法中常用的有平板菌落計(jì)數(shù)法,是根據(jù)每個(gè)活的細(xì)菌能長(zhǎng)出一個(gè)菌落的原理設(shè)計(jì)的。取一定容量的菌懸液,作一系列的倍比稀釋?zhuān)缓髮⒍康南♂屢哼M(jìn)行平板培養(yǎng),根據(jù)培養(yǎng)出的菌落數(shù),可算出活菌數(shù)。此法靈敏度高,是一種檢測(cè)污染活菌數(shù)的方法,也是目前國(guó)際上許多國(guó)家所采用的方法。使用該法應(yīng)注意:①一般選取菌落數(shù)在30~300之間的平板進(jìn)行計(jì)數(shù),過(guò)多或過(guò)少均不準(zhǔn)確;②為了防止菌落蔓延,影響計(jì)數(shù),可在培養(yǎng)基中加入0.001%的2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC);③本法限用于形成菌落的微生物。普遍應(yīng)用于水、牛奶、食物、藥品等各種材料的細(xì)菌檢驗(yàn),是很常用的微生物檢測(cè)方法。微生物檢測(cè)涉及多行業(yè)和領(lǐng)域,在實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)中有著重要的地位。RNA病原篩查
微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用。未知病毒檢測(cè)方法
傳統(tǒng)病原微生物檢測(cè)方法概況:隨著醫(yī)學(xué)微生物學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展,病原學(xué)診斷已不再局限于病原體水平,深入到分子水平、基因水平的檢測(cè)手段不斷出現(xiàn)并被應(yīng)用于臨床和實(shí)驗(yàn)。核酸分子雜交技術(shù)、PCR技術(shù)、基因芯片技術(shù)、高通量測(cè)序技術(shù)等檢測(cè)方法,自動(dòng)化程度高,快速省時(shí)、無(wú)污染、結(jié)果精確,可以準(zhǔn)確靈敏地鑒定病原微生物。 傳統(tǒng)的病原微生物的檢測(cè)方法有:直接涂片鏡檢、分離培養(yǎng)與生化反應(yīng)、組織細(xì)胞培養(yǎng)、血清學(xué)與免疫學(xué)檢測(cè)、血清學(xué)與免疫學(xué)檢測(cè)、基因檢測(cè)(核酸雜交技術(shù)、基因芯片技術(shù)、PCR技術(shù)、環(huán)介導(dǎo)恒溫核酸擴(kuò)增法等)。未知病毒檢測(cè)方法
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