水體微生物測序分析檢測

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-07-22

病毒宏基因組學(xué):病毒宏基因組學(xué)是宏基因組學(xué)的一個(gè)分支,指研究特定環(huán)境中的病毒群落的一門技術(shù)。近年來隨著新測序技術(shù)的不斷發(fā)展,尤其是第二代、第三代測序儀的出現(xiàn),使病毒宏基因組學(xué)發(fā)展尤為迅速。對(duì)海洋中病毒群體進(jìn)行了研究,闡明海水中病毒群體以噬菌體為主,并且是應(yīng)用宏基因組學(xué)分析人糞便中不能培養(yǎng)的病毒群落,標(biāo)志病毒宏基因組學(xué)的開端。病毒宏基因組學(xué)這一概念,其描述的是環(huán)境中的病毒群落―噬菌體。再次提到病毒宏基因組學(xué)這一概念,并對(duì)宏基因組學(xué)挖掘新病毒的方法進(jìn)行了闡述,側(cè)重于人和動(dòng)物機(jī)體中的真核病毒群落。微生物鑒定的用途:醫(yī)療保健:準(zhǔn)確,快速地鑒定細(xì)菌和寄生蟲,以進(jìn)行正確和及時(shí)的疾病診斷。水體微生物測序分析檢測

上海探普生物科技有限公司對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測序有什么優(yōu)勢?全國開設(shè)病毒宏基因組測序的公司不超過3家,只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來自全國各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過60%,團(tuán)隊(duì)具備普通測序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)之外,同時(shí)具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景,相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項(xiàng)目咨詢的時(shí)候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性,溝通順暢,省時(shí)又省力。浙江宏基因組測序服務(wù)公司微生物鑒定可以采用不同微生物對(duì)周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。

探普生物對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測序?qū)嶒?yàn)基于二代測序技術(shù)。經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后,樣本轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。首先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對(duì)病毒的核酸純化樣本指南,以提高純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專門針對(duì)這一點(diǎn)開發(fā)了超微量核酸文庫構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測序文庫。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。寄生性質(zhì)的生物下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫,搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。

新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢,人類想要征服新發(fā)人畜共患病,就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原,并針對(duì)新病原進(jìn)行基因組分析、流行病學(xué)調(diào)查、致病機(jī)制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù),該技術(shù)結(jié)合深度測序技術(shù)(第二代、第三代測序技術(shù))已經(jīng)在人類、動(dòng)物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒,該技術(shù)不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列,在國內(nèi)外被普遍應(yīng)用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷。就病毒宏基因組學(xué)在動(dòng)物病毒研究中的應(yīng)用及研究進(jìn)展進(jìn)行了介紹。有很多微生物通過傳統(tǒng)技術(shù)是無法鑒別的。

宏基因組概念:宏基因組有廣義和狹義兩種概念。廣義的概念是指所有可能與人的生活密切相關(guān)的微生物的基因組,包括長期共生在體內(nèi)的微生物,也包括可以進(jìn)入體內(nèi),對(duì)人類的生活造成不同形式的影響的微生物。而狹義的宏基因組是只指長期共生在體內(nèi)的微生物。宏基因組測序分析技術(shù):單是共生在人體內(nèi)的微生物就有1000多種,特別是胃腸道內(nèi)的微生物為豐富。宏基因組除了這些微生物外,也包括以其他方式偶爾進(jìn)入人體內(nèi)的微生物,這些微生物可能形成病源體,影響我們的健康?,F(xiàn)在科學(xué)家可以分析和發(fā)現(xiàn)引起疾病的異常微生物存在與活動(dòng),從而保護(hù)人體的健康。宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落作為研究的對(duì)象,不需對(duì)微生物進(jìn)行分離培養(yǎng).浙江宏基因組測序服務(wù)公司

高通量測序技術(shù)對(duì)核酸進(jìn)行測序是非特異的,因此,對(duì)一無所知的核酸也可以實(shí)現(xiàn)鑒別.水體微生物測序分析檢測

宏病毒組是病毒的宏基因組,該技術(shù)是隨著高通量測序技術(shù)的興起而發(fā)展起來的。該技術(shù)主要是使用大量微生物群體樣本的測序數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析手段,以多種數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),進(jìn)行群體的種類和功能分析。因此,它主要的應(yīng)用場景在于微生物群體研究,如腸道微生物、皮膚微生物、口腔微生物、水體微生物、土壤微生物等。一直以來宏基因組技術(shù)都是在細(xì)菌領(lǐng)域使用,病毒的樣本收集困難、文庫構(gòu)建繁瑣、數(shù)據(jù)庫不完善,因此宏基因組技術(shù)未能獲得普遍應(yīng)用。上海探普生物科技有限公司立志專門解決病毒方向的基因組研究難題,開發(fā)了整套的樣本處理和生信分析流程,基于這套流程,研究者們想對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測序就很容易實(shí)現(xiàn)了。水體微生物測序分析檢測