病毒的蛋白組成的特點(diǎn)是什么？ （1）結(jié)構(gòu)蛋白由病毒的基因組編碼，結(jié)構(gòu)蛋白組成病毒體的蛋白成分如病毒體的衣殼蛋白、基質(zhì)蛋白和包膜蛋白。?? （2）非結(jié)構(gòu)蛋白由病毒的基因組編碼，但非結(jié)構(gòu)蛋白不參與病毒體構(gòu)成的蛋白成分。非結(jié)構(gòu)蛋白可存在于病毒體內(nèi)，如病毒的酶就屬于非結(jié)構(gòu)蛋白，也可存在于侵染細(xì)胞。?? 病毒結(jié)構(gòu)蛋白有以下幾種功能：①病毒結(jié)構(gòu)蛋白可保護(hù)病毒核酸，避免環(huán)境中的核酸酶和其他理化因素對病毒核酸造成破壞；②病毒結(jié)構(gòu)蛋白可參與病毒的侵染過程，衣殼蛋白和包膜上的蛋白突起能吸附至易感細(xì)胞受體，引起侵染；③具有抗原***毒基因編碼的衣殼蛋白和包膜蛋白具有良好的抗原性，能刺激機(jī)體產(chǎn)生免疫反應(yīng)。對病毒全基因組進(jìn)行測序，是利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列。深度測序找哪家
目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進(jìn)行全基因組測定,分析其進(jìn)化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進(jìn)行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行序列拼接、比對、進(jìn)化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點(diǎn)分析.結(jié)果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt,該測定病毒屬E基因分支,序列與先前南非分離株Kakamas相似度較高(＞98％)。病毒Gn蛋白C端信號(hào)肽區(qū)存在1個(gè)氨基酸突變.結(jié)論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出現(xiàn)明顯變異。
廣州全基因組病毒分析檢測病毒全基因測序技術(shù)對疾病的致病原進(jìn)行全基因組測序研究，能發(fā)現(xiàn)其中的變異與遺傳情況。
對病毒的全基因組進(jìn)行測序時(shí)，生物信息學(xué)分析工作的進(jìn)行：生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進(jìn)行測序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，專門搭載了生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。生物信息學(xué)流程主要包括對非目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行去除以及對目標(biāo)序列進(jìn)行篩選，高質(zhì)量高完整度的序列拼接以及后續(xù)的高級(jí)分析，如SNP分析，進(jìn)化分析，耐藥位點(diǎn)分析等。在探普的專門用的流程下，可以獲得完整性很高的基因組序列。
未培養(yǎng)病毒基因組的信息標(biāo)準(zhǔn)：①關(guān)于未培養(yǎng)病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)的信息是在基因組標(biāo)準(zhǔn)框架內(nèi)制定的，包括病毒起源、基因組質(zhì)量、基因組注釋、分類信息、生物地理分布和宿主預(yù)測；②UViGs有助于提高我們對病毒進(jìn)化歷史和病毒-宿主之間相互作用的理解；③病毒基因組組成和內(nèi)容、復(fù)制策略和宿主的異常多樣性意味著UViGs的完整性、質(zhì)量、分類學(xué)和生態(tài)學(xué)需要通過病毒特異性指標(biāo)來評估；④分析不同大小和不同樣品類型的UViGs對于探索病毒基因組序列空白是有價(jià)值的。
測序覆蓋度是反映測序隨機(jī)性的指標(biāo)之一。
目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進(jìn)行全基因組測定,分析其進(jìn)化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進(jìn)行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行序列拼接、比對、進(jìn)化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點(diǎn)分析.結(jié)果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt,該測定病毒屬E基因分支,序列與先前南非分離株Kakamas相似度較高(＞98％)。病毒Gn蛋白C端信號(hào)肽區(qū)存在1個(gè)氨基酸突變.結(jié)論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出現(xiàn)明顯變異。
探普生物接觸到的病毒全基因組測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。廣州全基因組病毒分析檢測
病毒全基因組進(jìn)行測序，檢測人員利用病毒傳播過程中核酸序列上特定位置的變化來進(jìn)行分型。深度測序找哪家
病毒的基因重組特點(diǎn)是什么？ 滅活病毒間也會(huì)發(fā)生重組 ：例如用紫外線滅活的兩株同種病毒，一同培養(yǎng)?？墒箿缁畹牟《緩?fù)活產(chǎn)生出侵染性病毒體，此稱為多重復(fù)活（Multiplicity reactivation），這是因?yàn)閮煞N病毒核酸上受損害的基因部位不同，由于重組相互彌補(bǔ)而得到復(fù)活。因此現(xiàn)今不用紫外線滅活病毒制造疫苗，以防復(fù)活。 死活病毒間發(fā)生重組 ：例如將能在雞胚中生長良好的甲型流感病毒（A0或A1亞型）疫苗株經(jīng)紫外線滅活后，再加亞洲甲型（A2亞型）活流感病毒一同培養(yǎng)，產(chǎn)生出具有前者特點(diǎn)的A2亞型流感病毒，可供制作疫苗，此稱為交叉復(fù)活。深度測序找哪家