鄭州高通量測(cè)序進(jìn)化分析公司

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-10-25

能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)手段:早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前,對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)很長(zhǎng),但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。



探普生物專門針對(duì)病毒數(shù)據(jù)搭載了生物信息學(xué)分析流程。鄭州高通量測(cè)序進(jìn)化分析公司

深度測(cè)序技術(shù)對(duì)社會(huì)具有的影響:深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了基因檢測(cè)的普及,對(duì)社會(huì)的影響第1個(gè)方面反映在商業(yè)模式的變化,即醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和健康管理方面的平民化、個(gè)性化趨勢(shì)的形成。社會(huì)生活受到深度測(cè)序技術(shù)影響的第二個(gè)方面是基因測(cè)序的普遍應(yīng)用。例如,基因關(guān)聯(lián)將人與人通過(guò)遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)起來(lái),人們可以對(duì)基因進(jìn)行分析判定親緣關(guān)系,基因測(cè)定甚至可以幫助判定婚姻(包括遺傳病等方面的)匹配度。公安機(jī)關(guān)可以通過(guò)基因比對(duì),鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報(bào)道表明,測(cè)定20多個(gè)基因就可以將人臉重構(gòu)?;驒z測(cè)的應(yīng)用將隨著基因-表型的關(guān)聯(lián)得到更普遍的應(yīng)用,對(duì)社會(huì)生活的方方面面起到重要作用。鄭州高通量測(cè)序進(jìn)化分析公司探普生物病毒測(cè)序具備樣本準(zhǔn)備簡(jiǎn)單的優(yōu)點(diǎn)。

深度測(cè)序技術(shù)對(duì)經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)具有的影響:未來(lái)社會(huì)的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)將由信息技術(shù)向心理社會(huì)健康方面轉(zhuǎn)移??梢灶A(yù)見(jiàn),全球老年化社會(huì)到來(lái)后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)將是健康行業(yè),而以基因測(cè)序預(yù)測(cè)健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場(chǎng)將會(huì)越來(lái)越大。深度測(cè)序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)有兩個(gè)方面。一是測(cè)序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場(chǎng),二是測(cè)序應(yīng)用市場(chǎng)的競(jìng)爭(zhēng)。一個(gè)顯見(jiàn)的例子是,近年來(lái)深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了對(duì)肺病的進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和分型,更多的位點(diǎn)突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測(cè)肺病致病驅(qū)動(dòng)基因?qū)︶t(yī)生準(zhǔn)確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見(jiàn)的EGFR突變型為例,對(duì)于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進(jìn)行良好的調(diào)整和控制;但是對(duì)于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來(lái),病癥患者將獲得更具個(gè)性化的藥物,從而達(dá)到準(zhǔn)確醫(yī)療。


病毒全基因組測(cè)序定:探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對(duì)性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié),樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專門針對(duì)這一點(diǎn)開發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。



高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析.

DNA病毒基因組的測(cè)序:動(dòng)物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來(lái)指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測(cè)序需要了解序列、設(shè)計(jì)引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無(wú)需特異性引物擴(kuò)增的測(cè)序方式,可以直接從DNA中獲得序列。DNA病毒基因組測(cè)序:如果,1,您的目的是:獲得一種指定DNA病毒盡量完整的序列;2,您可以提供該病毒的中英文名稱;3,您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么,探普為你準(zhǔn)備了完整的下單、樣本準(zhǔn)備方法,經(jīng)過(guò)探普的實(shí)驗(yàn)、測(cè)序、分析,你將獲得:1,1-5Gb測(cè)序數(shù)據(jù)量rawdata;2,一般可獲得95%以上的拼接序列,100kb以上大基因組病毒除外;其他特殊要求如:突變分析、進(jìn)化分析都可直接與技術(shù)支持聯(lián)系。病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序以保證比較好的質(zhì)量進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。國(guó)內(nèi)病毒全序列測(cè)序進(jìn)化分析服務(wù)

病毒全基因測(cè)序不僅需要精密的儀器設(shè)備,也需要檢測(cè)人員具有豐富的經(jīng)驗(yàn)和過(guò)硬的技術(shù)。鄭州高通量測(cè)序進(jìn)化分析公司

對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí),生物信息學(xué)分析工作的進(jìn)行:生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),專門搭載了生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。生物信息學(xué)流程主要包括對(duì)非目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行去除以及對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行篩選,高質(zhì)量高完整度的序列拼接以及后續(xù)的高級(jí)分析,如SNP分析,進(jìn)化分析,耐藥位點(diǎn)分析等。在探普的專門用的流程下,可以獲得完整性很高的基因組序列。


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