探普生物進(jìn)行病毒基因組測序的流程：在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單，簡而言之，客戶只需要說清楚樣品情況，準(zhǔn)備樣品即可，其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下：1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況；2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同，雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章；3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本，填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰，安排樣本寄運(yùn)輸；4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款，探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測序報(bào)告；5)客戶支付項(xiàng)目尾款，探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；6)售后問題處理，項(xiàng)目結(jié)題。
從事病原流行病學(xué)監(jiān)測和研究的工作者需要將病毒全基因組測序結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)。DNA高通量測序進(jìn)化分析診斷
RNA/DNA病毒測序?qū)Σ《净蚪M進(jìn)行測序是快速了解病毒突變、毒力變化、病毒型別的有效方法?？梢愿鶕?jù)病毒基因組大小和類型，采用PCR、RT-PCR或shotgun測序法，對病毒的部分或全長基因組測序，結(jié)果準(zhǔn)確可靠。服務(wù)標(biāo)準(zhǔn):測出的序列準(zhǔn)確性在99%以上;病毒全基因組測序測出序列在總基因組大小95%以上;數(shù)小于5個(gè);Shotgun測序的覆蓋度在6以上;PCR和RT-PCR測序達(dá)到2。服務(wù)說明：1、提供病毒DNA或RNA作為樣品。2、PCR測序的DNA樣品總量大于5μg，濃度大于20ng/μl。DNA無降解。3、Shotgun測序法的DNA樣品總量大于20μg，濃度大于100ng/μl。DNA無降解。4、用RT-PCR和PCR測序法在提供參考序列時(shí)需同時(shí)提交樣品部分序列與參考序列的比對文件，確保同源性在95%以上。
DNA病毒基因測序病毒全基因組進(jìn)行測序，檢測人員利用病毒傳播過程中核酸序列上特定位置的變化來進(jìn)行分型。
第二代測序技術(shù)的發(fā)展：第二代測序技術(shù)(nextgene-rationsequencing,NGS)發(fā)展迅猛，與Sanger測序技術(shù)相比,NGS是一種能一次對幾十萬到幾百萬的DNA分子進(jìn)行序列測定的高通量的測序技術(shù),這種高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌地分析成為可能,因此又被稱為深度測序(deepsequencing).相比傳統(tǒng)的個(gè)體基因組測序,NGS使得測序價(jià)格日益廉價(jià),并且在生物信息學(xué)軟件的輔助下,可以將大量不同基因片段的信息連接起來進(jìn)行基因組組裝,完成生物的基因組測序，這種新的測序技術(shù)革新了植物病毒的診斷方法,對于病毒的流行病學(xué)和生態(tài)學(xué)研究起到了非常重要的推動(dòng)作用。
高通量測序技術(shù)又稱“下一代“測序技術(shù)或深度測序技術(shù)，可以一次性對幾十萬至幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定?，F(xiàn)已普遍應(yīng)用在基因組測序、基因表達(dá)分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉(zhuǎn)錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關(guān)的研究領(lǐng)域。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定，因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時(shí)代的改變，同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。
病毒全基因組測序具有的特點(diǎn)：完善的售后服務(wù)。
深度測序技術(shù)對社會(huì)的影響：深度測序技術(shù)促進(jìn)了基因檢測的普及，對社會(huì)的影響第1個(gè)方面反映在商業(yè)模式的變化，即醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和健康管理方面的平民化、個(gè)性化趨勢的形成。社會(huì)生活受到深度測序技術(shù)影響的第二個(gè)方面是基因測序的普遍應(yīng)用。例如，基因關(guān)聯(lián)將人與人通過遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)起來，人們可以對基因進(jìn)行分析判定親緣關(guān)系，基因測定甚至可以幫助判定婚姻（包括遺傳病等方面的）匹配度。公安機(jī)關(guān)可以通過基因比對，鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報(bào)道表明，測定20多個(gè)基因就可以將人臉重構(gòu)?；驒z測的應(yīng)用將隨著基因-表型的關(guān)聯(lián)得到更普遍的應(yīng)用，對社會(huì)生活的方方面面起到重要作用。
高通量測序技術(shù)本身并不是以病毒為目標(biāo)開發(fā)的。病毒序列測序進(jìn)化分析方法
團(tuán)隊(duì)具備普通測序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)。DNA高通量測序進(jìn)化分析診斷
病毒全基因組測序注意事項(xiàng)：病毒全基因組測序，測序覆蓋度，基因組被測序得到的堿基覆蓋的比例；測序覆蓋度是反映測序隨機(jī)性的指標(biāo)之一；測序序深度與覆蓋度之間的關(guān)系可以過Lander-WatermanModel（1988）來確定。當(dāng)深度達(dá)到5X時(shí)，則可覆蓋基因組的約99.4%以上。通過生物信息手段，分析不同個(gè)體基因組間的結(jié)構(gòu)差異，同時(shí)完成SNP及基因組結(jié)構(gòu)注釋。DNA突變可誘發(fā)病癥。吸煙過程中所釋放的>60種致病化學(xué)物質(zhì)可與DNA結(jié)合并對DNA鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進(jìn)行化學(xué)修飾從而產(chǎn)生大的加合物，該加合物改變了DNA雙螺旋的結(jié)構(gòu)，如果不被核苷酸剪切修復(fù)或其他的途徑進(jìn)行糾正，那么DNA在復(fù)制時(shí)就會(huì)按照non-Watson-Crick方式進(jìn)行復(fù)制并阻止RNA聚合酶進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。
DNA高通量測序進(jìn)化分析診斷