病毒宏基因組測序：在運用宏基因組測序方法檢測的樣本量位居全球前列，樣本總數(shù)居國內第二，其中腦脊液檢測量位列全球前二強。除了傳染病的應用場景之外，利用mNGS還可以對菌群進行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測，適用于抗傳染院內傳染管理的評估。在越來越多的證據(jù)表明微生物對人體免疫系統(tǒng)能夠產生影響，以及微生物菌群會參與到神經(jīng)退行性疾病、糖尿病等疾病的發(fā)生和發(fā)展當中，微生物療法獲得了越來越多的關注，而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態(tài)、研究微生物療法提供一種可靠的技術手段。微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用。江蘇水體微生物多樣性測序排行
宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質的總和，宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象，不需對微生物進行分離培養(yǎng)，而是提取環(huán)境微生物總DNA進行研究。其擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術限制，在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度，探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關系。目前，第二代高通量測序技術在宏基因組的研究上已被普遍應用。第二代高通量測序平臺具有通量高、準確性高、速度快、信息全等特點，加快了宏基因組測序在鑒定低豐度的微生物群落，挖掘更多基因資源方面的應用。杭州宏病毒學測序分析病毒的全基因組測序以及對應的生物信息學分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關系。
新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢，人類想要征服新發(fā)人畜共患病，就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原，并針對新病原進行基因組分析、流行病學調查、致病機制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學是在宏基因組學基礎上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術，該技術結合深度測序技術（第二代、第三代測序技術）已經(jīng)在人類、動物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒，該技術不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列，在國內外被普遍應用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷。就病毒宏基因組學在動物病毒研究中的應用及研究進展進行了介紹。
宏基因組測序技術注意事項：傳統(tǒng)微生物檢測由于時間長、陽性率低、檢測目標單一，限制了傳染疾病的診治。宏基因組測序技術不依賴于微生物的分離培養(yǎng)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術限制，為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略。宏基因組測序以無需純化培養(yǎng)、能夠快速全方面的展示序列信息的優(yōu)勢，逐步在臨床上得到了普遍應用。病原宏基因組測序檢測出病原體并報告相應被檢測出的序列數(shù)，再依據(jù)大數(shù)據(jù)庫判定是否為致病病原體。然而不同的測序平臺采用不同的數(shù)據(jù)庫，再由不同的研發(fā)、臨床和檢驗專家解讀，缺乏統(tǒng)一標準，結果也會出現(xiàn)差異。因此仍需將病原宏基因組測序檢測數(shù)據(jù)和臨床更好的結合，從而更準確鑒定致病病原體。病毒全基因組測序產品特點：獨特的定量技術，實現(xiàn)病原定量分析，使病原診斷更準確。
用二代測序對樣本進行宏病毒組測序具有的挑戰(zhàn)：二代測序技術基本流程是核酸純化-文庫構建-生物信息學分析。用二代測序對樣本進行宏病毒組測序，每一步都是很大的挑戰(zhàn)。無論是來自腸道還是水體或者土壤，樣本都會伴隨基因組數(shù)倍于病毒的細菌和宿主細胞。為了提高數(shù)據(jù)有效利用率，首先，樣本處理和核酸純化需要有的放矢。文庫構建時，由于病毒基因組核酸存在多種可能，建庫成本的把控、文庫保真度、建庫成功率對于生產者和研究者都是極大的挑戰(zhàn)。而生信分析，由于病毒并不像細菌一樣研究透徹，具備龐大的數(shù)據(jù)庫，目前國內外的分析水平也是參差不齊。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法依賴于表型鑒定。水體微生物多樣性分析原理
高通量測序技術問世，給微生物鑒別打開一扇新的大門。江蘇水體微生物多樣性測序排行
宏病毒組分析的常用軟件：介紹之前首先我們來看一下宏病毒組的基本分析流程。這里需要說明的是基于病毒顆粒分離技術及NGS測序平臺的宏病毒組學研究還處于起步階段，分析功能模塊新的思路和技術層出不窮，但另一個層面，宏病毒組是宏基因組的一個分支，基本大的分析思路方面與宏基因組還是有著不小的相似之處。歸納一下，宏病毒組主要包括一下幾個方面的分析內容：病毒群落結構組成分析；病毒群落功能分析；病毒（特別是噬菌體）宿主預測；病毒與群落中細菌、古菌等其他微生物之間的互作網(wǎng)絡；基于非數(shù)據(jù)庫比對的新病毒序列的挖掘。江蘇水體微生物多樣性測序排行
上海探普生物科技有限公司是一家從事病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定研發(fā)、生產、銷售及售后的服務型企業(yè)。公司坐落在放鶴路1088號6號樓307，成立于2018-10-30。公司通過創(chuàng)新型可持續(xù)發(fā)展為重心理念，以客戶滿意為重要標準。探普目前推出了病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定等多款產品，已經(jīng)和行業(yè)內多家企業(yè)建立合作伙伴關系，目前產品已經(jīng)應用于多個領域。我們堅持技術創(chuàng)新，把握市場關鍵需求，以重心技術能力，助力醫(yī)藥健康發(fā)展。上海探普生物科技有限公司每年將部分收入投入到病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定產品開發(fā)工作中，也為公司的技術創(chuàng)新和人材培養(yǎng)起到了很好的推動作用。公司在長期的生產運營中形成了一套完善的科技激勵政策，以激勵在技術研發(fā)、產品改進等。上海探普生物科技有限公司注重以人為本、團隊合作的企業(yè)文化，通過保證病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定產品質量合格，以誠信經(jīng)營、用戶至上、價格合理來服務客戶。建立一切以客戶需求為前提的工作目標，真誠歡迎新老客戶前來洽談業(yè)務。