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宏基因組測(cè)序相關(guān)知識(shí):宏基因組測(cè)序是對(duì)人體樣本或特定環(huán)境樣品中的總核酸(DNA或RNA)進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù),得到傳染病原體的信息,能夠檢測(cè)出新發(fā)和罕見(jiàn)病原體,特別是在未知病原檢測(cè)中發(fā)揮了難以替代的作用,當(dāng)然宏基因組檢測(cè)方法也面臨不少挑戰(zhàn),檢測(cè)結(jié)果的靈敏度受宿主及其他微生物背景核酸的影響。高通量測(cè)序技術(shù)能夠提供準(zhǔn)確而科學(xué)的基因測(cè)序分析結(jié)果,為病情防控提供有力技術(shù)保障??茖W(xué)家通過(guò)對(duì)病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序,可以了解病毒不同傳播階段的變異情況,推測(cè)病毒對(duì)人的傳染力的變化及傳播情況。病原微生物二代測(cè)序是目前臨床上針對(duì)病原較常用的基因測(cè)序方法。安徽水體微生物多樣性分析
病毒宏基因組學(xué)的相關(guān)知識(shí):病毒是引發(fā)人畜共患病的主要病原體之一,伴隨環(huán)境、生態(tài)和人類行為等各方面因素的變化,新發(fā)人畜共患病也呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢(shì),它們極大地威脅著人類和動(dòng)物的健康和生命,并給畜牧業(yè)和農(nóng)業(yè)的健康發(fā)展以及自然界生態(tài)鏈的平衡帶來(lái)危害及災(zāi)難。然而,許多新發(fā)人畜共患病的病原初往往是未知的,如1986年的牛海綿狀腦病、1999年的尼帕病毒、2003年的SARS冠狀病毒、1997至今不斷變異的高致病性禽流感H5和H;7、2009年的甲型H1N1、2010年的布尼亞病毒,它們都經(jīng)歷了一個(gè)從未知到己知的探索過(guò)程。為此,及早地發(fā)現(xiàn),鑒別未知的或新出現(xiàn)的病原,是有效預(yù)防和控制傳染病的先決條件之一。傳統(tǒng)的診斷技術(shù)已不能滿足提前預(yù)警或快速診斷新發(fā)人畜共患病的需求。近年來(lái),病毒宏基因組學(xué)的出現(xiàn)和興起,為人類診斷新發(fā)人畜共患病和探索潛在的病原提供了巨大的幫助。北京皮膚微生物多樣性測(cè)序分析診斷病毒宏基因組測(cè)序需要客戶配合完成合格的取樣步驟和樣本前處理步驟。
人類想要征服新發(fā)人畜共患病,只有提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原,并針對(duì)新病原進(jìn)行基因組分析、流行病學(xué)調(diào)查、疫苗和抗體的開(kāi)發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù),該技術(shù)結(jié)合深度測(cè)序技術(shù)(第二代、第三代測(cè)序技術(shù))已經(jīng)在人類、動(dòng)物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒,該技術(shù)不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列,在國(guó)內(nèi)外被普遍應(yīng)用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷。總之,隨著病毒宏基因組學(xué)與各種新的分子生物學(xué)技術(shù)及深度測(cè)序技術(shù)的結(jié)合,該技術(shù)展現(xiàn)了區(qū)別于傳統(tǒng)病毒診斷技術(shù)的優(yōu)勢(shì),而該技術(shù)對(duì)動(dòng)物病毒的挖掘及其他領(lǐng)域的應(yīng)用將更加普遍。
病原宏基因組測(cè)序(mNGS)可與實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-PCR)技術(shù)聯(lián)合使用,實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)?!癛T-PCR由于其檢測(cè)速度快、操作流程簡(jiǎn)單、成本較低的原因,更適用于大規(guī)模的篩查中,以便快速獲得是否為核酸陽(yáng)性的初步證據(jù),而對(duì)于RT-PCR檢測(cè)陰性、但臨床表型高度疑似的患者,利用mNGS進(jìn)一步確認(rèn)可有效提高檢測(cè)結(jié)果的可靠性,并獲得是否有其他病原體傳染的信息?!睂?duì)于RT-PCR檢測(cè)陽(yáng)性的樣本,也可以進(jìn)一步利用mNGS進(jìn)行病毒全序列的分析,從而幫助獲得病毒是否發(fā)生變異的信息,為疫苗、藥物研發(fā)等方面提供可靠證據(jù)。DNA宏基因組測(cè)序的病原檢出率均高于培養(yǎng)等傳統(tǒng)方法,表現(xiàn)出好的診斷性能。
對(duì)于病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序價(jià)格合理;樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的組裝效果?其他公司對(duì)用于測(cè)序的樣本的要求較高。探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是基于探普的專有流程,樣本要求非常低,不要求粒子純化,不要求總量到達(dá)微克,按探普的專門(mén)的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程進(jìn)行即可。簡(jiǎn)言之,經(jīng)過(guò)細(xì)胞或其他方式培養(yǎng)的樣本,若載量較高,不需要復(fù)雜處理,直接破碎細(xì)胞取上清提取核酸都可以獲得非常好的組裝效果;而臨床標(biāo)本,需要看情況,對(duì)于被侵害嚴(yán)重的個(gè)體,釋放較高的部位也可以獲得很好的效果;其他類型的樣本,就需要測(cè)ct值來(lái)確定是否可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn),以及評(píng)估測(cè)序效果。在傳統(tǒng)的診斷檢測(cè)中對(duì)病原體的診斷檢測(cè)是通過(guò)體外培養(yǎng)的方式進(jìn)行的。皮膚微生物分析公司
對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序于臨床,能輔助臨床醫(yī)生進(jìn)行微生物侵染類疾病診斷并在一定程度提供用藥指導(dǎo)。安徽水體微生物多樣性分析
在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果?其他公司對(duì)用于測(cè)序的樣本的要求較高。而在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,基于探普的專有流程,樣本要求非常低,不要求總量到達(dá)微克,探普有專門(mén)的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程。為了保證后續(xù)數(shù)據(jù)的有效利用率,需要客戶配合完成合格的取樣步驟和樣本前處理步驟。當(dāng)然探普也提供適當(dāng)?shù)臉颖咎幚矸?wù)。核酸性質(zhì)有RNA和DNA之分,核酸鏈還有單雙鏈之分,而核酸本質(zhì)不同和單雙鏈的不同,進(jìn)行同樣的實(shí)驗(yàn)步驟其效率也不一樣。這些特點(diǎn)決定了宏基因組測(cè)序是相對(duì)個(gè)性化定制化的一類服務(wù),出于對(duì)結(jié)果真實(shí)性的尊重和保證,需要客戶和銷售人員充分溝通,設(shè)定合理的樣本處理方案。安徽水體微生物多樣性分析
上海探普生物科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。上海探普生物致力于為客戶提供良好的病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠(chéng)信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。上海探普生物立足于全國(guó)市場(chǎng),依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,融合前沿的技術(shù)理念,飛快響應(yīng)客戶的變化需求。