eProteinDiscovery系統(tǒng):一種將無細胞蛋白合成與數(shù)字微流控相結(jié)合的快速蛋白質(zhì)原型系統(tǒng)傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)表達純化流程十分依賴人工操作,并且往往需要幾周甚至更久。無細胞蛋白表達的興起可將這一時間縮短至十幾個小時,但是仍需要現(xiàn)進行表達載體的制備,體外擴增和高通量蛋白表達然后再進行篩選等多步操作。Nuclera將這些復(fù)雜的流程ji he到eProteinDiscovery系統(tǒng)。該系統(tǒng)使用基于數(shù)字微流控的智能卡盒、無細胞蛋白質(zhì)合成和熒光蛋白檢測技術(shù),使研究人員更容易大規(guī)模獲取高質(zhì)量蛋白質(zhì)。只要將目標蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達,然后將表達載體裝載到機器上,該系統(tǒng)就會通過自動化構(gòu)建篩選(可同時篩24種構(gòu)建體x8種無細胞混合物=192種表達條件),在48小時內(nèi),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui Jia表達條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用。該工作流程jin需3步,可生產(chǎn)18kDa~300kDa的蛋白質(zhì),還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體。線性化質(zhì)粒經(jīng)酚氯純化后(濃度≥0.5 μg/μL),適用于 ??T7 啟動子介導(dǎo)的體外蛋白表達??。大腸桿菌誘導(dǎo)蛋白表達方法
無細胞蛋白表達技術(shù)(CFPS)的操作確實比傳統(tǒng)細胞表達更繁瑣,主要體現(xiàn)在多步驟的體系配置上。實驗者需要精確配制包含裂解物、能量混合物(ATP/GTP)、氨基酸、輔因子(Mg2?、K?)和DNA/mRNA模板的復(fù)雜反應(yīng)體系,且各組分濃度需嚴格優(yōu)化(如Mg2?濃度波動1 mM就可能導(dǎo)致表達失敗)。此外,裂解物制備本身涉及細胞培養(yǎng)、破碎、離心透析等步驟,若直接購買商業(yè)化裂解物(如RTS 100),單次成本可能高達數(shù)百元。對于新手而言,反應(yīng)條件的微調(diào)(pH、溫度、氧化還原環(huán)境)往往需要多次試錯,增加了實驗難度。大腸桿菌重組蛋白表達兔網(wǎng)織紅細胞裂解物??含??成熟血紅蛋白合成機制??,能準確折疊多結(jié)構(gòu)域蛋白。
無細胞蛋白表達技術(shù)(CFPS)雖然具有快速、靈活等優(yōu)勢,但仍存在一些關(guān)鍵缺點。首先,成本較高,商業(yè)化裂解物、能量試劑和酶的價格昂貴,小規(guī)模實驗單次反應(yīng)成本可達數(shù)百元,大規(guī)模生產(chǎn)的經(jīng)濟性尚未完全解決。其次,蛋白產(chǎn)量較低,反應(yīng)通常在幾小時內(nèi)終止,產(chǎn)量(0.1-1 mg/mL)遠低于細胞表達系統(tǒng)(如大腸桿菌可達10 mg/mL以上)。此外,復(fù)雜蛋白表達受限,原核裂解物缺乏真核翻譯后修飾能力(如糖基化),而真核裂解物成本更高;部分蛋白可能因折疊不完全而喪失活性。技術(shù)操作上,反應(yīng)條件(pH、離子強度等)需精細調(diào)控,且線性DNA模板易降解,增加了實驗難度。CFPS目前更適合小規(guī)模應(yīng)用,在超長蛋白(>100 kDa)表達和工業(yè)化連續(xù)生產(chǎn)方面仍面臨挑戰(zhàn)。未來需通過開發(fā)低成本試劑、優(yōu)化能量再生系統(tǒng)和自動化工藝來突破這些瓶頸。
在中國,無細胞蛋白表達技術(shù)(CFPS)的推廣面臨he xin原料依賴進口的挑戰(zhàn)。商業(yè)化裂解物、高效能量再生系統(tǒng)等關(guān)鍵試劑仍以Thermo Fisher、Merck等國際品牌為主,國產(chǎn)替代品在活性和穩(wěn)定性上存在差距,導(dǎo)致成本居高不下。此外,無細胞蛋白表達技術(shù)工藝的規(guī)?;糯蠹夹g(shù)尚未成熟,反應(yīng)體系均一性、產(chǎn)物收率等問題限制了其在GMP生產(chǎn)中的應(yīng)用。盡管國內(nèi)科研機構(gòu)(如中科院、清華大學(xué))在基礎(chǔ)研究上取得突破,但產(chǎn)學(xué)研轉(zhuǎn)化效率較低,缺乏類似Synthelis的專注無細胞蛋白表達技術(shù)的本土企業(yè),難以形成完整的產(chǎn)業(yè)鏈條。大腸桿菌裂解物添加含T7啟動子的線性DNA后,利用其??高密度核糖體??快速啟動蛋白表達。
無細胞蛋白表達技術(shù)CFPS的開放體系特性使其對實驗環(huán)境極為敏感。裂解物中的酶活性會隨凍融次數(shù)下降,需分裝保存并避免反復(fù)凍融;反應(yīng)中核酸酶殘留可能導(dǎo)致模板降解,常需額外添加抑制劑(如RNasin)。此外,不同批次的裂解物活性可能存在差異,導(dǎo)致實驗結(jié)果難以重復(fù)。例如,某研究組發(fā)現(xiàn)同一模板在連續(xù)三次實驗中蛋白產(chǎn)量波動達30%,后來通過標準化裂解物制備流程(如固定細胞生長OD值)才解決該問題。這些細節(jié)要求使得CFPS的操作容錯率較低。大腸桿菌體外蛋白表達??的成本只為兔網(wǎng)織紅細胞系統(tǒng)的1/20,適合大規(guī)模篩選。his蛋白表達條件篩選
使用T7 RNA聚合酶合成加帽mRNA,可提升??真核體外蛋白表達??效率。大腸桿菌誘導(dǎo)蛋白表達方法
體外蛋白表達已成為生物學(xué)教學(xué)的高效工具。高中生使用 “GFP 熒光蛋白表達試劑盒”(含凍干裂解物和 pET-28a-GFP 質(zhì)粒),加水混合后在 37℃ 培養(yǎng)箱放置 2 小時,紫外燈下即可觀察到綠色熒光,直觀演示“基因→蛋白→功能”的中心法則。美國 Bio-Rad 公司推出的教育套件年銷量超 10 萬套,實驗成功率 >95%。在合成生物學(xué)領(lǐng)域,該技術(shù)助力學(xué)生設(shè)計 人工生物回路:如將乳糖操縱子序列與紅色熒光蛋白基因融合,添加 IPTG 后 3 小時啟動表達,通過熒光強度量化啟動子活性。這種 “當日設(shè)計,當日驗證” 的模式,極大加速了生命科學(xué)創(chuàng)新人才的培養(yǎng)進程。大腸桿菌誘導(dǎo)蛋白表達方法