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1、從DNA到106μg純化蛋白的時(shí)間不到48小時(shí)
2、Biacore檢測(cè)證實(shí)VEGF165與貝伐珠單抗結(jié)合具有功能活性,親和力達(dá)36pM通過(guò)eProteinDiscovery系統(tǒng)進(jìn)行快速無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)與純化篩選,次日即可進(jìn)行蛋白放大生產(chǎn),這一組合縮短了獲取高質(zhì)量蛋白以在Biacore系統(tǒng)上進(jìn)行功能驗(yàn)證的時(shí)間。
英國(guó)Nuclera公司由劍橋大學(xué)的博士生們于2013年創(chuàng)立。在撰寫(xiě)論文期間,他們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)難以獲取的問(wèn)題是生物學(xué)領(lǐng)域的首要障礙和關(guān)鍵瓶頸。他們著手解決蛋白質(zhì)難以獲取的問(wèn)題,以期改善人類健康狀況。公司的愿景是打造出從DNA到蛋白質(zhì)的原型設(shè)計(jì)系統(tǒng),以減少在藥物發(fā)現(xiàn)計(jì)劃中獲得靶蛋白的時(shí)間和障礙。上海曼博生物是Nuclera品牌的官方代理商。如咨詢產(chǎn)品信息,歡迎咨詢! CHO細(xì)胞重組蛋白表達(dá)??是生產(chǎn)抗體的常用技術(shù)。常見(jiàn)蛋白表達(dá)流程
B淋巴細(xì)胞抗原CD19是一種跨膜糖蛋白,為B細(xì)胞惡性zhong Liu生物標(biāo)志物、CAR-T等療法理想靶點(diǎn),包含單個(gè)跨膜螺旋(292-313)、天然信號(hào)肽(1-20)、胞外N端結(jié)構(gòu)域(ECD)和胞內(nèi)C端結(jié)構(gòu)域(ICD)。其ECD有兩個(gè)通過(guò)二硫鍵連接的免疫球蛋白樣C2型結(jié)構(gòu)域,ICD有多個(gè)無(wú)序區(qū)域。生產(chǎn)CD19,尤其是ECD對(duì)開(kāi)發(fā)新的B細(xì)胞淋巴瘤Zhi liao方法十分重要。然而,ECD素來(lái)有“難表達(dá)”的特點(diǎn),會(huì)導(dǎo)致表達(dá)滴度低、蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊和聚集,阻礙了對(duì)細(xì)胞表面分子的詳細(xì)分子研究。在本應(yīng)用中,我們利用eProteinDiscovery系統(tǒng)的可溶性標(biāo)簽選擇功能和無(wú)細(xì)胞混合物,在24小時(shí)內(nèi)篩選了192種表達(dá)條件,優(yōu)化了可溶性CD19蛋白的生產(chǎn)(如圖1所示)。我們成功表達(dá)并純化了全長(zhǎng)CD19、ECD和ICD。篩選完成后,在24小時(shí)內(nèi)將適合條件進(jìn)行放大,可生產(chǎn)微克級(jí)的蛋白質(zhì),從而實(shí)現(xiàn)了Zhi liao研究所需復(fù)雜蛋白質(zhì)的提效生產(chǎn)。本應(yīng)用為表達(dá)其他具有跨膜結(jié)構(gòu)域、二硫鍵和高度無(wú)序區(qū)域的“難表達(dá)”蛋白質(zhì)提供了參考。定制蛋白表達(dá)當(dāng)體外蛋白表達(dá)效率不足時(shí),需檢測(cè)模板完整性并優(yōu)化啟動(dòng)子強(qiáng)度。
一批技術(shù)驅(qū)動(dòng)型初創(chuàng)公司正在細(xì)分領(lǐng)域嶄露頭角。例如,Synthelis(法國(guó))專注于膜蛋白生產(chǎn),其裂解物可實(shí)現(xiàn)GPCRs和離子通道的高效合成;ArborBiotechnologies(美國(guó))則通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)優(yōu)化無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)反應(yīng)條件,用于CRISPR酶和定制化蛋白的快速開(kāi)發(fā)。此外,GreenlightBiosciences(現(xiàn)已與Prenetics合并)將無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)與mRNA技術(shù)結(jié)合,推動(dòng)低成本疫苗和RNA療法生產(chǎn)。這些企業(yè)通常以授權(quán)合作或定制化服務(wù)模式,與藥企(如輝瑞、Moderna)建立深度綁定,加速技術(shù)商業(yè)化落地。
無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)的興起可將這一時(shí)間縮短至十幾個(gè)小時(shí),但是仍需要現(xiàn)進(jìn)行表達(dá)載體的制備,體外擴(kuò)增和高通量蛋白表達(dá)然后再進(jìn)行篩選等多步操作。Nuclera將這些復(fù)雜的流程ji he到eProteinDiscovery系統(tǒng)。該系統(tǒng)使用基于數(shù)字微流控的智能卡盒、蛋白質(zhì)質(zhì)量檢測(cè)和無(wú)細(xì)胞蛋白合成,使研究人員更容易快速獲取高質(zhì)量蛋白質(zhì)。只要將目標(biāo)蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達(dá),然后將表達(dá)載體裝載到機(jī)器上,該系統(tǒng)就會(huì)通過(guò)自動(dòng)化構(gòu)建篩選(可同時(shí)篩24種DNA構(gòu)建體x8種無(wú)細(xì)胞混合物=192種獨(dú)特表達(dá)條件),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui 佳表達(dá)條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用,從DNA到可用于分析檢測(cè)的蛋白質(zhì)只需要48小時(shí)。系統(tǒng)已生產(chǎn)超過(guò)2,000種蛋白質(zhì),包含多種類型,其中約77%的人類蛋白。蛋白質(zhì)類型包括伴侶蛋白、水解酶、連接酶、氧化還原酶、信號(hào)蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白和轉(zhuǎn)移酶等,分子量范圍為18kDa~300kDa(平均:46kDa)。獲得的難表達(dá)蛋白包括膜蛋白、含二硫鍵的蛋白和含高度無(wú)序結(jié)構(gòu)的蛋白等,還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體。兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解物??含??成熟血紅蛋白合成機(jī)制??,能實(shí)現(xiàn)復(fù)雜酶活性分子的功能性蛋白表達(dá)。
在小規(guī)模、快速驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)中,無(wú)細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)(CFPS)的性價(jià)比優(yōu)勢(shì)明顯。其單次反應(yīng)成本約200-500元(含商業(yè)化裂解物和模板),雖高于大腸桿菌發(fā)酵的試劑成本,但可節(jié)省大量時(shí)間——傳統(tǒng)細(xì)胞表達(dá)需3-5天(含轉(zhuǎn)化、培養(yǎng)、誘導(dǎo)),而CFPS只需4-8小時(shí)即可獲得ug-mg級(jí)蛋白,尤其適合藥物篩選、突變體庫(kù)構(gòu)建等時(shí)效性需求。例如,某CRO公司采用CFPS一周內(nèi)完成50種抗體變體的活性測(cè)試,而傳統(tǒng)方法只能完成5-10種,人力與設(shè)備成本大幅降低。添加 0.1% Triton X-100 使疏水蛋白的體外表達(dá)可溶率達(dá)90%??。常見(jiàn)蛋白表達(dá)流程
體外蛋白表達(dá)需使用??不含質(zhì)粒骨架的模板??以避免副反應(yīng)。常見(jiàn)蛋白表達(dá)流程
體外蛋白表達(dá)技術(shù)的重點(diǎn)在于利用細(xì)胞裂解物中的生物合成機(jī)器(核糖體、tRNA、翻譯因子)在試管中直接合成蛋白質(zhì)。以大腸桿菌系統(tǒng)為例:首先制備含T7啟動(dòng)子的線性DNA模板,將其與商業(yè)化裂解物(如RocheRTS100)、能量混合物(ATP/GTP)及20種氨基酸混合,在37℃振蕩反應(yīng)2-4小時(shí)即可完成蛋白表達(dá)。整個(gè)過(guò)程無(wú)需細(xì)胞培養(yǎng)與基因轉(zhuǎn)染,速度比傳統(tǒng)方法快10倍以上。例如,COVID19刺突蛋白R(shí)BD結(jié)構(gòu)域的體外表達(dá)只需6小時(shí),而HEK293細(xì)胞系統(tǒng)需5天。該技術(shù)的關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)是開(kāi)放體系的可編程性——可直接添加非天然氨基酸(如Azidohomoalanine)合成定制化蛋白,為藥物偶聯(lián)物開(kāi)發(fā)提供高效平臺(tái)。常見(jiàn)蛋白表達(dá)流程