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空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中,通過添加基因表達(dá)維度,得出形態(tài)學(xué)結(jié)論,通過觀察基因表達(dá)區(qū)域,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué),研究免疫細(xì)胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征;免疫群體擴(kuò)散、不同類型免疫細(xì)胞的空間位置解析; 在神經(jīng)科學(xué),研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學(xué),通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征,解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因;豐富基因表達(dá)的空間注釋信息,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。自主研發(fā)PanoCell單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測序平臺。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
其實(shí),空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復(fù)雜、檢測精度不準(zhǔn)確、基因和細(xì)胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達(dá)解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,聯(lián)合上線單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細(xì)胞TCR-Seq、單細(xì)胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息。烈冰生物為您提供貼心的單細(xì)胞研究完整解決方案!溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)十二年測序經(jīng)驗(yàn),累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強(qiáng)大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)??臻g轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。
為同時獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題,針對FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly(dA)序列進(jìn)行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針(RTL)與mRNA雜交。左側(cè)探針(LHS)具有部分Read 2序列,右側(cè)探針(RHS)具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接,而mRNA被RNase降解。組織透化后,被連接的成對探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT)序列的引物序列捕獲,并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進(jìn)行測序文庫構(gòu)建和測序。測序序列上的空間Barcode用于將測序序列定位到組織切片圖像上,UMI用于基因表達(dá)定量。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù)。
空間組測序技術(shù),作為現(xiàn)階段單細(xì)胞技術(shù)的重要補(bǔ)充技術(shù)進(jìn)入了組學(xué)的實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過單細(xì)胞測序(單細(xì)胞表達(dá)尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達(dá)尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細(xì)胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),也是重中之重??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。合肥上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組平臺
空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認(rèn)的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn)。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,可以說,基因測序技術(shù)將是下一個改變世界的技術(shù)。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境。在烈冰生物近多年發(fā)展歷史,公司旗下現(xiàn)有品牌NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造等。我公司擁有強(qiáng)大的技術(shù)實(shí)力,多年來一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的發(fā)展和創(chuàng)新,打造高指標(biāo)產(chǎn)品和服務(wù)。誠實(shí)、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則。公司致力于打造***的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。