烈冰科技作為國內(nèi)率先同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。長沙高通量測序單細胞測序服務公司
二代測序技術在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencingbysynthesis)和大規(guī)模平行測序技術(massiveparallelanalysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,例如IlluminaSolexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3和5端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,用于結合測序通道上的位點;3)Primerbindingsite,用于結合PCR引物啟動擴增反應。
吉林10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺烈冰單細胞測序,助力您的深入科學探究。
一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲,小心得不償失,原因在這:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個細胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當細胞捕獲數(shù)過多時,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù),都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時,數(shù)據(jù)量在100G左右時,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。
作為單細胞測序的一個重要里程碑,10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution,此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析,繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜。以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關系。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務。
單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。全線搭建10X Genomics Chromium X單細胞實驗測序平臺。長春單細胞測序服務機構
高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。長沙高通量測序單細胞測序服務公司
單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。長沙高通量測序單細胞測序服務公司
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢,是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術服務、技術轉(zhuǎn)讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提供高質(zhì)量的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念,影響并帶動團隊取得成功。烈冰生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。