烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!BD 單細胞捕獲平臺搭配BD Scanner,全流程實時質(zhì)控,項目質(zhì)量盡在掌握。濟南scRNA單細胞測序服務(wù)
單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。蘇州BD單細胞多組學(xué)測序烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。
針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn),每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。
從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細胞生物學(xué)視角。通過單細胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力醫(yī)療健康時代!
烈冰生物搭建近10臺BD Rhapsody平臺,目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù),BD Rhapsody平臺采用U型微孔板,1個板即對應(yīng)1個樣本(不混樣的情況下),每個通道一般捕獲細胞數(shù)在1000-10000個之間,而上限可捕獲40000細胞時也能獲得較低的雙細胞率,此外,單個細胞捕獲效率高達80%,可準(zhǔn)確鑒別稀有細胞類型,有利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究;細胞可適性高,對細胞大?。ㄖ睆匠^40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制。細胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離,且實驗端捕獲細胞過程全程可視化進行,保障每一例珍貴樣本實驗的成功進行,1天內(nèi)可完成從細胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準(zhǔn)備工作。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。廣東BD VDJ單細胞多組學(xué)測序
烈冰專注單細胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。濟南scRNA單細胞測序服務(wù)
烈冰生物單細胞測序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實驗的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進行質(zhì)量控制,如細胞捕獲率和細胞多態(tài)率(雙細胞率)。成像儀指標(biāo)可以確認起始細胞樣本的質(zhì)量,并確認微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ;在細胞裂解前的步驟中評估細胞活性;并對通過測序確定的細胞回收量進行可靠估算。利用這些信息,在進行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。濟南scRNA單細胞測序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,深受客戶好評。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度、扎實的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,樹立了良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序形象,贏得了社會各界的信任和認可。