對于單細胞測序而言，常常需要先構(gòu)建細胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別是目的為圖譜研究時，需要通過提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此，單細胞測序?qū)嶒炘O(shè)計時首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù)，單個樣本分別捕獲細胞時，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準確性。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。天津BD單細胞服務(wù)機構(gòu)
作為單細胞測序的又一個重要里程碑，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析，獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況，并通過對復(fù)雜細胞群體進行深入細致分析，繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體，單細胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。云南BD VDJ單細胞多組學(xué)測序截至2022年6月，烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章30+篇。
針對單細胞測序的細胞上樣數(shù)，為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時，如果目標細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細胞懸液體積勢必增加，在細胞懸液質(zhì)量不是很理想（細胞活性<90%、碎片率>5%、結(jié)團率均>5%）的情況下，引入的背景信號會增加，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時，會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果！當目標細胞捕獲數(shù)很大時，多細胞率會增加，數(shù)據(jù)分析時，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍（N是一個GEM包裹的細胞數(shù)），導(dǎo)致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)（單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù)）虛高。此部分“cell”雖然可以通過設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾，但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除！
烈冰生物單細胞測序服務(wù)，為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng)，保證每次實驗的可靠性：BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能，可在工作流程的不同階段進行質(zhì)量控制，如細胞捕獲率和細胞多態(tài)率（雙細胞率）。成像儀指標可以確認起始細胞樣本的質(zhì)量，并確認微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ；在細胞裂解前的步驟中評估細胞活性；并對通過測序確定的細胞回收量進行可靠估算。利用這些信息，在進行高成本的下游測序之前，用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。烈冰BD Rahpsody單細胞測序平臺，助力您的深入科學(xué)探究。
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細胞測序?qū)嶒灲M中心，多地部署搭建BD Rhapsody單細胞實驗平臺，基于微孔的強大的高通量單細胞分析系統(tǒng)，為您提供可靠的單細胞分析工作流程，該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標記系統(tǒng)，對高通量單細胞進行多組學(xué)的信息捕獲，由此捕獲的信息科進一步生成各種類型的二代測序（NGS）文庫。之后對文庫進行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺（云平臺）的數(shù)據(jù)可視化分析，實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達差異和表達豐度。BD Scanner，是您實驗過程的又一雙眼睛，實時監(jiān)測，精細質(zhì)控。西安scRNA單細胞測序
附加流式分選細胞表面Marker，對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定，助力高要求測序項目。天津BD單細胞服務(wù)機構(gòu)
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