合肥烈冰單細胞測序

為什么需要單細胞分辨率？ 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜，有許多獨特的單體，也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學(xué)研究，闡明具體細節(jié)，構(gòu)建出一幅更大、更精細的圖譜，說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復(fù)發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。烈冰單細胞多組學(xué)測序助您探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。合肥烈冰單細胞測序

一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲，小心得不償失，原因在這：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細胞捕獲數(shù)過多時，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù)，都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。南京10X Chromium X單細胞測序服務(wù)公司單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型。

單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫，從而測定整個轉(zhuǎn)錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點，并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點，而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達分析。然而，這兩者只能提供細胞群體內(nèi)基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應(yīng)容器中。然后用細胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA，確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似，帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測序文庫，從而能夠?qū)γ總€細胞的整個轉(zhuǎn)錄組進行基因表達測定。

細胞中基因的表達是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細胞/基因的空間表達特異性。過去的十年，我們是知識的承載者；現(xiàn)在，我們在努力構(gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時代；未來我們將重新定義知識形態(tài)！

單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？ 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗，100+組織類型解離protocol，精心設(shè)計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？ 烈冰采用國際認可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細胞過濾技術(shù)，確保凍存組織使用。 珍貴樣本，細胞數(shù)量太少，消化背景雜無法做單細胞？ 采用國際認可的10X Genomics，BD Rhapsody雙平臺模式，根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少，背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足，部分細胞無法細分？ 烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)，真正做到從上游到下游的全流程檢測，確保超高的細胞分類精度。單細胞多組學(xué)測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤。南昌單細胞測序多組學(xué)測序

附加流式分選細胞表面Marker，對于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測序項目。合肥烈冰單細胞測序

機體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構(gòu)建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。合肥烈冰單細胞測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè)，技術(shù)力量雄厚。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)，一直“以人為本，服務(wù)于社會”的經(jīng)營理念;“誠守信譽，持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團隊，具有單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序等多項業(yè)務(wù)。烈冰生物自成立以來，一直堅持走正規(guī)化、專業(yè)化路線，得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。