重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-15

單細(xì)胞多組學(xué)帶來(lái)的突破 單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過(guò)程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過(guò)去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無(wú)法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對(duì)傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識(shí)。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),到揭開(kāi)疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,單細(xì)胞測(cè)序正在推動(dòng)突破性的研究,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療。無(wú)論是無(wú)法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來(lái)越清晰。隨著我們邁向科學(xué)的未來(lái),我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來(lái)的知識(shí)新深度是十年前的人們所無(wú)法想象的。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,小心得不償失,原因在這:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過(guò)降維(pca),無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí),無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。北京10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù)。

二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測(cè)序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升,例如Illumina Solexa測(cè)序儀。Illumina的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步:樣品文庫(kù)構(gòu)建、簇生成、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長(zhǎng)限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來(lái)源;2)Adapter,用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn);3)Primer binding site,用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào),獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法(Sanger法等)相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬(wàn)克?。?,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開(kāi)展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開(kāi)始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開(kāi)始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開(kāi)通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開(kāi)花,烈冰服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。

Fluidigm C1平臺(tái)作為應(yīng)用于單細(xì)胞測(cè)序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù),基于富魯達(dá)(Fluidigm?)的微流控技術(shù),大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞,進(jìn)行各類的Single-Cell測(cè)序建庫(kù)。當(dāng)然,通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測(cè)序,仍然在采用這樣的技術(shù),如Single Cell DNA-Seq,Single Cell ATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫(kù)。所以可以說(shuō),至少在10X和BD,或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測(cè)序技術(shù)之前,C1仍然會(huì)是市場(chǎng)上的重要組成部分。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定。福州單細(xì)胞測(cè)序百萬(wàn)通量平臺(tái)

深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動(dòng)圖先人一步:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

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