除了CRISPR-Cas9技術(shù),還有其他幾種基因編輯技術(shù)可以用于金黃色葡萄球菌的研究:1.單堿基編輯技術(shù):這是一種新型的基因編輯技術(shù),可以在不切割DNA雙鏈的情況下實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變。季泉江教授課題組與中國科學(xué)院北京基因組所韓大力研究員課題組合作,在金黃色葡萄球菌中建立了單堿基編輯技術(shù),通過融合失活的Cas9蛋白(Cas9D10A)和胞嘧啶脫氨酶(APOBEC1),實(shí)現(xiàn)了高效單堿基編輯,有助于研究耐藥機(jī)制和開發(fā)新型手段。2.同源重組(HR)修復(fù)技術(shù):在某些細(xì)菌中,可以通過同源重組機(jī)制對(duì)CRISPR-Cas9系統(tǒng)產(chǎn)生的雙鏈DNA斷裂進(jìn)行修復(fù),實(shí)現(xiàn)基因的精確編輯。例如,在谷氨酸棒桿菌中,利用CRISPR/Cas9技術(shù)結(jié)合同源重組修復(fù)模板,實(shí)現(xiàn)了高效的基因缺失和點(diǎn)突變。3.非同源末端連接(NHEJ)相關(guān)蛋白共表達(dá):通過共表達(dá)Cas9蛋白和NHEJ相關(guān)蛋白,如連接酶LigD,可以在鏈霉菌中實(shí)現(xiàn)有效的基因組編輯,這種方法不依賴于同源重組,可以應(yīng)用于那些同源重組效率較低的細(xì)菌。4.CRISPR干擾技術(shù)(CRISPRi):利用失活的Cas9蛋白(dCas9)阻斷基因的轉(zhuǎn)錄,從而抑制特定基因的表達(dá)。這種技術(shù)可以用于研究基因功能和調(diào)控基因表達(dá),已經(jīng)在多種細(xì)菌中得到應(yīng)用。根據(jù)目標(biāo)蛋白的特性,選擇合適的表達(dá)系統(tǒng),如原核(如大腸桿菌)、真核(如酵母、)或無細(xì)胞系統(tǒng)。上海純化工藝服務(wù)技術(shù)服務(wù)研發(fā)
臨床前研究中,重組蛋白的功能性驗(yàn)證是一個(gè)關(guān)鍵步驟,用以確保蛋白具有預(yù)期的生物學(xué)活性和穩(wěn)定性。以下是功能性驗(yàn)證通常包括的一些步驟:1.蛋白表達(dá)和純度檢測(cè):-使用SDS-PAGE或Westernblot等方法檢測(cè)蛋白的表達(dá)水平和純度。2.蛋白定量:-使用BCA、Bradford或UV吸收等方法對(duì)蛋白進(jìn)行定量。3.蛋白折疊和聚集狀態(tài)分析:-使用圓二色譜(CD)、熒光光譜等技術(shù)評(píng)估蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)。4.翻譯后修飾驗(yàn)證:-如果蛋白需要特定的翻譯后修飾(如磷酸化、糖基化),使用相應(yīng)的檢測(cè)方法進(jìn)行驗(yàn)證。5.生物學(xué)活性測(cè)試:-根據(jù)蛋白的功能,設(shè)計(jì)體外實(shí)驗(yàn)(如酶活性測(cè)定、受體結(jié)合實(shí)驗(yàn))來測(cè)試其生物學(xué)活性。6.細(xì)胞水平的功能驗(yàn)證:-將重組蛋白應(yīng)用于細(xì)胞培養(yǎng),觀察其對(duì)細(xì)胞行為(如增殖、分化、凋亡)的影響。7.體內(nèi)活性評(píng)估:-在動(dòng)物模型中注射重組蛋白,評(píng)估其在體內(nèi)的分布、代謝、藥效和毒性。8.免疫原性測(cè)試:-評(píng)估蛋白在體內(nèi)是否能夠誘導(dǎo)免疫反應(yīng),對(duì)于疫苗候選物尤為重要。福建人源膠原蛋白開發(fā)技術(shù)服務(wù)技術(shù)服務(wù)在DNA合成過程中,100 mM dATP溶液能夠快速參與反應(yīng),顯著提高合成效率。提高數(shù)據(jù)產(chǎn)出效率。
TaqPCRMasterMix的兼容性TaqPCRMasterMix對(duì)不同類型的引物和模板具有良好的兼容性。無論是常規(guī)的DNA模板,還是經(jīng)過特殊處理的如甲基化修飾的模板,以及各種長度和堿基組成的引物,都能在該Mix中發(fā)揮良好的擴(kuò)增效果。這使得它在多樣化的分子生物學(xué)研究中得以廣泛應(yīng)用,如在研究不同物種的基因差異時(shí),可輕松應(yīng)對(duì)各種復(fù)雜的模板和引物組合,拓寬了研究的范圍和深度。TaqPCRMasterMix的熒光染料特性含有熒光染料是該Mix的一大特色,在PCR反應(yīng)過程中,熒光染料能夠?qū)崟r(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的積累情況,無需后續(xù)的電泳檢測(cè)等繁瑣步驟。隨著擴(kuò)增的進(jìn)行,熒光強(qiáng)度逐漸增強(qiáng),通過儀器可直接繪制出擴(kuò)增曲線,實(shí)現(xiàn)對(duì)PCR過程的實(shí)時(shí)定量分析。在基因表達(dá)定量研究、SNP分析等方面,這種實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)功能極大地提高了實(shí)驗(yàn)的靈敏度和準(zhǔn)確性,同時(shí)減少了樣本處理過程中的污染風(fēng)險(xiǎn),為精細(xì)的分子生物學(xué)研究提供了有力手段。
HPV病毒樣顆粒(Virus-LikeParticles,VLPs)表達(dá)服務(wù)技術(shù)是用于生產(chǎn)疫苗的關(guān)鍵技術(shù),它涉及到利用生物技術(shù)手段在宿主細(xì)胞中表達(dá)HPV的主要衣殼蛋白L1,這些蛋白能夠自組裝成具有病毒樣顆粒結(jié)構(gòu)的VLPs,從而用于疫苗制備。以下是畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)在表達(dá)HPVVLPs時(shí)的一些優(yōu)化策略:1.分子水平策略:通過分子水平的策略,如優(yōu)化密碼子使用,提高基因在畢赤酵母中的表達(dá)效率和蛋白質(zhì)構(gòu)象的正確性。2.信號(hào)肽篩選:選擇合適的信號(hào)肽以提高重組蛋白分泌到培養(yǎng)基中的效率,從而增加VLPs的產(chǎn)量。3.敲除蛋白酶基因:通過基因編輯技術(shù)敲除畢赤酵母中的蛋白酶基因,減少外源蛋白被降解的風(fēng)險(xiǎn)。4.共表達(dá)促折疊因子:共表達(dá)分子伴侶或促折疊因子,幫助正確折疊和組裝VLPs,提高其穩(wěn)定性和免疫原性。5.多拷貝數(shù)外源基因:使用多拷貝質(zhì)粒或基因整合技術(shù),提高外源基因的拷貝數(shù),增加蛋白表達(dá)量。6.發(fā)酵條件優(yōu)化:通過優(yōu)化發(fā)酵條件,如溫度、pH、碳源等,提高VLPs的表達(dá)量和質(zhì)量。7.基因編輯技術(shù):利用CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)對(duì)畢赤酵母進(jìn)行遺傳改造,提高外源蛋白的表達(dá)。AdvanceFast PCR Master Mix (2×) (With Dye) 采用了優(yōu)化的高保真DNA聚合酶和反應(yīng)體系能夠?qū)崿F(xiàn)超快速的PCR擴(kuò)增。
DL2000 DNA Marker:分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的精細(xì)標(biāo)尺在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,DNA Marker是分析DNA片段大小的重要工具,而DL2000 DNA Marker憑借其精細(xì)的分子量范圍和清晰的條帶,成為了實(shí)驗(yàn)室中不可或缺的實(shí)驗(yàn)助手。DL2000 DNA Marker是一種即用型的DNA分子量標(biāo)準(zhǔn),通常用于瓊脂糖凝膠電泳。它包含6條不同長度的線狀雙鏈DNA片段,覆蓋從100 bp到2000 bp的范圍,具體條帶包括100 bp、200 bp、500 bp、1000 bp、1500 bp和2000 bp。其中,500 bp和1500 bp的條帶亮度較高,便于快速定位和參考。這種設(shè)計(jì)使得DL2000在電泳過程中能夠清晰地顯示目標(biāo)DNA片段的大小,幫助研究人員快速判斷實(shí)驗(yàn)結(jié)果。DL2000 DNA Marker的使用非常便捷。它已經(jīng)預(yù)混了Loading Buffer,可以直接取5-10 μL用于電泳,無需額外處理。這種即用型設(shè)計(jì)節(jié)省了實(shí)驗(yàn)時(shí)間,提高了實(shí)驗(yàn)效率。此外,DL2000的保存條件也非常靈活,可在-20℃長期保存,融化后可在4℃保存,避免反復(fù)凍融即可。在實(shí)驗(yàn)中,DL2000 DNA Marker的條帶清晰、亮度均勻,即使在低濃度的瓊脂糖凝膠中也能保持良好的分離效果。它適用于1%-3%的瓊脂糖凝膠濃度,能夠滿足大多數(shù)常規(guī)實(shí)驗(yàn)的需求。100 mM dATP溶液以其高純度、濃度、強(qiáng)兼容性和性能,成為分子生物學(xué)研究中的重要工具。河北漢遜酵母表達(dá)技術(shù)服務(wù)開發(fā)
基因編輯技術(shù)被用來研究大腸桿菌中葡萄糖代謝通路的調(diào)控機(jī)制。上海純化工藝服務(wù)技術(shù)服務(wù)研發(fā)
通過畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)提高重組蛋白的表達(dá)量和純度,可以采取以下策略:1.優(yōu)化基因序列:根據(jù)畢赤酵母的密碼子偏好性進(jìn)行基因序列的優(yōu)化,避免含有畢赤酵母稀有的密碼子,減少(A+T)含量過高或過低的問題。2.增加基因拷貝數(shù):通過體外構(gòu)建或體內(nèi)構(gòu)建法增加外源基因的拷貝數(shù),可以提高蛋白的表達(dá)量。3.選擇合適的啟動(dòng)子:使用強(qiáng)誘導(dǎo)型啟動(dòng)子如AOX1或組成型啟動(dòng)子,以提高基因的轉(zhuǎn)錄水平。4.使用分子伴侶:共表達(dá)分子伴侶如PDI或BiP,幫助目標(biāo)蛋白正確折疊,減少聚集體的形成。5.選擇合適的信號(hào)肽:使用合適的信號(hào)肽引導(dǎo)重組蛋白分泌到胞外,如α-因子信號(hào)肽(MF-α)等。6.優(yōu)化培養(yǎng)條件:調(diào)整溫度、pH、碳源、甲醇濃度等培養(yǎng)條件,以獲得好的蛋白表達(dá)效果。7.發(fā)酵工藝優(yōu)化:采用高密度發(fā)酵,優(yōu)化溶解氧水平、通氣量等,提高蛋白表達(dá)量。8.減少蛋白酶活性:通過降低發(fā)酵液pH、添加蛋白酶底物或敲除蛋白酶基因等方法,減少蛋白降解。9.提高分泌效率:通過改造信號(hào)肽或共表達(dá)轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)因子,提高外源蛋白分泌效率。上海純化工藝服務(wù)技術(shù)服務(wù)研發(fā)