北京空間代謝組學(xué)基本研究流程

空間代謝組學(xué)助力醫(yī)科院藥物所蔣建東團(tuán)隊(duì)探究靶向納米技術(shù)促進(jìn)小檗堿肝臟吸收機(jī)制。中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所蔣建東團(tuán)隊(duì)課題組在NatureCommunications發(fā)表了題為“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果，通過(guò)AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技術(shù)研究BBR-CTA-Mic對(duì)高脂飲食小鼠的代謝紊亂和******效果，發(fā)現(xiàn)BBR-CTA-Mic不僅可有效促進(jìn)肝臟沉積和肝細(xì)胞攝取BBR，還能降低血漿中的脂質(zhì)和促炎細(xì)胞因子。空間代謝組通過(guò)質(zhì)譜成像技術(shù)。北京空間代謝組學(xué)基本研究流程

本篇為2021年8月，國(guó)家**中心中國(guó)醫(yī)學(xué)院科學(xué)院**醫(yī)院崔巍研究員與專(zhuān)業(yè)多組學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)合作在醫(yī)學(xué)一區(qū)消化道領(lǐng)域國(guó)際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果，通過(guò)非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)(研究方法，整合了宏基因組的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結(jié)直腸*診斷的代謝標(biāo)志物，建立的相關(guān)預(yù)測(cè)模型顯示出較高診斷準(zhǔn)確性，為結(jié)直腸*早期診斷奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。在本研究中，作者對(duì)血清代謝組學(xué)和糞便宏基因組測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行整合分析，確定了一組與腸道微生物群密切相關(guān)的CRC和腺瘤患者的血清代謝物，并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關(guān)血清代謝物 (GMSM) 策略，可準(zhǔn)確區(qū)分CRC和腺瘤患者（統(tǒng)稱(chēng)為結(jié)直腸異常）與正常健康個(gè)體。青海空間代謝組學(xué)研究意義空間代謝組得到了廣大醫(yī)學(xué)領(lǐng)域科研工作者的信任。

隊(duì)列1：收集手術(shù)切除的食管腺*（EA）組織和與之匹配的健康食管上皮組織（MHEE）。隊(duì)列2：收集健康食管上皮組織（來(lái)自健康志愿者，HEE）和未經(jīng)***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活檢樣本，用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進(jìn)程中甘油磷脂的變化，以及隊(duì)列1的外部驗(yàn)證。樣本制備：樣本制成冰凍組織切片，并結(jié)合H&E染色。研究方法：空間代謝組學(xué)；qPCR檢測(cè)甘油磷脂合成通路中基因的表達(dá)；細(xì)胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因；免疫組化用于分析隊(duì)列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達(dá)。

作者進(jìn)行了空間代謝組學(xué)(～50μm的空間分辨率)，并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對(duì)主要的髓鞘標(biāo)志物進(jìn)行了成像，推測(cè)它們分別屬于Cer(D18：1/24：1)和PC(38：6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明，使用拉曼光譜結(jié)構(gòu)信息和空間代謝組學(xué)對(duì)髓鞘中的脂質(zhì)進(jìn)行特定的成分分析是可能的。對(duì)單個(gè)有髓組織成分光譜的分析證實(shí)，構(gòu)成有髓組織光譜的主要分子是脂質(zhì)，包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿，以及程度較小的蛋白質(zhì)(圖2F)。空間代謝組三個(gè)維度的分析。

空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系（BCL）進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達(dá)，在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細(xì)胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類(lèi)似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá)，但不降低MYC基因的表達(dá)。其次，ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá)，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此，MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。誰(shuí)還在盤(pán)點(diǎn)空間代謝組學(xué)專(zhuān)題?4篇,總IF:82,篇篇經(jīng)典~。河南空間代謝組學(xué)研究意義

質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物上千代謝物的定性。北京空間代謝組學(xué)基本研究流程

再帕爾·阿不力孜、賀玖明研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用空間代謝組學(xué)繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)圖。2021年4月，中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能?chē)?guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室再帕爾·阿不力孜、賀玖明團(tuán)隊(duì)在分析化學(xué)一區(qū)《Analytical Chemistry》期刊發(fā)表封面文章，題為“Mapping metabolic networks in the brain by using ambient mass spectrometry imaging and metabolomics”的研究成果，通過(guò)空間代謝組學(xué)技術(shù)，***揭示了大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)，深入解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化。北京空間代謝組學(xué)基本研究流程

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