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空間代謝組學(xué):該技術(shù)解決了生物組織中低含量代謝物難檢測(cè)、覆蓋種類少和成像質(zhì)量差等技術(shù)難題,可實(shí)現(xiàn)生物組織中約1500個(gè)代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質(zhì)類等,并精確表征與識(shí)別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過前期的研發(fā)以及1年時(shí)間的技術(shù)服務(wù)積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動(dòng)物/植物組織樣本的空間代謝組學(xué)檢測(cè)及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗(yàn)??臻g代謝組是基于質(zhì)譜成像技術(shù)發(fā)展而來的,免標(biāo)記、無需基質(zhì)、周期短。江蘇空間代謝組學(xué)在醫(yī)學(xué)
作者使用NMR對(duì)C原子進(jìn)行示蹤實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動(dòng)葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學(xué)檢測(cè)小鼠模型以及人BCL細(xì)胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導(dǎo)的BCL細(xì)胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標(biāo)記碳。當(dāng)MYC失活時(shí),細(xì)胞中3H標(biāo)記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細(xì)胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時(shí)上調(diào)FA的合成。重慶空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用代謝組學(xué)分析、空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格、代謝組學(xué)分析。
AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:一種基于分子組織學(xué)的高靈敏高覆蓋質(zhì)譜成像方法用于檢測(cè)功能性代謝物研究對(duì)象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運(yùn)用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)2018年11月中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文,通過優(yōu)化的空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術(shù),繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時(shí)空變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來。本研究開發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標(biāo)志物。通過非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物,為分子組織學(xué)研究提供了有力的分析工具。
本研究應(yīng)用空間代謝組學(xué)能夠客觀地識(shí)別食管腺*。EA組磷脂富含長(zhǎng)鏈、多不飽和的PGs。并且,遺傳學(xué)研究表明,這一機(jī)制與脂肪酸從頭合成有關(guān)。這些結(jié)果表明,空間代謝組學(xué)可以區(qū)分惡性食管中的組織類型。在臨床應(yīng)用包括客觀診斷和術(shù)中切緣評(píng)估具有潛在價(jià)值。在獲得AFADESI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經(jīng)完成共計(jì)近千例樣本經(jīng)驗(yàn),包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學(xué)檢測(cè)及分析。
曾經(jīng)錯(cuò)過熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯(cuò)過新秀—空間代謝組。
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對(duì)于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢(shì)。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能。本篇小鹿盤點(diǎn)5篇空間代謝組學(xué)在科學(xué)研究中的經(jīng)典應(yīng)用~給您的組學(xué)研究提供更多支持~空間代謝組學(xué):一種高靈敏、高覆蓋質(zhì)譜成像技術(shù)新技術(shù)。海南空間代謝組學(xué)技術(shù)
空間分辨代謝組學(xué)進(jìn)展和挑戰(zhàn)。江蘇空間代謝組學(xué)在醫(yī)學(xué)
空間代謝組學(xué):a)小鼠腦冠狀切片圖像顯示亮場(chǎng)圖像和拉曼光譜圖像(b)脂質(zhì),蛋白質(zhì)和DNA的拉曼光譜覆蓋層(c)髓鞘結(jié)合蛋白(MBP)、Tuj1(III類β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大腦感興趣區(qū)域的高分辨率顯微拉曼圖像(200×200μm),顯示與脂類(2885cm?1)、蛋白質(zhì)(2940cm?1)和DNA(3000cm?1)相關(guān)的拉曼光譜峰(e)K-means聚類(n=2個(gè)聚類)顯示不同的腦組織特征(f)與twok-means團(tuán)簇相關(guān)的**平均拉曼光譜(g)根據(jù)m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空間代謝組成像顯示灰質(zhì)和白質(zhì)分離,推測(cè)為Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(h)灰質(zhì)和白質(zhì)的代表性的平均空間代謝質(zhì)譜圖(分別以綠色和紅色表示) 江蘇空間代謝組學(xué)在醫(yī)學(xué)
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