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1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡(luò)信息。大腦中復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化使用Cyctoscope軟件完成。歐易生物空間代謝組學(xué),服務(wù)好,科學(xué)領(lǐng)域,提供方向。山西空間代謝組學(xué) 肝炎
再帕爾·阿不力孜、賀玖明研究團(tuán)隊運用空間代謝組學(xué)繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)圖。2021年4月,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國家重點實驗室再帕爾·阿不力孜、賀玖明團(tuán)隊在分析化學(xué)一區(qū)《Analytical Chemistry》期刊發(fā)表封面文章,題為“Mapping metabolic networks in the brain by using ambient mass spectrometry imaging and metabolomics”的研究成果,通過空間代謝組學(xué)技術(shù),***揭示了大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò),深入解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化。浙江軟骨空間代謝組學(xué)空間代謝組學(xué)一個樣本多少錢。
在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡(luò)發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵因素,基于空間分辨的代謝組學(xué)信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡(luò)分析必須進(jìn)一步驗證蛋白質(zhì)和基因表達(dá)水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡(luò)作圖方法,通過無需衍生化、特定標(biāo)記或復(fù)雜樣品預(yù)處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學(xué)策略,在具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測出多種極性內(nèi)源性代謝物,并繪制相關(guān)代謝網(wǎng)絡(luò),提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化。
質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識別其生物學(xué)功能。空間代謝組突破傳統(tǒng)代謝組研究損失空間信息的瓶頸。
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM將會在2022年對空間代謝組學(xué)研究帶來更高效的產(chǎn)能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已擁有2臺空間代謝組學(xué)**研究設(shè)備(見下方圖片)。相信鹿明生物的2022將幫助各位科研學(xué)者提供更加快速、質(zhì)量的研究。請期待鹿明生物2022給您帶來的"極速"體驗~基于AFADESI-MSI平臺代謝物廣覆蓋度的優(yōu)點,在臨床樣本以及動物樣本中同時檢測到膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物,真正意義上滿足了“空間代謝組學(xué)”的研究需求??臻g代謝組分析測序服務(wù)。山西空間代謝組學(xué) 肝炎
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獲取空間代謝組學(xué)圖像。計算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗概率。該分析基本證實了拉曼光譜特征,與對側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對脂質(zhì)成分差異的***個直接指標(biāo)。山西空間代謝組學(xué) 肝炎
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