陜西發(fā)展酵母文庫

來源: 發(fā)布時間:2022-08-04

酵母雙雜交篩選實驗:為進一步了解LEA3蛋白在干旱脅迫下調控植物生長和增強抗旱性的分子機制,本研究以干旱脅迫條件下的棉花根莖葉為材料,構建了棉花干旱脅迫酵母文庫。并以GhLEA3為誘餌,采用酵母雙雜交篩選實驗,從棉花酵母文庫中篩選獲得了GhLEA3互作蛋白,并對互作蛋白進行了GO和KEGG分析,發(fā)現其中的互作蛋白GhVDAC1主要參與鈣信號通路和cGMP-PKG信號通路,互作蛋白Gh***A參與多種生物途徑,如糖原生成和代謝途徑。此外,GhVDAC1和Gh***A受干旱脅迫誘導表達***,且在GhLEA3敲除的棉株中表達量低于野生型棉株根據每個客戶的研究目標和內容靈活定制研究方案。既能提供建庫服務,也能提供篩庫服務。陜西發(fā)展酵母文庫

目前,歐易生物負責該水稻轉錄因子文庫的維護和保存工作,并對廣大水稻科研工作者提供轉錄因子篩選服務。如去年歐易生物助力中國科學院分子植物科學***創(chuàng)新中心的王二濤老師應用該文庫對水稻-叢枝菌根進行了深入研究,成功構建了水稻-叢枝菌轉錄調控網絡,結果發(fā)表于《Cell》封面。截至文章發(fā)表,該文庫已收錄了1683個水稻轉錄因子,隸屬于54個家族,覆蓋預測的水稻轉錄因子總量的70%。文庫中水稻轉錄因子的a基因信息來源于PlantTFDB和KOME數據庫。文庫載體使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一個轉錄因子菌株**保存于96孔板中。陜西發(fā)展酵母文庫歐易生物21天極速建庫,一個文庫可以同時做單雜、雙雜、三雜,化藥小分子篩選。

水稻轉錄因子文庫篩選服務:近幾年,中國科學院分子植物科學***創(chuàng)新中心王二濤課題組在植物根瘤共生和菌根共生領域取得三項可以寫入教科書級的研究成果。尤其是近兩年,已經連續(xù)發(fā)表了Cell、Nature、MP和PNAS等高水平文章。此外,王二濤研究員也是第二屆"科學探索獎"的獲得者,肯定他在植物-微生物共生營養(yǎng)交換和菌根共生信號受體發(fā)現方面的貢獻。2021年10月12日,分子植物***中心王二濤研究團隊在Cell上發(fā)表題為“磷信號中樞網絡調控菌根共生)”的封面論文。***繪制了水稻-叢枝菌根共生的轉錄調控網絡,發(fā)現植物直接磷營養(yǎng)吸收途徑(根途徑)和共生磷營養(yǎng)吸收途徑(共生途徑)均是受到植物的磷信號網絡統(tǒng)一調控,回答了菌根共生領域"自我調節(jié)"這一困擾領域的重要科學問題。歐易生物CEO肖云平先生也參與了此項研究。文中水稻轉錄因子文庫篩選服務由歐易生物提供。

歐易酵母文庫助力小麥根長抑制分子機制研究,近日,中國農業(yè)科學院作物科學研究所景蕊蓮研究員、河南農業(yè)大學王翔副教授為共同通訊作者,在 Journal of Experimental Botany 雜志(IF: 6.992)在線發(fā)表了題為“Wheat SHORT ROOT LENGTH 1 gene TaSRL1 regulates root length in an auxin-dependent pathway”的研究論文,報道了小麥 TaSRL1 轉錄因子調控根長的分子機制。文章中酵母雙雜交文庫由歐易生物完成。根系是植物從土壤中吸收水分、養(yǎng)分和感知環(huán)境刺激的獨特***。根系結構的優(yōu)化有助于提高植株的抗逆性和產量。ERF(ETHYLENERESPONSIVEFACTOR)是植物特有的轉錄因子家族之一,與植物的多種發(fā)育過程和抗逆性有關。ERFs在擬南芥和水稻根系發(fā)育中的作用已經多有報道,但小麥ERFs在根系發(fā)育中的作用尚待研究。傳統(tǒng)酵母雜交技術應用已經30多年,技術已經成熟穩(wěn)定。

通過傳統(tǒng)的酵母雙雜交系統(tǒng),以PtDAL1為誘餌,篩選樣本來源于不同年齡段的油松cDNA文庫。將獲得的陽性克隆,10個一組,挑選到1個96孔板的PCR板孔中,獲得10*96個陽性克隆的96孔板。以其中陽性克隆mix為模板,進行PCR擴增,并將所有的PCR產物進行純化。使用純化后的PCR產物,進行打斷后構建二代測序文庫,通過NGS測序,獲得6G的陽性克隆數據。通過分析二代測序數據,獲得陽性克隆基因信息(去冗余后獲得135個互作子,包含21個TFs,2個TRs及酶類、熱激蛋白、RNA結合等蛋白,部分見表1)。挑選重要的候選基因進行一對一驗證(圖2)。與擬南芥中同源基因AGL6的蛋白互作網絡進行比對分析。對DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表達譜、啟動子中的順勢作用元件功能進行分析,并對DIPs進行GO注釋(圖3)。綜合生信分析結果,構建針葉樹老化途徑的調控模型(圖4)。百種酵母文庫,讓您的科研不再困難!!云南酵母文庫使用

液態(tài)酵母單雙雜高通量篩庫方法及其應用。陜西發(fā)展酵母文庫

酵母文庫實驗:本研究發(fā)現了一個硝酸鹽響應的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2,它參與調節(jié)硝酸鹽介導的蘋果植株生長。利用酵母雙雜交、蛋白質 pull-down、BiFC 實驗證實,MdBT2 可以與一個 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作,這種互作是 MdRGL3a 蛋白經由 26S 蛋白酶體途徑的泛素化及降解所必需的。此外,異源表達 MdBT2 部分回復了 MdRGL3a 過表達所導致的擬南芥生長抑制。綜上表明,MdBT2 可以通過降低 DELLA 蛋白 MdRGL3a 的豐度促進硝酸鹽介導的植物生長。實驗室培養(yǎng)顯示,培養(yǎng) 45 天,蘋果幼苗的高度和生物量隨硝酸鹽濃度的增加而增加(圖 A-C)。陜西發(fā)展酵母文庫

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