由于設計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配,引入非預期的基因突變,即脫靶效應(Off-targeteffects)。脫靶效應造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術的應用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應。在目前主流的脫靶效應評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標記CRISPR/Cas誘導的脫靶斷裂,然后對標簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序,通過生物信息學分析從而確定脫靶位點。利用該技術可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應,從而改變了以往先預測假定脫靶位點再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏?;蚓庉嫾夹g脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結果準確率高。武漢種子脫靶檢測實驗室
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導致臨床前和臨床研究中的安全問題?;蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g主要依賴于生物信息學預測和全基因組脫靶檢測技術。這些預測缺乏可靠性,因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進的分析技術與強大的內(nèi)部生物信息學體系相結合,可靠地量化了預期的靶向整合與非預期結果(如易位和INDEL)之間的比率。嘉興基因編輯技術脫靶檢測政策脫靶檢測服務,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結果準確率高。
插入突變風險評估一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細胞基因組中,這可能會導致關鍵基因突變或jihuo原基因,從而導致惡性liu風險增加。影響插入突變的關鍵風險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設計,如增強子、啟動子等構建元件的活性,影響鄰近基因的潛力;產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點或多聚腺苷酸信號等;(3)細胞載體拷貝數(shù);4)轉(zhuǎn)基因表達產(chǎn)物的功能活性(如與細胞生長調(diào)控相關)和表達水平;5)靶細胞群的轉(zhuǎn)化可能性,這可能與細胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關。
檢測方法的敏感度、特異性和可重復性應經(jīng)過驗證,并設計適當?shù)年栃院完幮詫φ?;當體內(nèi)靶細胞或替代細胞中載體序列陽性的比例超出預期范圍時,應開展克隆性生長的評估。如果存在優(yōu)勢克隆或單克隆生長,應在不超過3個月的時間內(nèi)再次檢測確認,并盡快開展整合位點的分析。當載體的整合位點確定后,應與人類基因組數(shù)據(jù)庫及基因組的其他數(shù)據(jù)庫等進行比較,確定整合位點的基因功能,評估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽性細胞的克隆性生長,或檢測發(fā)現(xiàn)基因整合位點在基因或相關基因附近,應縮短檢測間隔至不超過3個月并密切監(jiān)測惡性liu征兆,直至檢測不到基因zhiliao載體。脫靶檢測安評,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結果準確率高。
基因重排或重組。當基因zhiliao產(chǎn)品所用載體及其攜帶的基因發(fā)生復制時,可能出現(xiàn)非zhiliao目的非預期的基因表達或改變,或者與相應野生型或輔助病毒互補后產(chǎn)生回復突變或意外復制或形成6新的病毒。免疫原性。由于基因zhiliao產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)暴露或者需要多次給藥等情況,機體可能產(chǎn)生針對基因zhiliao載體或編碼的作用因子的免疫應答。由于基因zhiliao產(chǎn)品在靶細胞或組織中的表達時間、分布范圍或表達強度等差異,機體免疫應答的后果可能從不具有臨床意義的一過性的免疫反應,到針對靶細胞或組織的免疫攻擊,甚至產(chǎn)生嚴重危及生命的不良事件。隨著脫靶影響因素、降低策略及脫靶檢測技術研究的不斷深入,未來CRISPR/Cas9系統(tǒng)將在更多領域造福人類。浙江種子基因脫靶檢測報告
值得收藏的CRISPR脫靶檢測方法。武漢種子脫靶檢測實驗室
采用基因編輯技術制備的細胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術制備的基因修飾細胞產(chǎn)品,應進行體外在靶和脫靶活性評估,以確認修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風險時,應說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預測基因編輯的潛在脫靶位點,并對潛在脫靶位點進行深度測序分析,可用于評估基因編輯的脫靶風險;但選擇的評價策略仍應包含體外全基因組測序比對,以證明潛在脫靶位點未出現(xiàn)脫靶。此外,在評估脫靶活性時,還應評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態(tài)的差異或細胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預測性的影響。必要時,還應分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。武漢種子脫靶檢測實驗室