長期隨訪的觀察時間長期隨訪的持續(xù)時間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況(生物分布和給藥途徑)等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時間。一般而言,針對不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下:?具有基因組整合活性的載體(例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體)和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風(fēng)險(xiǎn)的細(xì)菌或病毒載體(如單純皰疹病毒)建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)(ganran或再jihuo)?;蚓庉嫯a(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。種子脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。江蘇基因療法脫靶檢測guide-sequence
BLESS:利用生物素標(biāo)簽對DSBs進(jìn)行原位標(biāo)記,后經(jīng)PCR擴(kuò)增實(shí)現(xiàn)對于生物素標(biāo)記片段的富集,并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點(diǎn)檢測。直接檢測細(xì)胞中的切割位點(diǎn),靈敏度與細(xì)胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS,片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭,然后進(jìn)行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測,可準(zhǔn)確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq,將dsODN s標(biāo)簽整合到DSBs位點(diǎn),通過二代測序檢測這些標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域,從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細(xì)胞內(nèi)檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq,片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育,進(jìn)行全基因組測序檢測脫靶。全基因組測序,直接檢測切割位點(diǎn),能檢測低頻脫靶突變。南京基因編輯脫靶檢測安評內(nèi)基因編輯技術(shù)可能造成的脫靶效應(yīng)。
先導(dǎo)編輯器:CBE和ABE組合使用可以有效地進(jìn)行4種堿基轉(zhuǎn)換(C→T, G→A, A→G, T→C),而無需產(chǎn)生DSB,然而除了這4種堿基轉(zhuǎn)換,對另外8種堿基轉(zhuǎn)換(C→A, C→G, G→C, G→T, A→C, A→T, T→A, T→G)以及堿基的插入和缺失,依然缺乏有效的研究工具。先導(dǎo)編輯器(Prime Editor, PE),PE在不依賴DSB和供體DNA的條件下便可有效實(shí)現(xiàn)所有12種堿基轉(zhuǎn)換,此外還能有效實(shí)現(xiàn)多堿基的精細(xì)插入(較多可插入44bp)和刪除(較多刪除80bp)。> 抗CRISPR蛋白??笴RISPR(Acr)蛋白是天然的CRISPR/Cas系統(tǒng)抑制劑,由各種可移動遺傳元件(MGEs)編碼,在不同階段抑制CRISPR-Cas的免疫功能。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多達(dá)45個Acr蛋白,其中 "AcrIIA4 "有可能保護(hù)細(xì)胞免受編輯。Shin和他的同事發(fā)現(xiàn),通過調(diào)整AcrIIA4或Cas9加入實(shí)驗(yàn)的時間,AcrIIA4將脫靶修飾減少了4倍,而沒有減少靶向效應(yīng)。
對于基因修飾細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機(jī)制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學(xué)合理性;(2)為臨床試驗(yàn)的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風(fēng)險(xiǎn)因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預(yù)測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標(biāo),為制定臨床風(fēng)險(xiǎn)控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風(fēng)險(xiǎn)獲益評估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標(biāo)患者人群中預(yù)期具有合理的、可接受的獲益風(fēng)險(xiǎn)比,同時為臨床試驗(yàn)的設(shè)計(jì)和風(fēng)險(xiǎn)控制策略的制定提供支持性依據(jù)。定量脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
但是由于CHIP-seq實(shí)驗(yàn)本身的難度較高,DISCOVER-seq這類方法的接受度并不高。3. 其他特殊方法CRISPR技術(shù)經(jīng)過這么多年的發(fā)展,其應(yīng)用已經(jīng)不局限于造成DNA雙鏈斷裂,一些不要切割DNA雙鏈的CRISPR衍生技術(shù)(如堿基編輯、先導(dǎo)編輯和CRISPRi/a),可以在不引發(fā)隨機(jī)突變的情況下,對基因組進(jìn)行精細(xì)編輯或者調(diào)控。這些技術(shù)所使用nCas9或dCas9只結(jié)合或者切割雙鏈中的一條鏈,之前的脫靶檢測方法都不能直接適用。這些CRISPR衍生技術(shù)中,CRISPR產(chǎn)生的脫靶可以被細(xì)分為兩個部分,其一是Cas9/sgRNA結(jié)合DNA導(dǎo)致的脫靶,這部分信息使用同樣序列的sgRNA進(jìn)行野生型Cas9脫靶位點(diǎn)檢測能夠間接得到crispr脫靶檢測,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。嘉興種子脫靶檢測企業(yè)
值得收藏的CRISPR脫靶檢測方法。江蘇基因療法脫靶檢測guide-sequence
如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性?;蚪M整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實(shí)施時還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對靶細(xì)胞采樣,這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風(fēng)險(xiǎn);同時,選擇易于采樣的替代細(xì)胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細(xì)胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過采集外周血細(xì)胞或富集外周血干細(xì)胞進(jìn)行觀察。江蘇基因療法脫靶檢測guide-sequence