溫州慢病毒載體整合位點(diǎn)報(bào)告

靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)?；谝延锌茖W(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果，如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù)，需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素，評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究，應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析，分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因（如liu相關(guān)調(diào)控基因）附近有無(wú)優(yōu)先整合跡象，含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無(wú)優(yōu)先異常增殖。如何確定慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒前病毒整合位點(diǎn)？溫州慢病毒載體整合位點(diǎn)報(bào)告

由于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的長(zhǎng)期存活及持久性作用，申請(qǐng)人應(yīng)對(duì)臨床試驗(yàn)期間接受zhiliao的所有受試者進(jìn)行適當(dāng)?shù)拈L(zhǎng)期隨訪(fǎng)，關(guān)注受試者生存、新發(fā)或繼發(fā)aizheng、ganran、免疫功能變化及遲發(fā)性不良反應(yīng)等安全性風(fēng)險(xiǎn)，以及非臨床或臨床數(shù)據(jù)提示需要關(guān)注的潛在風(fēng)險(xiǎn)，并觀(guān)察產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間（如有）、是否有致瘤性、免疫原性等。隨訪(fǎng)時(shí)間主要取決于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)水平、體內(nèi)的存活和作用時(shí)間、疾病進(jìn)程的認(rèn)識(shí)等，應(yīng)足以觀(guān)察到可能由于產(chǎn)品特性、暴露性質(zhì)等導(dǎo)致的受試者風(fēng)險(xiǎn)，并不應(yīng)短于遲發(fā)不良事件的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。上海整合位點(diǎn)政策整合位點(diǎn)技術(shù)，推薦唯可生物，實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng)，專(zhuān)業(yè)性高，檢測(cè)效率高，結(jié)果準(zhǔn)確率高。

全基因組測(cè)序是對(duì)重組細(xì)胞的基因組DNA進(jìn)行深度測(cè)序，技術(shù)成熟簡(jiǎn)單這里不做介紹了，我們分享一下LM-PCR結(jié)合二代測(cè)序的檢測(cè)方法。LM-PCR全稱(chēng)連接介導(dǎo)的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進(jìn)行隨機(jī)打斷并連接接頭，然后通過(guò)兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的嵌合序列。此擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行二代測(cè)序即可以分析確定載體在宿主基因組上的整合位點(diǎn)。LM-PCR與高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合后，有了更為豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。比如，識(shí)別整合載體（慢病毒載體，轉(zhuǎn)座子）的整合位點(diǎn)。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因zhiliao研究基因修飾細(xì)胞的克隆組成，或者通過(guò)研究整合事件評(píng)估新載體系統(tǒng)的生物安全性。

病毒載體介導(dǎo)的外源基因隨機(jī)插入的可能風(fēng)險(xiǎn)之一是其可能整合到宿主細(xì)胞的原基因或抑基因內(nèi)引發(fā)插入性誘變（insertionalmutagenesis），導(dǎo)致基因的jihuo或抑基因的抑制，從而誘導(dǎo)的發(fā)生。這些潛在的副作用已經(jīng)引起人們的極大關(guān)注，因此亟需發(fā)展普適的整合位點(diǎn)檢測(cè)手段來(lái)評(píng)估以病毒為載體的基因zhiliao的安全性。病毒載體整合位點(diǎn)檢測(cè)能夠特異性捕獲整合位點(diǎn)序列，經(jīng)過(guò)文庫(kù)構(gòu)建、二代測(cè)序及生物信息學(xué)分析，即可得出病毒載體在細(xì)胞中的整合位點(diǎn)。采用LM-PCR和全基因組重測(cè)序兩種方法,可以有效分析重組細(xì)胞外源序列的整合位點(diǎn)。

對(duì)確證性臨床試驗(yàn)的療效和安全性要求:“繼續(xù)監(jiān)測(cè)安全性風(fēng)險(xiǎn)，分析重要的已知和潛在的風(fēng)險(xiǎn)信息，包括遲發(fā)性不良事件(如致瘤性)的發(fā)生率、 嚴(yán)重性和危險(xiǎn)因素等，并有必要采取措施使風(fēng)險(xiǎn)較小化。" 2021年2月發(fā)布的《基因修飾細(xì)胞zhiliao 產(chǎn)品非臨床研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則（試行）》則明確將"插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估"作為非臨床安全性研究的內(nèi)容，并詳細(xì)規(guī)定關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素的評(píng)估要點(diǎn)。可見(jiàn)慢病毒載體整合位點(diǎn)檢測(cè)已經(jīng)成為細(xì)胞zhiliao 產(chǎn)品IND評(píng)審及臨床試驗(yàn)安全性評(píng)估的必檢內(nèi)容。整合位點(diǎn)一般有哪些測(cè)序方法？廣州慢病毒整合位點(diǎn)服務(wù)

對(duì)T細(xì)胞受體(TCR)β鏈庫(kù)進(jìn)行深度測(cè)序(TCR-seq)以及慢病毒載體整合位點(diǎn)(LVIS)分析。溫州慢病毒載體整合位點(diǎn)報(bào)告

例如，對(duì)于經(jīng)過(guò)基因修飾的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品如CAR-T，采用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)和流式細(xì)胞術(shù)（Flowcytometry）進(jìn)行PK分析，分別通過(guò)測(cè)定外源基因拷貝和CAR+細(xì)胞數(shù)量的變化，有助于互相驗(yàn)證檢測(cè)方法的可靠性，可以更duomian的分析產(chǎn)品在體內(nèi)的擴(kuò)增和存活情況。對(duì)于大多數(shù)免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品，可以通過(guò)細(xì)胞和/或體液免疫應(yīng)答分析藥效學(xué)活性。有多個(gè)特異性靶點(diǎn)的zhiliao產(chǎn)品，應(yīng)分析其對(duì)每個(gè)靶點(diǎn)的作用活性。如果細(xì)胞經(jīng)體外基因修飾，在體內(nèi)分泌特定蛋白、多肽或其它活性成分，或敲除了特定基因的表達(dá)，也需要進(jìn)行針對(duì)性的藥效學(xué)分析，如檢測(cè)特定蛋白的活性、持續(xù)時(shí)間和變化情況等。溫州慢病毒載體整合位點(diǎn)報(bào)告