廣州基因療法脫靶檢測報告

來源: 發(fā)布時間:2024-04-26

如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性?;蚪M整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本,實施時還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對靶細(xì)胞采樣,這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風(fēng)險;同時,選擇易于采樣的替代細(xì)胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細(xì)胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過采集外周血細(xì)胞或富集外周血干細(xì)胞進行觀察。如何檢測是否發(fā)生脫靶?廣州基因療法脫靶檢測報告

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圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因編輯安全性問題,我們首先對CRISPR脫靶位點檢測技術(shù)進行一次大盤點,在sgRNA設(shè)計階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現(xiàn)象的發(fā)生。較簡單的脫靶位點檢測方法是全基因組測序(WGS),但在實際使用中,即使測序深度達到100X,也很難發(fā)現(xiàn)一些低頻率的脫靶位點,同時測序成本卻非常高。為彌補WGS的這些缺陷,常見的脫靶位點檢測技術(shù)都需要對脫靶位點進行捕獲富集,來提高檢測靈敏度,降低測序成本。按照實驗原理的不同,脫靶位點檢測技術(shù)可以分為細(xì)胞外、細(xì)胞內(nèi)和其他特殊方法這3類。南通crispr/cas9脫靶檢測技術(shù)脫靶(off-target)效應(yīng)是指MicroRNA Agomir/Antagomir可以與特異性互補的核苷酸序列結(jié)合。

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通常不需要進行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗,但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等,評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發(fā)生情況,并檢測隨后可能發(fā)生的異常細(xì)胞行為;評估插入突變(插入位點、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時,需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。

當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時,需要進一步研究確定其在生殖細(xì)胞(例如卵母細(xì)胞、精子)的暴露水平。根據(jù)載體類型、復(fù)制能力、基因組整合特性、劑量水平、給藥途徑等因素,分析評估基因zhiliao產(chǎn)品生殖系整合風(fēng)險。遺傳毒性,基因zhiliao產(chǎn)品將遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到宿主細(xì)胞內(nèi)或整合到宿主基因組中或?qū)λ拗骰蚪M進行編輯,存在潛在的遺傳毒性風(fēng)險。目前對于判斷細(xì)胞基因組插入/修飾是否會產(chǎn)生遺傳毒性、是否較終會發(fā)生變依然還缺乏系統(tǒng)的認(rèn)知,因此,需要分析基因組改變(載體或遺傳物質(zhì)整合進基因組、對基因組編輯等)的特征,并評估相關(guān)潛在風(fēng)險。脫靶檢測安評,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。

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細(xì)胞外檢測方法:細(xì)胞外檢測方法較為直接,將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗,再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細(xì)胞外脫靶位點檢測方法,提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后,再經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù),之后需要較為復(fù)雜的生物信息學(xué)分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息??傮w來講,這種方法測序成本較高,并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點,一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法,提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割后,在切割位點末端連接帶Biotin的接頭;再隨機打斷基因組,在另一端連接第二個接頭;經(jīng)過鏈霉親和素磁珠純化,只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序,實現(xiàn)了CRISPR切割位點的富集。該方法雖然提高了脫靶位點的檢測靈敏度,但有著較高的實驗要求,每次需要投入大量的基因組DNA,并且無法區(qū)分提純基因組DNA時發(fā)生的隨機斷裂和Cas9的切割,導(dǎo)致產(chǎn)出較為明顯的背景信號。同時,由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點的一側(cè),導(dǎo)致測序結(jié)果里只能看到脫靶位點一側(cè)的序列。脫靶檢測技術(shù),推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高?;蚓庉嬅摪袡z測實驗室

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自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對整個行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來,基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等?!睆V州基因療法脫靶檢測報告