北京AAV整合位點安全性評價

全基因組測序是對重組細胞的基因組DNA進行深度測序，技術成熟簡單這里不做介紹了，我們分享一下LM-PCR結合二代測序的檢測方法。LM-PCR全稱連接介導的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進行隨機打斷并連接接頭，然后通過兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的嵌合序列。此擴增產(chǎn)物進行二代測序即可以分析確定載體在宿主基因組上的整合位點。LM-PCR與高通量測序技術相結合后，有了更為豐富的應用場景。比如，識別整合載體（慢病毒載體，轉(zhuǎn)座子）的整合位點。該技術廣泛應用于基因zhiliao研究基因修飾細胞的克隆組成，或者通過研究整合事件評估新載體系統(tǒng)的生物安全性。慢病毒載體在人角質(zhì)形成細胞基因組中的整合位點分析。北京AAV整合位點安全性評價

免疫細胞zhiliao產(chǎn)品的風險水平與多種因素有關，如細胞來源和類型、體內(nèi)活性和存活時間、是否有外源基因表達、基因表達使用的載體類型以及是否存在基因組整合等。針對不同風險水平的免疫細胞zhiliao產(chǎn)品，隨訪持續(xù)時間的建議如下：?對于沒有外源基因表達、且體外操作不改變細胞存活時間及分化潛能的免疫細胞zhiliao產(chǎn)品，長期隨訪的持續(xù)時間不應短于細胞在體內(nèi)的自然存活時間，建議對受試者進行1年或以上的隨訪。對于有外源基因表達、但不存在基因整合或基因重組風險，或載體的基因整合或重組風險較低的免疫細胞zhiliao產(chǎn)品，建議對受試者進行不少于5年的隨訪。?對于有外源基因表達、而且表達載體存在基因整合或有基因重組風險的免疫細胞zhiliao產(chǎn)品，建議對受試者觀察不少于15年。武漢基因編輯整合位點安全性評價整合位點和復制位點。

免疫細胞zhiliao產(chǎn)品的劑量描述，很多免疫細胞zhiliao產(chǎn)品的細胞組成并非均一，往往包含多種類型的細胞，起主要zhiliao作用的可能是其中一種細胞類型，但不良反應可能受同一產(chǎn)品中其它類型細胞的影響。在描述免疫細胞zhiliao產(chǎn)品的劑量時，需要考慮產(chǎn)品的特定屬性，例如細胞類型和來源（自體與同種異體來源等）、轉(zhuǎn)導效率、單個細胞的載體平均拷貝數(shù)和細胞活力、效價和生物學活性等。在尚無法明確不同細胞亞群對活性作用或不良反應的影響時，明確終產(chǎn)品中的細胞亞群和所占比例，并比較不同細胞亞群對臨床結局的影響，可能有助于識別與產(chǎn)品安全性和有效性較相關的細胞亞群。

當載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風險特征增加時，例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)?；蚋淖兘oyaofang式以提高整合能力等，需要提高對長期隨訪觀察的要求；反之，也可以對目前認為存在遲發(fā)風險的基因zhiliao載體進行修飾，以降低這些風險。長期表達，與其他產(chǎn)品相比，部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細胞或基因修飾細胞中持續(xù)存在并編碼表達作用因子（功能性蛋白或基因表達調(diào)節(jié)元件），并通過長久或長期改變靶細胞或組織的功能來達到zhiliao效果。同時，由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內(nèi)的長期暴露或表達異常，可能產(chǎn)生與其功能相關的長期安全性風險，如細胞生長失控和惡性liu形成、自身免疫反應或其他無法預測的遲發(fā)性不良反應。從細胞游離DNA中檢測載體整合位點。

相較于LM-PCR方法，重組細胞全基因組重測序需要較大數(shù)據(jù)量，比較適合用于經(jīng)過表型篩選的單克隆細胞的測序，比如用于抗體藥物生產(chǎn)重組CHO細胞的位點檢測，但全基因組測序可對宿主基因組自身的變異進行檢測。應用場景：CAR-T細胞安全性檢測（藥物申報）；基因zhiliao研究中使用的病毒性載體的安全性檢測等；1.LM-PCR不適合評估每個整合位點插入序列發(fā)生的變異，不適用于插入序列的拷貝數(shù)檢測，拷貝數(shù)檢測可以采用qPCR方法進行。2.INZR-WGS（WGS法）傳統(tǒng)PCR技術分析整合位點依賴限制性內(nèi)切酶酶切,存在一定偏好性；南通慢病毒載體整合位點分析

在靶向CD19的CAR-T臨床試驗中,慢病毒傳染的CAR-T整合位點顯示出更的抗效力。北京AAV整合位點安全性評價

慢病毒是逆轉(zhuǎn)錄病毒的一類，慢病毒整合到宿主細胞的染色體上可以長期穩(wěn)定表達，并且與其他逆轉(zhuǎn)錄病毒（例如腺病毒）相比，慢病毒不但能ganran分裂期細胞，而且還能ganran非分裂期的細胞?；谝陨蟽?yōu)點，慢病毒載體（lentiviral vector）作為外源基因轉(zhuǎn)移載體已廣用于臨床前基因研究及臨床基因zhiliao。然而目前尚不能實現(xiàn)利用慢病毒載體將目的基因插入到特定位點，因此存在插入性突變致的風險。腺相關病毒（adeno-associated virus，AAV）是目前發(fā)現(xiàn)的一類結構較簡單的單鏈DNA缺陷型病毒。而重組腺相關病毒載體(rAAV) 源于非致病的野生型腺相關病毒，具有安全性好、宿主細胞范圍廣和在體內(nèi)表達時間長等特點，目前的科學界共識是AAV不會導致任何人類疾病，因此成為目前較有前景的基因zhiliao載體。然而，近年來不斷有研究表明AVV可將外源基因片段插入到染色體上。北京AAV整合位點安全性評價