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基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會(huì)引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會(huì)采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會(huì)指向基因組的特定位點(diǎn),可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點(diǎn)附近的原基因等,進(jìn)而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險(xiǎn),例如,國(guó)外已有多項(xiàng)研究報(bào)告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細(xì)胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對(duì)于存在此類(lèi)風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品,有必要進(jìn)行長(zhǎng)期隨訪臨床研究以評(píng)估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。脫靶檢測(cè)方法,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)CRO
CIRCLE-seq原理。細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)方法由于提純的基因組已經(jīng)消化去除了組蛋白,結(jié)構(gòu)較細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)更為松散,理論上容易找到更多的脫靶位點(diǎn)。為捕獲CRISPR在細(xì)胞內(nèi)工作時(shí)真實(shí)發(fā)生的脫靶切割,研究者們也設(shè)計(jì)了一些細(xì)胞內(nèi)的脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法。1) Guide-seqCRISPR造成DNA雙鏈斷裂后,由于DNA修復(fù)機(jī)制的存在,斷裂處很快就會(huì)重新連接,這時(shí)候提純基因組DNA很難保留CRISPR造成的DNA斷裂位點(diǎn)。所以為了記錄細(xì)胞內(nèi)真實(shí)的CRISPR脫靶切割,研究者們?cè)O(shè)計(jì)了Guide-seq[10],利用NHEJ的DNA修復(fù)機(jī)制,將一段雙鏈短核苷酸序列(dsODN)連接到CRISPR造成的DNA雙鏈斷裂處,相當(dāng)于連接了一輪接頭,然后再正常打斷基因組,在另一側(cè)連接第二輪接頭。通過(guò)這種方式構(gòu)建的文庫(kù),就可以獲取脫靶位點(diǎn)一側(cè)的序列。雖然每次CRIPSR導(dǎo)致的DNA雙鏈斷裂并不一定都會(huì)連接dsODN,但反過(guò)來(lái)說(shuō),越容易連接dsODN的位點(diǎn),其發(fā)生脫靶切割的概率越高。通過(guò)Guide-seq找到的脫靶位點(diǎn)偏少,但一般都是可信度較高的脫靶位點(diǎn),Guide-seq也是目前比較公認(rèn)的一種脫靶檢測(cè)方法。無(wú)錫種子脫靶檢測(cè)政策定量脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無(wú)優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無(wú)優(yōu)先異常增殖。對(duì)于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細(xì)胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評(píng)估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。
堿基編輯器:CBE:胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base editor,CBE),依賴(lài)于胞嘧啶核苷脫氨基酶,通過(guò)將胞嘧啶核苷脫氨轉(zhuǎn)換為尿嘧啶核苷,尿嘧啶核苷在DNA復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中會(huì)轉(zhuǎn)換為胸腺嘧啶核苷,從而實(shí)現(xiàn)C到T的轉(zhuǎn)換。已開(kāi)發(fā)出四代CBE(BE1、BE2、BE3和BE4),由于BE3引起的脫靶效應(yīng)相對(duì)較少,因此它已在動(dòng)物(小鼠)、細(xì)菌和植物細(xì)胞中廣用于編輯細(xì)胞的基因組成。腺嘌呤堿基編輯器(Adenine base editor,ABE),依賴(lài)于腺嘌呤核苷脫氨基酶,通過(guò)將腺嘌呤核苷脫氨轉(zhuǎn)換為次黃苷,然后在DNA復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中會(huì)轉(zhuǎn)換為鳥(niǎo)嘌呤核苷,從而實(shí)現(xiàn)腺嘌呤(A)到鳥(niǎo)嘌呤(G)的轉(zhuǎn)換。新開(kāi)發(fā)的堿基編輯器ABE8e,比ABE7.10增加了590倍的靶向活性。脫靶檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過(guò)評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來(lái)評(píng)估。首先,應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復(fù)合物的親和力,并說(shuō)明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外,還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能,應(yīng)確定靶抗原肽的較小識(shí)別基序(motif),并采用計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)分析評(píng)估交叉反應(yīng)性。如果計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)可識(shí)別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽,應(yīng)在體外測(cè)定TCR修飾免疫細(xì)胞對(duì)表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原肽的的細(xì)胞的識(shí)別能力。如果不能排除交叉反應(yīng)性,應(yīng)基于含有潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的蛋白的表達(dá)模式以及TCR與潛在交叉反應(yīng)性抗原肽的親和力來(lái)進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應(yīng)性的信息,應(yīng)進(jìn)行充分的HLA交叉反應(yīng)性篩選。種子基因脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。杭州off-target脫靶檢測(cè)企業(yè)
高深度全基因組重測(cè)序服務(wù),該方法能多方位精細(xì)地對(duì)基因編輯的細(xì)胞或個(gè)體進(jìn)行off-target檢測(cè)。寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)CRO
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問(wèn)題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會(huì)將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問(wèn)題的話,在市場(chǎng)化道路上就會(huì)受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對(duì)整個(gè)行業(yè)都會(huì)產(chǎn)生致命打擊。具體說(shuō)來(lái),基因zhiliao的安全性問(wèn)題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。”寧波crispr/cas9脫靶檢測(cè)CRO