什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢?跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看,當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到,去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時(shí),盡可能提供足量的細(xì)胞,以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低,一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿(mǎn)足需求,特殊樣本可詳細(xì)咨詢(xún)烈冰生物。此...
對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(lèi)(cell cluster)為討論對(duì)象,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,但是單細(xì)胞測(cè)序,特別是目的為圖譜研究時(shí),需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),盡可能的構(gòu)建某一疾病類(lèi)型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準(zhǔn)確性。此外,烈冰...
烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),可平行分析成千上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞內(nèi)數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)水平,單細(xì)胞RNA-seq正在改變我們對(duì)細(xì)胞的理解。而烈冰作為多平臺(tái)的技術(shù)服務(wù)提供商,基于BD 在生物學(xué)領(lǐng)域40年的專(zhuān)業(yè)技術(shù),滿(mǎn)足您的實(shí)驗(yàn)需求,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。BD單細(xì)胞測(cè)序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性,如微陣列和大量細(xì)胞RNA-seq,這些技術(shù)檢測(cè)通過(guò)實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,依賴(lài)于對(duì)多個(gè)細(xì)胞的平行檢測(cè)。用戶(hù)可以鑒定和表征新型和罕見(jiàn)細(xì)胞類(lèi)型,其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到疾病發(fā)展的多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過(guò)程。個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,滿(mǎn)足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求。湖北BD VD...
Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無(wú)法普及。所以,正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)...
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因...
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類(lèi)型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類(lèi)型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過(guò)1W,這就導(dǎo)致該類(lèi)樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開(kāi)花,烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序公司Single Cell...
BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界。濟(jì)南BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過(guò)簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類(lèi)型的二代測(cè)序(NGS)文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。烈冰生物全國(guó)五大實(shí)驗(yàn)中心,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺(tái),助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)場(chǎng)”。合肥scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)...
您的珍貴樣本,可以放心依賴(lài)烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),基于BD平臺(tái)從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺(tái)對(duì)實(shí)驗(yàn)過(guò)程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù)、生物學(xué)、實(shí)驗(yàn)中心和用戶(hù)之間的樣本檢測(cè)獲得一致、可靠的結(jié)果,而磁珠的拆分使用和即時(shí)存儲(chǔ),可增加實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測(cè),到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過(guò)程,均實(shí)現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,讓您的每個(gè)樣本在實(shí)驗(yàn)端全程無(wú)憂。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程BD單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)。湖州BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序...
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類(lèi)型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱(chēng)助力高效鑒定細(xì)胞類(lèi)型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶(hù)實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程...
烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái),目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù),BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板,1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本(不混樣的情況下),每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間,而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率,此外,單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類(lèi)型,有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類(lèi)型樣本研究;細(xì)胞可適性高,對(duì)細(xì)胞大小(直徑超過(guò)40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核)及類(lèi)型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離,且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過(guò)程全程可視化進(jìn)行,保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行,1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到...
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問(wèn)題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí),如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性5%、結(jié)團(tuán)率均>5%)的情況下,引入的背景信號(hào)會(huì)增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無(wú)法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無(wú)法有效區(qū)分時(shí),會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí),多細(xì)胞率會(huì)增加,數(shù)據(jù)分析時(shí),此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢...
對(duì)于稀有樣本,或細(xì)胞量比較少的稀有組織,樣本中每一粒細(xì)胞都很珍貴,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)該種類(lèi)型的樣本能實(shí)現(xiàn)友好包容,如果在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢?lèi)型和制備單細(xì)胞懸液方法的不同,容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。也會(huì)和您探討是否考慮去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物的操作,以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)?,死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái)。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí),對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作),以保證較高的...
作為單細(xì)胞測(cè)序的又一個(gè)重要里程碑,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件,能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測(cè)序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類(lèi)型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。對(duì)于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細(xì)胞的項(xiàng)目,推薦您使用烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)您的珍貴樣本,可以放心依賴(lài)烈冰生物B...
您的珍貴樣本,還可以放心依賴(lài)烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000,至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞,即可滿(mǎn)足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類(lèi)似于上樣細(xì)胞的無(wú)限稀釋過(guò)程,但22萬(wàn)+微孔的存在,也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲(單個(gè)微孔板),滿(mǎn)足您的多重需求。烈冰單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序助您探究細(xì)胞類(lèi)型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。...
BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。廣東BD VDJ單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞獲得困難,不同組織要...
單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶(hù)也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動(dòng)圖先人一步:?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類(lèi)情況。搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái),5...
作為單細(xì)胞測(cè)序的又一個(gè)重要里程碑,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀器、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件,能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測(cè)序和分析,獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類(lèi)型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。BD Scanner,是您實(shí)驗(yàn)過(guò)程的又一雙眼睛,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),精細(xì)質(zhì)控。天津BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(Single Cell Sequenci...
基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說(shuō)單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來(lái)樣本的真實(shí)視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)以來(lái),能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細(xì)胞多組學(xué)簡(jiǎn)化了您需要開(kāi)展的實(shí)驗(yàn),也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過(guò)計(jì)算來(lái)推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰生物作為BD 中國(guó)聯(lián)合成立單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)室,為推動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展貢獻(xiàn)中國(guó)力...
BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文!烈冰BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。廣州single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序針對(duì)單細(xì)胞測(cè)...
烈冰與國(guó)內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開(kāi)展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),1000+客戶(hù)和5000+重要科研項(xiàng)目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),在單細(xì)胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶(hù)發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。對(duì)于消化背景雜,樣本初始...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過(guò)簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類(lèi)型的二代測(cè)序(NGS)文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。廈門(mén)BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)...
烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程: 對(duì)于不同用戶(hù)和實(shí)驗(yàn),單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(tái)(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇。此外,我們具備BD Rhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試,幫助用戶(hù)制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),完成測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信...
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶(hù)量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專(zhuān)業(yè)的生信代碼交給專(zhuān)業(yè)的烈冰,專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)意義交給專(zhuān)業(yè)的您!個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,滿(mǎn)足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求。上海scRNA單細(xì)胞平臺(tái)針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因...
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶(hù)量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專(zhuān)業(yè)的生信代碼交給專(zhuān)業(yè)的烈冰,專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)意義交給專(zhuān)業(yè)的您,詳情請(qǐng)咨詢(xún)烈冰生物。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無(wú)憂服務(wù)。江蘇BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰生物搭建近10臺(tái)BD...
關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類(lèi)型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō),細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類(lèi)型而變化。每種組織類(lèi)型都是獨(dú)特的,因此,必須在開(kāi)始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈...
對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(lèi)(cell cluster)為討論對(duì)象,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,但是單細(xì)胞測(cè)序,特別是目的為圖譜研究時(shí),需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),盡可能的構(gòu)建某一疾病類(lèi)型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準(zhǔn)確性。烈冰實(shí)驗(yàn)室...
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類(lèi)細(xì)胞的不同性質(zhì),因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文!烈冰BD單細(xì)...
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶(hù)量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專(zhuān)業(yè)的生信代碼交給專(zhuān)業(yè)的烈冰,專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)意義交給專(zhuān)業(yè)的您,詳情請(qǐng)咨詢(xún)烈冰生物。BD Scanner,是您實(shí)驗(yàn)過(guò)程的又一雙眼睛,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),精細(xì)質(zhì)控。重慶BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序針對(duì)BD ...
您的珍貴樣本,還可以放心依賴(lài)烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000,至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞,即可滿(mǎn)足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類(lèi)似于上樣細(xì)胞的無(wú)限稀釋過(guò)程,但22萬(wàn)+微孔的存在,也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲(單個(gè)微孔板),滿(mǎn)足您的多重需求。截至2022年6月,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章30+篇。烈冰生...