目前對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進行全基因組測定,分析其進化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測序儀進行病毒全基因組測定.對獲得的基因組數(shù)據(jù)進行序列拼接、比對、進化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點分析.結(jié)果通過...

二代測序技術(shù)的出現(xiàn)對社會帶來了重大的影響，主要體現(xiàn)在以下幾個方面：1.促進科學研究進步：二代測序技術(shù)的高通量性能使得基因組學與生物學研究能夠更加深入。它加快了基因功能解析、基因變異檢測和系統(tǒng)生物學研究等方面的進展。這為生物醫(yī)學、農(nóng)業(yè)科學、環(huán)境科學等領(lǐng)域提供了更...

哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序？在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因...

病毒基因組測序的標準有：測序的完成程度，決定著基因組的下游應(yīng)用，包括設(shè)計診斷產(chǎn)品、反向遺傳系統(tǒng)以及開發(fā)調(diào)整對策等。研究團隊希望能夠通過五條標準來填補這樣的空白，這些標準涵蓋了完成病毒基因組的整個階段，使用不依賴測序技術(shù)的簡單條件規(guī)定了五個類別。不同...

病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序三個層面，通過二代/三代測序平臺，獲得病毒的基因組的序列信息，并在結(jié)構(gòu)基因組學、比較基因組學層面通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進化與演變歷程等。對疑似傳染標...

二代測序是一種高通量測序技術(shù)，也被稱為次代測序或高通量測序。與傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)相比，二代測序具有更快、更經(jīng)濟和更高效的特點。在二代測序中，DNA樣本首先被打斷成短片段。接下來，這些片段會通過特殊的方法進行擴增和連接，形成了所謂的文庫（li...

高通量測序技術(shù)又稱“下一代“測序技術(shù)或深度測序技術(shù)，可以一次性對幾十萬至幾百萬條DNA分子進行序列測定。現(xiàn)已普遍應(yīng)用在基因組測序、基因表達分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉(zhuǎn)錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關(guān)的研究領(lǐng)域。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次性的改變，一...

近年來，新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢，人類想要征服新發(fā)人畜共患病，就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原，并針對新病原進行基因組分析、流行病學調(diào)查、致病機制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學是在宏基因組學基礎(chǔ)上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù)，該技術(shù)結(jié)...

傳統(tǒng)上，人類血液被認為是無菌的。微生物血漿細胞游離DNA（mcfDNA）可能有兩種來源，包括微生物（細菌，病毒或噬菌體）的易位，這是指屬于人類微生物組的微生物細胞或其組成部分通過與外部環(huán)境連通的上皮粘膜進入循環(huán)系統(tǒng)。另外，當組織粘膜被局部傳染（例如口腔，肺和皮...

病原微生物二代測序也稱宏基因組測序（mNGS）是目前臨床上針對病原較常用的基因測序方法。通過對疑似傳染標本采集提取后（無需培養(yǎng)）直接進行高通量測序，利用病原微生物數(shù)據(jù)庫比對和分析后可以獲得疑似致病微生物種屬信息?；贜GS的宏基因組學檢測技術(shù)在2014年被用于...

目前技術(shù)的進一步成熟，未來二代測序病原體檢測應(yīng)進一步在成本下降、診斷標準完善、質(zhì)量控制提升等方面進行完善。同時應(yīng)進一步增加大樣本量的研究，以建立中國傳染病原體宏基因組學檢測的標準規(guī)范。對于懷疑神經(jīng)系統(tǒng)急性傳染的患者，如有條件，推薦在抽取腦脊液時同步留取2mL腦...

病毒宏基因組測序可直接對樣本中的核酸進行高通量測序，鑒定樣本中可能存在的病原菌，輔助臨床決策。覆蓋細菌、病毒、寄生蟲、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物；同時進行耐藥基因檢測，涵蓋266種耐藥菌，2984種抗性基因。宏基因組測序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中...

未知病原鑒定測序：未知病原鑒定測序?qū)嶒灮诙鷾y序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務(wù)。...

微生物鑒定能用微生物對噬菌體的敏感性作為指標來鑒定微生物的種屬。因為各種噬菌體都有其嚴格的宿主范圍，不同的細菌作為噬菌體的宿主對應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體，其和噬菌體的作用方式也有接合，轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)接，溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細菌可以采用血清學反應(yīng)...

實現(xiàn)病原微生物種類鑒定有哪些技術(shù)手段？病原微生物的研究歷史不算長。發(fā)展至今已經(jīng)有了成套的檢測體系。利用不同類別的微生物有其本身不同于其他微生物的特點，如從培養(yǎng)形態(tài)、顯微鏡觀測形態(tài)、生物學功能、致病性、生物化學反應(yīng)、抗原抗體反應(yīng)、核酸序列等方面，都可以進行相當程...

微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用，但存在兩大缺點。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體，而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物，它們常常能揭示通過傳統(tǒng)方法檢測不到的有機體之間的細微差別。PCR，包括實時熒光...

病毒是地球上數(shù)量多的生物實體，其中細菌病毒(即噬菌體)約有1031個類群，從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類生態(tài)系統(tǒng)的重要成員，人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體，包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,dsDNA)，...

未知病原微生物鑒定：除了利用病毒的致病性定量檢測病毒外，還可應(yīng)用物理方法，如在電子顯微鏡下計數(shù)病毒顆粒，或用紫外分光光度計測定提純病毒的蛋白和核酸量，這些方法所測得的數(shù)據(jù)包括了的病毒粒。植物病毒的培養(yǎng)和檢測大都是在整株植物上進行的醫(yī)學教育|網(wǎng)搜集整理。從搗碎的...

病毒鑒定常用方法有哪些？病原學檢測主要適用于急性期血液標本，一般認為發(fā)病7天內(nèi)檢測陽性率高。（1）核酸檢測：采用熒光定量RT-PCR方法，是目前早期診斷寨卡病毒病的主要檢測手段。（2）病毒分離：將標本接種于蚊源細胞（C6/36）或哺乳動物細胞（BHK21、Ve...

微生物檢測的相關(guān)知識：在保藏厭氧菌種或研究微生物的動力時常采用此法。做穿刺接種時，用的接種工具是接種針。用的培養(yǎng)基一般是半固體培養(yǎng)基。它的做法是：用接種針蘸取少量的菌種，沿半固體培養(yǎng)基中心向管底作直線穿刺，如某細菌具有鞭毛而能運動，則在穿刺線周圍能夠生長。澆混...

未知病原鑒定方法：免疫學方法：包括免疫熒光、酶聯(lián)免疫吸附試驗等技術(shù)，通過檢測患者體液中的病原體特異性抗體或抗原，來鑒定病原體。免疫學方法具有高度的特異性和敏感性，常用于病原體的初篩和鑒定。生物芯片技術(shù)：生物芯片是一種高通量檢測技術(shù)，可以同時檢測多個病原體，快速...

病原微生物檢測方法-多種PCR結(jié)合使用，基因芯片技術(shù)與多重PCR結(jié)合可以通過PCR對目的基因進行放大，通過基因芯片的熒光探針增加檢測的靈敏性和特異性，使得兩種檢測技術(shù)的優(yōu)勢互補，已應(yīng)用于病原微生物的檢測。將病原體特異性基因作為靶基因設(shè)計出引物與探針，進行多重P...

未知病原鑒定測序?qū)嶒灮诙鷾y序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)...

鑒定未知病原體的技術(shù)有哪些？快速測試片是指以紙片、紙膜、膠片等作為培養(yǎng)基載體，將特定的培養(yǎng)基和顯色物質(zhì)附著在上面，通過微生物在上面的生長、顯色來測定食品中微生物的方法。細菌總數(shù)檢測紙片的研制始于20世紀80年代，其主要優(yōu)點是簡便、實用、經(jīng)濟、操作性強。近年來以...

微生物鑒定方法：1.從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個細胞的形態(tài)，比如說，是球菌，還是桿菌，還是弧菌，還是螺旋菌，這都是可以從微生物的單個細胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細胞的形態(tài)，比如說是否有鞭毛、芽孢之類的東西，都是微生物鑒別的特征性特征。2.就是觀察細菌...

臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過程：1.分離培養(yǎng)：臨床細菌學不可缺少的基本技術(shù)，是獲得純培養(yǎng)物的必要手段，即使自動化儀器先進的現(xiàn)在也只能對純菌作出鑒定。2.細菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學鑒定：如奴卡菌、紅球菌。4.動力在各種細菌鑒定：針對...

微生物的相關(guān)知識：微生物因為體積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強、繁殖能力強等特點，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染，不只影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴重的是它危及消費者的健康和安全。微生物檢測的檢測項目：...

未知病原鑒定測序：未知病原鑒定測序?qū)嶒灮诙鷾y序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務(wù)。...

臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過程：1.分離培養(yǎng)：臨床細菌學不可缺少的基本技術(shù)，是獲得純培養(yǎng)物的必要手段，即使自動化儀器先進的現(xiàn)在也只能對純菌作出鑒定。2.細菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學鑒定：如奴卡菌、紅球菌。4.動力在各種細菌鑒定：針對...

病原微生物檢測方法中的多種PCR結(jié)合使用，基因芯片技術(shù)與多重PCR結(jié)合可以通過PCR對目的基因進行放大，通過基因芯片的熒光探針增加檢測的靈敏性和特異性，使得兩種檢測技術(shù)的優(yōu)勢互補，已應(yīng)用于病原微生物的檢測。將病原體特異性基因作為靶基因設(shè)計出引物與探針，進行多重...