武漢農學靶向代謝組學技術服務

GC-MS非靶向與代謝組學的關系？代謝組學是運用多種技術手段，研究生物體系中小分子代謝物（包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質等）的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學，是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統(tǒng)全方面的分析平臺。氣相色譜-質譜聯(lián)用(GC-MS)技術因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好，擁有大量標準質譜圖數(shù)據(jù)庫的特點，被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學和分析技術的發(fā)展，運用GC-MS非靶向代謝組學研究疾病機制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點的方法日趨成熟，其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。代謝組學 （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學研究的必然。武漢農學靶向代謝組學技術服務

LC-MS非靶向代謝組學：LCMS非靶向是通過液質聯(lián)用（LC–MS）方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產物的動態(tài)變化，從中找出表達差異的代謝物，進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產物，具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜（UPLC）通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力，實現(xiàn)了更好的分離，具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度；串聯(lián)質譜儀在MS掃描模式下，可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換，同時采集代謝物的一二級質譜信息，結合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質譜信息的解析，在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。武漢農學靶向代謝組學技術服務代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。

代謝組學需要多少的生物學重復？生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學重復少可能會放大組內差異對于整體差異的影響，進而影響結果（如準確和足夠多的找出生物標志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學重復來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。

代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么？根據(jù)不同的檢測要求，需要配合不同的樣本量和樣本采集方法，常規(guī)的方法和單個樣本量如下：(1) 微生物和細胞樣本：細胞迅速猝滅細胞并冷凍保存；單個樣本細胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液（如尿、血、組織、唾液）：采樣后要迅速預處理，如加入抗凝血劑、防腐劑，并立即冷凍處理（-80 ℃）；單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本：采集后迅速冷凍（液氮），然后轉入-80℃保存，單個樣本要求質量為50mg。代謝組學與臨床化學較為相似。

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數(shù)據(jù)？實驗設計先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質量數(shù)據(jù)，有以下幾個方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此，一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備，以減少人為的誤差。2）檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前，先進行質控樣檢測，確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本（每個樣品取少量后混合），在后期數(shù)據(jù)處理時，使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進行矯正。代謝組學的發(fā)展很迅速。哈爾濱靶向代謝組學定量分析

代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現(xiàn)的新興“組學”。武漢農學靶向代謝組學技術服務

代謝組學究竟是一門什么樣的研究方向？首先定義什么是代謝組學。簡單的說就是研究生物體對內外刺激的整體代謝應答規(guī)律。那么為什么代謝組學是基因組，轉錄組，蛋白質組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向，的執(zhí)行者蛋白質中很多酶參與了體內的代謝過程?；驕y序數(shù)量太大，而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調控和生物學事件之間隔了一個很漫長的信號轉導過程。蛋白同理，一是蛋白種類巨大，二是蛋白組學發(fā)展進入瓶頸；發(fā)展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種，建立它的差異分析更加簡單，同時在價格等方面更有推廣的意義。武漢農學靶向代謝組學技術服務

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