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常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類:非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù):Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù):這種技術(shù)采用多個(gè)(2-10)穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán)進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,能夠同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量,可用于研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)。哈爾濱定量乙?;鞍踪|(zhì)組學(xué)價(jià)錢
iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組介紹:iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記,利用標(biāo)記試劑中的二級(jí)報(bào)告離子來對(duì)蛋白進(jìn)行精確鑒定和定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、適用范圍廣:可檢測(cè)到的蛋白除了胞漿蛋白外,還有線粒體蛋白、膜蛋白。也能對(duì)任何類型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定,包括高分子量,酸性,堿性蛋白質(zhì);2、高通量:一次可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的定性定量分析,特別適用于采用多種處理方式或來自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。廣東常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)項(xiàng)目蛋白質(zhì)組隨著基因組學(xué)研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點(diǎn)。
蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據(jù)庫的建立。現(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本體聯(lián)合會(huì)(Gene Onotology Consortium)所建立的數(shù)據(jù)庫。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能、生物學(xué)途徑、細(xì)胞組分而給予定義,無物種相關(guān)性。是系統(tǒng)分析基因功能,它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來,旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學(xué)藍(lán)圖。旨在借助計(jì)算機(jī)全方面地展示細(xì)胞和生物所包含的生物學(xué)信息;根據(jù)基因組中的信息,用計(jì)算機(jī)計(jì)算或者預(yù)測(cè)出比較復(fù)雜的細(xì)胞中的通路或者生物的復(fù)雜行為。
蛋白質(zhì)組學(xué)(英語:proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ),是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動(dòng)的執(zhí)行者,亦是基因功能活動(dòng)的之后的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識(shí)別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式,是對(duì)基因組研究的重要補(bǔ)充,是對(duì)生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動(dòng)態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律,為疾病的診斷、疫苗及新藥開發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。蛋白質(zhì)組學(xué)由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。
4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) :目前,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強(qiáng)度(intensity)這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來。蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略:蛋白質(zhì)組學(xué)分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達(dá)情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等。基于不同的分析內(nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)和分析策略。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。濟(jì)南定量蛋白組學(xué)
質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言,擁有靈敏、準(zhǔn)確、高通量、自動(dòng)化等特點(diǎn)。哈爾濱定量乙酰化蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)錢
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時(shí)其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時(shí),通常需要將被檢測(cè)蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段,因此也無法保證檢測(cè)到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進(jìn)步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術(shù)可以直接對(duì)完整的蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)序,包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。哈爾濱定量乙?;鞍踪|(zhì)組學(xué)價(jià)錢