武漢定量蛋白組學(xué)價(jià)格

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-22

蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學(xué)分析?目前一般文獻(xiàn)中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質(zhì)功能分析(GO分類為主)、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)等方面。其它一些比較特異的高級(jí)分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預(yù)測(cè)分析、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(labelfree)定量策略,標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動(dòng)態(tài)變化對(duì)各種生命過(guò)程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和鑒定。對(duì)人類而言,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究要服務(wù)于人類的健康,主要指促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。武漢定量蛋白組學(xué)價(jià)格

蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略:蛋白質(zhì)組學(xué)研究主要分為自底向上(Bottom-Up),自頂向下(Top-Down)和自中向下(Middle-Down)三種策略。“自底向上”策略是指通過(guò)分析由蛋白質(zhì)酶解生成的肽段來(lái)鑒定蛋白質(zhì)。當(dāng)應(yīng)用該策略來(lái)分析蛋白質(zhì)組混合物時(shí),因其類似于基因組測(cè)序的鳥管法,所以又被稱為鳥管法蛋白質(zhì)組學(xué)(Shotgun Proteomics),該策略依賴于蛋白酶的酶切。“自中向下”策略也依賴于蛋白酶的酶切,但是由于采用了另外的酶,比如OmpT,只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg),因此酶切之后的分子量較大,更利于后續(xù)的蛋白組裝環(huán)節(jié)。武漢定量蛋白組學(xué)價(jià)格我們通過(guò)研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、預(yù)后評(píng)估信息。

蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容:1.蛋白質(zhì)鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合相關(guān)技術(shù),利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究。2.翻譯后修飾:很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式,因此對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對(duì)闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。3.蛋白質(zhì)功能確定:如分析酶活性和確定酶底物,細(xì)胞因子的生物分析/配基-受體結(jié)合分析。可以利用基因敲除和反義技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來(lái)后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。有的熒光蛋白表達(dá)系統(tǒng)就是研究蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)定位的一個(gè)很好的工具。

蛋白質(zhì)組學(xué)與基因組學(xué)的差異:蛋白質(zhì)組和基因組(genome)在概念上有相關(guān)性,某一個(gè)蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由其基因組所編碼的,然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對(duì)象和研究方法上有很大的區(qū)別。基因組在所有的細(xì)胞中幾乎都是完整的,與之不同,蛋白質(zhì)組具有很高的細(xì)胞和組織特異性,不同的細(xì)胞組織表達(dá)不同的蛋白質(zhì)組。蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于基因組,這是因?yàn)橐粋€(gè)基因≠一個(gè)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個(gè)蛋白質(zhì)。比如據(jù)估計(jì)人的基因組由30000個(gè)基因組成,經(jīng)mRNA剪切和蛋白質(zhì)翻譯后修飾將產(chǎn)生20萬(wàn)~200萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)。由于不同的轉(zhuǎn)錄起始和mRNA剪切使同一基因產(chǎn)生了不同的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。同樣由于不同的翻譯起始,一個(gè)mRNA可以翻譯成不同的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等。

蛋白質(zhì)組學(xué)植物篇樣品寄樣要求:植物相較于動(dòng)物,蛋白占比不高,所以送樣在量上面的要求會(huì)多一些,推薦送500mg以上的量可以確保實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蛱崛〉匠渥愕牡鞍?。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的,200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈,去除掉多余的組織。盡量能夠保證樣本的形態(tài)和純度,不推薦用錫紙包裹,放在EP管中使其形態(tài)完整為比較好。用液氮急速冷凍5min后置于-80℃環(huán)境中保存,送樣時(shí)需要添加干冰。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對(duì)象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍。山東高通量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)和非標(biāo)記(label free)定量策略。武漢定量蛋白組學(xué)價(jià)格

蛋白質(zhì)組學(xué)基礎(chǔ)研究方面:近兩年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,如細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對(duì)象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍,涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來(lái)的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡?。?yīng)用研究方面:蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對(duì)早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,目前國(guó)際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。武漢定量蛋白組學(xué)價(jià)格