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代謝組學樣本收集注意事項:(1)血液離開動物或人體后,應盡快開展血清、血漿的分離,并嚴格按照操作說明進行。(2)采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體,如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色,說明在已經(jīng)發(fā)生了了溶血現(xiàn)象,樣本需重新制備。(3)血清與血漿的主要區(qū)別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質,氨基酸,核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集:1.人糞便:(1)用無菌勺挖取新鮮的,排泄中后部的內側糞便(避免尿液及其他壁對樣本污染);(2)分裝樣本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.(4)-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。代謝組學 (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學研究的必然。湖北LC-MS/MS非靶向代謝組學定性分析
代謝組學細胞樣本收集:懸浮細胞:1)連同培養(yǎng)基轉移到1.5 mL的進口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細胞沉淀于離心管的底部(1*107個細胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預冷的PBS反復沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項:1. 培養(yǎng)基傾倒時盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細胞時,請小心避免離心管破碎導致樣本受損;4. 建議細胞樣本在進行培養(yǎng)時多準備樣本,以備后續(xù)使用。上海LC-MS/MS非靶向脂質組學分析研究代謝組學有哪些特點?
代謝組學概念:代謝組學(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想,對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式,是系統(tǒng)生物學的組成部分。其研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。先進分析檢測技術結合模式識別和**系統(tǒng)等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發(fā)展起來的一門學科,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。
LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質聯(lián)用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產物的動態(tài)變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質譜儀在MS掃描模式下,可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質譜信息,結合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。代謝組學主要研究的是產物的小分子代謝物(MW<1000)。
代謝組學樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。深圳LC-MS/MS非靶向脂質組學分析方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。湖北LC-MS/MS非靶向代謝組學定性分析
GC-MS非靶向與代謝組學的關系?代謝組學是運用多種技術手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質等)的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統(tǒng)全方面的分析平臺。氣相色譜-質譜聯(lián)用(GC-MS)技術因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標準質譜圖數(shù)據(jù)庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學和分析技術的發(fā)展,運用GC-MS非靶向代謝組學研究疾病機制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。湖北LC-MS/MS非靶向代謝組學定性分析