廣東定量蛋白組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：1.蛋白質(zhì)鑒定：能夠應(yīng)用一維電泳和二維電泳并分離相關(guān)的技術(shù)，應(yīng)用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式，因而對蛋白質(zhì)后修飾的研討對說明蛋白質(zhì)的功用具有重要作用。3、蛋白質(zhì)功用：如剖析酶活性和酶底物，細(xì)胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析。能夠應(yīng)用基因敲除和反義技術(shù)剖析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功用。另外對蛋白質(zhì)表達(dá)出來后在細(xì)胞內(nèi)的定位研討也在水平上有助于蛋白質(zhì)功用的理解。目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。廣東定量蛋白組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué)基礎(chǔ)研究方面：近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，如細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?yīng)用研究方面：蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景，目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。北京醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng)，也是一個(gè)整體的概念。

常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)：Labelfree多肽組學(xué)：顧名思義，就是不使用任何標(biāo)記方法，直接對肽段進(jìn)行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實(shí)驗(yàn)流程簡單，只需要對蛋白進(jìn)行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機(jī)。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計(jì)數(shù)（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質(zhì)譜采集時(shí)只選取topN的母離子進(jìn)行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)：TMT全稱是TandemMassTag，是經(jīng)典化學(xué)標(biāo)記試劑，普遍用于差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術(shù)采用6重、10重或16重同位素標(biāo)簽，與肽段的氨基發(fā)生共價(jià)結(jié)合反應(yīng)，可實(shí)現(xiàn)同時(shí)對6個(gè)/10個(gè)/16個(gè)不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。（目前16標(biāo)鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù)）。

蛋白質(zhì)組學(xué)：對人類而言，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康，主要指促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質(zhì)，而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預(yù)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和疾病機(jī)理研究中，了解人不同發(fā)育、生長期和不同生理、病理?xiàng)l件下及不同細(xì)胞類型的基因表達(dá)的特點(diǎn)具有特別重要的意義。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關(guān)的分子，進(jìn)一步為設(shè)計(jì)作用于特定靶分子的藥物奠定基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析，依賴于數(shù)據(jù)庫的建立。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：電噴霧質(zhì)譜：ESI-MS是利用高電場使質(zhì)譜進(jìn)樣端的毛細(xì)管柱流出的液滴帶電，在N2氣流的作用下，液滴溶劑蒸發(fā)，表面積縮小，表面電荷密度不斷增加，直至產(chǎn)生的庫侖力與液滴表面張力達(dá)到雷利極限，液滴爆裂為帶電的子液滴，這一過程不斷重復(fù)使液滴非常細(xì)小呈噴霧狀，這時(shí)液滴表面的電場非常強(qiáng)大，使分析物離子化并以帶單電荷或多電荷的離子形式進(jìn)入質(zhì)量分析器。ESI-MS從液相中產(chǎn)生離子，一般說來，肽段的混合物經(jīng)過液相色譜分離后，經(jīng)過偶聯(lián)的與在線連接的離子阱質(zhì)譜分析，給出肽片段的精確的氨基酸序列,但是分析時(shí)間一般較長。目前，許多實(shí)驗(yàn)室兩種質(zhì)譜方法連用，獲得有意義的蛋白質(zhì)的肽段序列，設(shè)計(jì)探針或引物來獲得有意義的基因。隨著蛋白質(zhì)組研究的深入，又有多種新型質(zhì)譜儀出現(xiàn)，主要是在上述質(zhì)譜儀的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)與重新組合。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有電噴霧質(zhì)譜。廣州外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)

蛋白質(zhì)組研究是為了識別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式。廣東定量蛋白組學(xué)分析研究

DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：采集所有離子及碎片圖譜，重現(xiàn)性好。基于碎片離子定量，選擇性好，可媲美 SPM/MRM。循環(huán)時(shí)間固定，掃描點(diǎn)數(shù)均勻，定量準(zhǔn)確度高。高通量，能同時(shí)監(jiān)測所有目標(biāo)蛋白。PRM 靶向定量蛋白組：平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）是一種靶向檢測方法，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白、目標(biāo)肽段進(jìn)行選擇性檢測，從而實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)蛋白/肽段進(jìn)行相對定量。技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：不依賴抗體；特異性；結(jié)果準(zhǔn)確、可靠；高通量。修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：利用 LC-MS/MS 結(jié)合數(shù)據(jù)庫檢索的方法，在搜庫時(shí)設(shè)置修飾搜庫參數(shù)，實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)所有已知的修飾位點(diǎn)磷酸化、乙?；⑻腔头核鼗M(jìn)行鑒定。廣東定量蛋白組學(xué)分析研究