湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

來源: 發(fā)布時(shí)間:2025-09-01

且研究表明HNRNPC通過m6A與RNA結(jié)合調(diào)控目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學(xué)功能越來越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮重要的生物功能。例如,在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴METTL3的pri-miRNA甲基化,會(huì)促進(jìn)DGCR8識(shí)別和加工,從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外,m6A識(shí)別蛋白HNRNPA2B1促進(jìn)pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用,其調(diào)控機(jī)制的異常可能與人類疾病或相關(guān)。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會(huì)影響精子發(fā)育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發(fā)育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng)(METTL3,F(xiàn)TO)、生成(YTHDF2)或轉(zhuǎn)移(METTL14)、干細(xì)胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節(jié)律、細(xì)胞發(fā)育分化、細(xì)胞分裂及其它的一些生命過程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點(diǎn)是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細(xì)胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細(xì)胞中,METTL3的敲除嚴(yán)重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生。純干貨Western blot (WB)條帶灰度統(tǒng)計(jì)與GraphPad作圖.湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室,科研技術(shù)服務(wù)

科手術(shù)設(shè)備|細(xì)胞/組織支持系統(tǒng)|膜片鉗|輔助設(shè)備|其它常用耗材燒杯|漏斗|量筒|廣口罐|研缽和研杵|手套|移液管|移液器(Pipette)單道手動(dòng)移液器|單道電動(dòng)移液器|多道手動(dòng)移液器多道電動(dòng)移液器|正置換移液器|瓶口分液器吸頭(Tips)濾芯吸頭(滅菌)|濾芯吸頭(未滅菌)|普通吸頭(滅菌)普通吸頭(未滅菌)|多道移液器吸頭液體工作站吸頭|其它瓶(Bottle)離心瓶|稱量瓶|存儲(chǔ)瓶|比重瓶|血清瓶|滴瓶吸氣瓶|細(xì)胞培養(yǎng)瓶|培養(yǎng)基瓶|其它瓶(Flask)藍(lán)蓋瓶|燒瓶|平底燒瓶|克氏(長(zhǎng)頸)燒瓶|碘測(cè)定燒瓶|蒸餾燒瓶|容量瓶|過濾瓶|其它管(Tube&Vial)離心管|微離心管|樣品儲(chǔ)存管|凍存管|反應(yīng)管聚乙烯保存管|細(xì)胞培養(yǎng)管|自動(dòng)上樣管|其它PCR耗材PCR管|PCR條板|PCR板|實(shí)時(shí)定量PCR毛細(xì)管其它微孔板微孔板(96孔)|微孔板(384孔)|微孔板。黑龍江疾病模型科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買維持細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境的穩(wěn)定。細(xì)胞質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)的液體,其中包含了各種細(xì)胞器和細(xì)胞骨架等結(jié)構(gòu)。

湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室,科研技術(shù)服務(wù)

m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析(圖3)。

外泌體生物發(fā)生和神經(jīng)元細(xì)胞中分泌小泡的調(diào)節(jié)之間的交集為外泌體和神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機(jī)制之間假定的聯(lián)提供了新的見解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比,外泌體中的研究進(jìn)展迅速,而且外泌體與的幾個(gè)主要特征有關(guān)。外泌體影響、生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進(jìn)展中的作用可能是動(dòng)態(tài)的,并且與的類型、遺傳學(xué)和分期有關(guān)。外泌體的應(yīng)用外泌體用于免疫基于免疫細(xì)胞來源的外泌體能夠介導(dǎo)和調(diào)節(jié)機(jī)體對(duì)的免疫反應(yīng),外泌體在免疫方面的潛力受到關(guān)注。其中樹枝狀細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體包含大量的MHC-多肽復(fù)合物和免疫刺激相關(guān)的分子,能夠相關(guān)的T細(xì)胞,介導(dǎo)體內(nèi)抗應(yīng)答,在多個(gè)臨床試驗(yàn)中表現(xiàn)出良好的抗療效。有研究者考察了樹枝狀細(xì)胞外泌體對(duì)非小細(xì)胞肺患者的療效。結(jié)果表明,患者對(duì)樹枝狀細(xì)胞外泌體耐受性良好,1/3患者表現(xiàn)出了對(duì)樹枝狀細(xì)胞外泌體的T細(xì)胞響應(yīng),2/4患者自然殺傷細(xì)胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹突狀細(xì)胞外泌體免疫轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的臨床一期試驗(yàn)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)自體樹突狀細(xì)胞外泌體無明顯毒性,并且具有刺激自然殺傷細(xì)胞的能力。以上臨床試驗(yàn)證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性,為進(jìn)一步臨床研究奠定了基礎(chǔ)。動(dòng)物疾病模型:為人類健康保駕護(hù)航。

湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室,科研技術(shù)服務(wù)

圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測(cè)到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè),發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較,也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進(jìn)一步通過這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容;對(duì)于這一技術(shù)。進(jìn)行免疫沉淀法時(shí),抗體需要和一個(gè)受質(zhì)結(jié)合。浙江疾病模型科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買

細(xì)胞器是細(xì)胞內(nèi)的各種功能結(jié)構(gòu),如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等,它們各自承擔(dān)著不同的生理功能。湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室